DeepOmicsAE היא זרימת עבודה המתמקדת ביישום שיטת למידה עמוקה (כלומר, מקודד אוטומטי) כדי להפחית את המימדיות של נתוני multi-omics, מתן בסיס למודלים חיזוי ומודולי איתות המייצגים שכבות מרובות של נתוני omics.