此协议旨在可视化 多聚 体细胞中的异色素聚合物。
通过免疫染色来可视化异色素聚合物可能具有挑战性。许多哺乳动物的染色质成分在 果蝇黑色素加斯特保存。 因此,研究异色素的形成和维护是一个很好的模型。 聚合细胞,如在第三星 D.黑色素幼 虫的唾液腺中发现的细胞,提供了观察血红素放大近千次的绝佳工具,并使研究人员能够研究异色素在细胞核中分布的变化。虽然异色素成分的观察可以直接在多极染色体制剂中进行,但某些蛋白质的定位可以通过治疗的严重程度来改变。因此,细胞中异色素的直接可视化补充了这种类型的研究。在此协议中,我们描述了用于此组织的免疫染色技术、使用二次荧光抗体和连续显微镜以更精确和更精细的方式观察这些异色素聚合物。
自早期研究Emil Heitz1以来,异色素一直被认为是细胞过程的重要调节器,如基因表达、染色体的美色和间质分离,以及维持基因组稳定性2、3、4。
异色素主要分为两种类型:具有特征定义重复序列的构成异色素,以及存在于特定染色体位点(如端粒和中位体)中的可转换元素。这种类型的异色素主要通过特定的平生标记,如赖氨酸9的地基或三甲基化的希石H3(H3K9me3)和异色素蛋白1a(HP1a)5,6的结合来表观遗传。另一方面,通过染色体的手臂,由发育沉默的基因7,8组成。代谢细胞中异色素块的免疫染色,或相间细胞中异色素聚合物的观察,在了解异色区形成和功能方面,揭示了许多光。
使用卓索菲拉作为模型系统,使得开发必要的工具,研究异色素,而无需使用电子显微镜10。由于位置效应变异的描述和异色素相关蛋白质(如HP1a)和组蛋白后转化改性蛋白的发现,许多小组已经开发出几种免疫造血技术,允许这些异色区域的可视化10,11。
这些技术基于特定抗体的使用,这些抗体能够识别异色素相关蛋白质或希石标记。对于每个细胞类型和抗体,必须经验确定固定和渗透条件。此外,如果使用额外的机械过程(如挤压技术),条件可能会有所不同。在这个协议中,我们描述了使用果蝇唾液腺来研究异色病。唾液腺具有多聚化细胞,包含超过1000份基因组,因此提供了大部分染色质特征的放大视图,除了卫星DNA和一些被复制的异色区域。然而,异色素区域很容易在多极染色体制剂中可视化,但挤压技术有时可能会破坏典型的染色质结合复合物或染色质结构。因此,整个唾液腺组织中蛋白质的免疫定位可以超越这些不良反应。我们使用这个协议来检测几个染色质结合蛋白,我们已经证明,这个协议结合突变的果蝇种群可用于研究异色素干扰12。
真核生物的细胞功能可以定义细胞核内的3D结构,由不同蛋白质与染色质和包括RNA在内的各种分子之间的相互作用得到支持。在过去三年中,具有相关性的生物凝结物,包括异色素,在确定相分离方面发挥了根本作用,促进了活跃和抑制性色度素16、17、18的独特核空间组织。
异色素对于保持细胞功能和身?…
The authors have nothing to disclose.
我们感谢马可·安东尼奥·罗萨莱斯·维加和阿贝尔·塞古拉拍摄了一些焦点图像,卡门·穆尼奥斯为媒体准备,阿图罗·皮门特尔博士,M.C安德烈斯·萨拉莱吉博士和来自LMNA的克里斯·伍德博士就显微镜的使用提供建议。
1.5 mL microcentrifuge tubes | Axygen MCT-150-C | 11351904 | brand not critical |
16% formaldehyde | Thermo Scientific | 28908 | |
AF1 Citifluor | Ted pella | 19470 | 25 mL |
BSA, Molecular Biology Grade | Roche | 10735078001 | brand not critical |
Complete, protease inhibitors Ultra EDTA-free protease inhibitors |
Merck | 5892953001 | |
Coverslip | Corning | CLS285022-200EA | 22×22, brand not critical |
DTT | Sigma | d9779 | brand not critical |
EDTA | Sigma | E5134 | brand not critical |
EGTA | brand not critical | ||
Glass slide | Gold seal | 3011 | brand not critical |
H3BO3 | Baker | 0084-01 | brand not critical |
H3K9me3 | Abcam | 8889 | |
HP1a | Hybridoma Bank | C1A9 | Product Form Concentrate 0.1 mL |
KCl | Baker | 3040-01 | brand not critical |
Methanol | Baker | 9070-03 | brand not critical |
NaCl | Sigma | 71376 | brand not critical |
NaOH | brand not critical | ||
PIPES | brand not critical | ||
Rotator | Thermo Scientific | 13-687-12Q | Labquake Tube Shaker |
Thermo Mixer C | Eppendorf | 13527550 | SmartBlock 1.5 mL |
Tris | Milipore | 648311 | brand not critical |
Triton X-100 | Sigma | T8787 | 100 mL, brand not critical |
β-mercaptoethanol | Bio-Rad | 1610710 | 25 mL, brand not critical |