ここでのプロトコルでは、アーバスキュラー菌根のコロニー形成パターンの評価方法と、 Zea mays と Festuca rubraの2つの種の根の戦略について説明しています。MycoPatt法を使用すると、パラメータの計算、菌根構造のデジタルデータへの変換、および根におけるそれらの実際の位置のマッピングが可能になります。