Summary

Rab10リン酸化を評価してパーキンソン病関連LRRK2キナーゼ経路を尋問するためのヒト末梢血好中球分離

Published: March 21, 2020
doi:

Summary

ロイシンの変異は、リピートキナーゼ2遺伝子(LRRK2)が遺伝性パーキンソン病を引き起こす。我々はヒト末梢血中のRab10のLRRK2制御リン酸化を評価するための容易で、強い方法を開発した。これは、LRRK2キナーゼ経路活性の増加を有する個体を同定するのに役立つ可能性がある。

Abstract

ロイシンリッチリピートキナーゼ2(LRRK2)は、遺伝性パーキンソン病(PD)における最も頻繁に変異した遺伝子であり、すべての病原性LRRK2突然変異はキナーゼ機能の過剰活性化をもたらす。ここでは、ヒト末梢血中のLRRK2キナーゼ経路活性を定量化するための容易で強いアッセイを、その生理学的基質の1つであるRab10のLRRK2制御リン酸化をスレオニン73で測定することによって説明する。記載された免疫ブロット法は、MJFF-pRab10ウサギモノクローナル抗体のようなLRRK2によってリン酸化されたRab10 Thr73エピトープを認識する完全に選択的かつホスホウオンギクオン性抗体を必要とする。末梢血は容易にアクセス可能であり、好中球は豊富で均質な構成成分であるため、ヒト末梢血好中球を使用する。重要なことに、好中球はLRRK2とRab10の両方の比較的高いレベルを発現する。好中球の潜在的な欠点は、その高い固有のセリンプロテアーゼ活性であり、これは、溶菌緩衝液の一部として有機リンニューロトキシンジイソプロピルフルオロリン酸塩(DIFP)のような非常に強力なプロテアーゼ阻害剤の使用を必要とする。それにもかかわらず、好中球は、生体内のLRRK2キナーゼ経路活性の研究のための貴重なリソースであり、PDバイオレポジトリコレクションに含まれるように考慮されるべきである。

Introduction

パーキンソン病(PD)を遅くまたは停止する試みは、これまでのところ失敗しています。PDのリスクを引き起こすおよび/または増加するロイシンリッチリピートキナーゼ2(LRRK2)における過剰活性化突然変異の発見は、LRRK2キナーゼ阻害剤11、2、32,3の開発につながっている。これらは今臨床試験4に入りました。LRRK2の正確な機能は不明であるが、大きな進歩は、LRRK2キナーゼ5、6、7,6,7の最初のボナフィデス生理基質としてRab10を含むRab GTPaseタンパク質のサブセットの同定であった。疾患修飾治療の時代における主な課題は、LRRK2キナーゼ活性化状態の生化学的マーカーおよびLRRK2キナーゼ阻害剤の標的関与である。

これまで、インビボにおけるLRRK2阻害剤の主な薬物動態マーカーは、LRRK2の構成的にリン酸化されたセリン残基のクラスターであり、特にセリン935は、多様なLRRK2阻害剤88,99に応答して脱リン酸化される。しかしながら、セリン935リン酸化は、LRRK2によって直接リン酸化されておらず、キナーゼ不活性LRRK210中に依然としてリン酸化されているため、固有の細胞LRRK2キナーゼ活性と相関しない。LRRK2キナーゼ活性はセリン1292の自己リン酸化とよく相関するが、実際には、この部位10,11,11に対する信頼できる、そしてホスホ特異的抗体の現在の欠如による全細胞抽出物の免疫ブロット分析による内因性LRRK2キナーゼ活性に適した読み出しではない。

我々は、ヒト末梢血細胞におけるLRRK2キナーゼ経路活性を定量化するための堅牢で容易なアッセイを開発し、その生理学的標的タンパク質Rab10のリン酸化をスレオニン7311で測定した。末梢血は、最小限の不快感を引き起こす低リスクかつ迅速な手順である静脈切除によって容易にアクセス可能である。ヒト末梢血好中球は、LRRK2とRab1011の両方の比較的高いレベルを発現する豊富な(全白血球の37~80%)と均質な細胞集団を構成するため、我々は注目する。さらに、末梢血好中球は、免疫磁気陰性アプローチを採用することにより、迅速かつ効率的に単離することができる。その後観察されたRab10リン酸化がLRRK2によって媒介されることを確実にするために、好中球の各バッチは、強力で選択的なLRRK2キナーゼ阻害剤の有無にかかわらずインキュベートされる(我々はMLi-2を使用し、推奨する)2、12。,12この後、プロテアーゼ阻害剤ジイソプロピルフルオロリン酸塩(DIFP)を含む緩衝液中の細胞溶出が続き、好中球13において高くすることが知られているセリンプロテアーゼ活性を抑制するために必要である。定量免疫ブロット法による最終分析では、Rab10 Thr73-ホスホエピトープを特異的に検出し、他のリン酸化ラブタンパク質14と交差反応しないMJFF-pRab10ウサギモノクローナル抗体を用いることにお勧めします。この抗体の選択性と特異性は、異なるRabタンパク質の過剰発現モデルおよびA549 Rab10ノックアウト細胞ライン14において検証されている。従って、強力かつ選択的なLRRK2キナーゼ阻害剤2の有無にかかわらず治療された好中球の溶血体におけるRab10リン酸化の差を測定する。あるいは、定量質量分析などの他の方法によってサンプルを分析することもできる。

結論として、LRRK2制御のRab10リン酸化は、セリン935におけるLRRK2リン酸化に対するLRRK2キナーゼ活性の優れたマーカーであり、ヒト末梢血好中球は、LRRK2に関するPD研究の貴重なリソースである。我々のプロトコルは、末梢血好中球中のLRRK2経路活性を問い合わすために堅牢で容易なアッセイを提供し、LRRK2キナーゼ活性15を増加した個体の生化学的階層化を可能にする。重要なことに、このような個体は、将来のLRRK2キナーゼ阻害剤治療の恩恵を受ける可能性がある。

Protocol

現地の英国の規制によると、人間の血液のすべての操作とピペットは、カテゴリー2の生物学的安全キャビネットで行われます。すべての手続きは、地域の倫理審査委員会に従って行われ、すべての参加者はインフォームド・コンセントを提供しています。 1. 準備 リン酸緩衝生理食塩水(PBS)に100 mM EDTAを含むEDTAストック溶液1の0.1 mLを調製します。 PBSに1 mM E…

Representative Results

我々のアッセイは、読み出しとしてLRRK2依存性Rab10リン酸化を用いたヒト末梢血好中球中のPD関連LRRK2キナーゼの活性化を問い合わすことを可能にする。好中球は、LRRK2およびRab10タンパク質の両方の高レベルを発現する均質で豊富な末梢白血球集団である(図1)。残りの末梢血単核細胞(PBMC)の中で、両方のタンパク質のコピー数が多い唯一の他の細胞集団は単球であるが、?…

Discussion

説得力のある臨床、遺伝学的、生化学的証拠は、LRRK2の重要な役割、特にパーキンソン病におけるキナーゼ機能を指摘する。LRRK2キナーゼ阻害剤が開発され、臨床試験2、4、124,に入っています。そのため、患者層層と同様に、標的エンゲージメントのバイオマーカーとしてLRRK2を利用する必要があります。…

Divulgaciones

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

今回の研究に献血してくれた健康なボランティアに感謝します。私たちは、パーキンソン病研究のためのマイケル・J・フォックス財団(MJFF)とフォックスバイオネット研究リーダーシップ(FBN)に、書面によるプロトコルとビデオに対する彼らの支援とインプットに感謝します。オーストリアのウィーン大学のアレクサンダー・ジンプリッヒ教授に、私たちのプロトコルとコラボレーションをテストしてくれたことに感謝します。私たちは、プロジェクト(MRC PPUのゼネラルマネージャー)にポール・デイヴィスの貢献を大切にしています。また、MRCタンパク質リン酸化およびユビキタス化ユニット(PPU)、すなわち化学合成(MLi-2を合成するためのナタリア・シュピロ)、MRC PPU試薬およびサービス抗体精製チーム(によって調整された)の優れた技術サポートを認識しています(ヒラリー・マクラウクランとジェームズ・ハスティ)。私たちは、ビデオやアニメーションを作る彼らの助けをビボモーションからマヘリ・トウラーとフレイザーマードックに感謝します。私たちは、最終的な編集の支援のために81の映画からスティーブ・ソアヴェに感謝します。エステル・サムラーは、スコットランドのシニア・クリニカル・アカデミック・フェローシップの支援を受けており、パーキンソン病の英国(K-1706)から資金を受け取っています。

Materials

1 mL Pipette tips Sarstedt 70.762 or equivalent
1.5 mL Micro tubes Sarstedt 72.690.001 or equivalent
10 mL Pipette tips  Sarstedt 86.1254.025  or equivalent
10 μL Pipette tips Sarstedt 70.113 or equivalent
15 mL falcon tube  Cellstar 188 271 or equivalent
200 μL Pipette tips Sarstedt 70.760.002 or equivalent
25 mL Pipette tips  Sarstedt 86.1685.001 or equivalent
50 mL falcon tube  Cellstar 227 261 or equivalent
BD Vacutainer Hemogard Closure Plastic K2-EDTA Tube BD  BD 367525 or equivalent
Beckman Coulter Allegra X-15R centrifuge Beckman or equivalent centrifuge with swimging bucket rotator for 15 mL and 50 mL falcon tubes at speed 1000-1200 x g
Category 2 biological safety cabinet.
cOmplete(EDTA-free) protease inhibitor cocktail Roche 11836170001
DIFP (Diisopropylfluorophosphate)  Sigma D0879 Prepare 0.5M stock solution in isopropanol using special precautions 
Dimethyl sulfoxide  Sigma 6250
Dry ice or liquid nitrogene
Dulbecco's phosphate-buffered saline  ThermoFisher 14190094 or equivalent
Easy 50 EasySep Magnet  Stemcell 18002 for holding 1 x 50ml conical tube
EasySep Direct Human Neutrophil Isolation Kit  Stemcell 19666 This contains Solutions called “Isolation Cocktail” and “RapidSpheres magnetic beads
EGTA Sigma E3889
Eppendorf centrifuge 5417R centrifuge Eppendorf
Ethanol, in spray bottle
Ethylenediaminetetraacetic acid  Sigma E6758
Ice
Isopropanol (anhydrous grade)  Sigma 278475
Lysis buffer (50 mM Tris-HCl pH 7.5, 1%(v/v) Triton X-100, 1 mM EGTA, 1 mM Na3VO4, 50 mM NaF, 10 mM β-glycerophosphate, 5 mM sodium pyrophosphate, 0.27 M sucrose, 0.1% (v/v) β-mercaptoethanol, 1x cOmplete(EDTA-free) protease inhibitor cocktail (Roche), 1 μg/ml Microcystin-LR, 0.5 mM diisopropylfluorophosphate (DIFP).  alternatively frozen lysis buffer in aliquots without Microcystin-LR, DIFP available from MRC-PPU Reagents (http://mrcppureagents.dundee.ac.uk/)
Merck LRRK2 inhibitor II (MLi-2) Merck 438194-10MG or equivalent (potent and selective LRRK2 inhinitor)
Microcystin-LR Enzo Life Sciences ALX-350-012-M001 1 mg/ml stock in DMSO and store at -80 oC. 
Na3VO4 Aldrich 450243
NaF Sigma S7920
Odyssey CLx scan Western Blot imaging system Odyssey
Permanent marker pen
Personal protection equipment
RPMI 1640 Medium  ThermoFisher 21875034 or equivalent
sodium pyrophosphate Sigma S22
sucrose Sigma S0389
β-glycerophosphate Sigma 50020
β-mercaptoethanol Sigma M3148
Suggested antibodies for Western blotting
Anti-RAB10 (phospho T73) antibody [MJF-R21] abcam ab230261
Anti-α-tubulin Cell Signaling Technologies 5174 used at 1:2000 dilution
Goat anti-mouse IRDye 680LT LI-COR 926-68020 used at 1:10,000 dilution
Goat anti-mouse IRDye 800CW LI-COR 926-32210 used at 1:10,000 dilution
Goat anti-rabbit IRDye 800CW LI-COR 926-32211 used at 1:10,000 dilution
MJFF-total Rab10 mouse antibody generated by nanoTools (nanotools.de) not applicable* used at 2 μg/ml final concentration; * The MJFF-total Rab10 antibody generated by nanoTools (www.nanotools.de) [11] will be commercialised by the Michael J Fox Foundation in 2018
Mouse anti-LRRK2 C-terminus antibody Antibodies Incorporated  75-253 used at 1 μg/ml final concentration
pS935-LRRK2 MRC PPU Reagents and Services UDD2 MJFF-total Rab10 mouse antibody

Referencias

  1. Paisan-Ruiz, C., et al. Cloning of the gene containing mutations that cause PARK8-linked Parkinson’s disease. Neuron. 44 (4), 595-600 (2004).
  2. Fell, M. J., et al. MLi-2, a Potent, Selective, and Centrally Active Compound for Exploring the Therapeutic Potential and Safety of LRRK2 Kinase Inhibition. Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics. 355 (3), 397-409 (2015).
  3. Zimprich, A., et al. Mutations in LRRK2 cause autosomal-dominant parkinsonism with pleomorphic pathology. Neuron. 44 (4), 601-607 (2004).
  4. Sardi, S. P., Cedarbaum, J. M., Brundin, P. Targeted Therapies for Parkinson’s Disease: From Genetics to the Clinic. Journal of Movement Disorders. 33 (5), 684-696 (2018).
  5. Steger, M., et al. Phosphoproteomics reveals that Parkinson’s disease kinase LRRK2 regulates a subset of Rab GTPases. Elife. 5, (2016).
  6. Ito, G., et al. Phos-tag analysis of Rab10 phosphorylation by LRRK2: a powerful assay for assessing kinase function and inhibitors. Biochemical Journal. 473 (17), 2671-2685 (2016).
  7. Alessi, D. R., SammLer, E. LRRK2 kinase in Parkinson’s disease. Science. 360 (6384), 36-37 (2018).
  8. Yue, M., et al. Progressive dopaminergic alterations and mitochondrial abnormalities in LRRK2 G2019S knock-in mice. Neurobiology of Disease. 78, 172-195 (2015).
  9. Doggett, E. A., Zhao, J., Mork, C. N., Hu, D., Nichols, R. J. Phosphorylation of LRRK2 serines 955 and 973 is disrupted by Parkinson’s disease mutations and LRRK2 pharmacological inhibition. Journal of Neurochemistry. 120 (1), 37-45 (2012).
  10. Sheng, Z., et al. Ser1292 autophosphorylation is an indicator of LRRK2 kinase activity and contributes to the cellular effects of PD mutations. Science Translational Medicine. 4 (164), (2012).
  11. Fan, Y., et al. Interrogating Parkinson’s disease LRRK2 kinase pathway activity by assessing Rab10 phosphorylation in human neutrophils. Biochemical Journal. 475 (1), 23-44 (2018).
  12. Scott, J. D., et al. Discovery of a 3-(4-Pyrimidinyl) Indazole (MLi-2), an Orally Available and Selective Leucine-Rich Repeat Kinase 2 (LRRK2) Inhibitor that Reduces Brain Kinase Activity. Journal of Medicinal Chemistry. 60 (7), 2983-2992 (2017).
  13. Pham, C. T. Neutrophil serine proteases: specific regulators of inflammation. Nature Reviews Immunology. 6 (7), 541-550 (2006).
  14. Lis, P., et al. Development of phospho-specific Rab protein antibodies to monitor in vivo activity of the LRRK2 Parkinson’s disease kinase. Biochemical Journal. 475 (1), 1-22 (2018).
  15. Mir, R., et al. The Parkinson’s disease VPS35[D620N] mutation enhances LRRK2-mediated Rab protein phosphorylation in mouse and human. Biochemical Journal. 475 (11), 1861-1883 (2018).
  16. Rieckmann, J. C., et al. Social network architecture of human immune cells unveiled by quantitative proteomics. Nature Immunology. 18 (5), 583-593 (2017).
  17. Borregaard, N. Neutrophils, from marrow to microbes. Immunity. 33 (5), 657-670 (2010).
  18. Bain, B., Dean, A., Broom, G. The estimation of the lymphocyte percentage by the Coulter Counter Model S Plus III. Clinical & Laboratory Haematology. 6 (3), 273-285 (1984).
  19. Tomazella, G. G., et al. Proteomic analysis of total cellular proteins of human neutrophils. Proteome Science. 7, 32 (2009).
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Citar este artículo
Fan, Y., Tonelli, F., Padmanabhan, S., Baptista, M. A., Riley, L., Smith, D., Marras, C., Howden, A., Alessi, D. R., Sammler, E. Human Peripheral Blood Neutrophil Isolation for Interrogating the Parkinson’s Associated LRRK2 Kinase Pathway by Assessing Rab10 Phosphorylation. J. Vis. Exp. (157), e58956, doi:10.3791/58956 (2020).

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