Färbung von Proteinen in Gelen mit Coomassie G-250 ohne organische Lösungsmittel und Essigsäure

Summary

Ein kurzes Protokoll für Protein-Färbung mit Coomassie Brilliant Blue (CBB) G-250 in Polyacrylamidgelen wird ohne Verwendung von organischen Lösungsmitteln oder Essigsäure als in der klassischen Färbeverfahren mit CBB beschrieben.

Abstract

In der klassischen Protein Färbeprotokollen mit Coomassie Brilliant Blue (CBB), Lösungen mit hohen Gehalten von toxischen und brennbaren organischen Lösungsmitteln (Methanol, Ethanol oder 2-Propanol) und Essigsäure sind zur Fixierung verwendet, Färben und Entfärben von Proteinen in einem Gel nach SDS -PAGE. Zur Beschleunigung der Verfahren, Erhitzen der Färbelösung in der Mikrowelle für eine kurze Zeit wird häufig verwendet. Dies führt in der Regel Verdampfung von giftigen oder gefährlichen Methanol, Ethanol oder 2-Propanol und ein starker Geruch von Essigsäure im Labor, die vermieden aus Sicherheitserwägungen sollte. In einem Protokoll ursprünglich in zwei Patentanmeldungen EM Wondrak (US2001046709 (A1), US6319720 (B1)) veröffentlicht wurde, ist eine alternative Zusammensetzung der Färbelösung beschrieben, in denen keine organischen Lösungsmittel oder Säuren verwendet wird. Die CBB ist in bidestilliertem Wasser gelöst (60-80mg CBB G-250 pro Liter) und 35 mM HCl ist als einzige weitere Verbindung in die Färbelösung aufgenommen. Die CBB Staning des Gels wird nach SDS-PAGE und gründliches Waschen des Gels in bidestilliertem Wasser getan. Durch Erhitzen des Gels während des Waschens und Färbeschritte, kann der Prozess schneller beendet sein und keine giftigen oder gefährlichen Kombinationspräparate sind verdampft. Die Färbung von Proteinen tritt bereits innerhalb von 1 Minute nach dem Erwärmen des Gels in Färbelösung und ist voll nach 15-30 min mit einem leicht blauen Hintergrund, die komplett bei längerer Waschen der gefärbten Gel in bidestilliertem Wasser entfärbt entwickelt, ohne dass die gefärbten Proteins Bands.

Protocol

Teil 1: Vorbereitung der CBB Färbelösung 60-80 mg der CBB G-250 werden in 1 Liter bidestilliertem Wasser unter Rühren für 2-4 Stunden gelöst. Schließlich wird mit 3 ml konzentrierter HCl auf den dunkelblauen Lösung unter Rühren für eine weitere Minute hinzugefügt und im Dunkeln aufbewahrt für eine spätere Verwendung. Die Lösung kann für mehrere Wochen aufbewahrt werden bis zu mehreren Monaten, ohne seine Färbung Effizienz. Konzentrierte HCl sollte mit der üblichen Sorgfalt und unter …

Discussion

• Die Waschschritte sind entscheidend für die effiziente Färbung der Proteine. Eine reduzierte Waschzeit unter 2 min oder reduziertem Volumen von Wasser (<50 ml) kann in hellblauen Proteinbanden, wahrscheinlich aufgrund der höheren Mengen an restlichem SDS im Gel führen.
• Wenn die Proteine ​​gehen, um durch Massenspektrometrie analysiert werden, die Heizung Schritte in der Mikrowelle übersprungen werden soll, ist die Zeit für das Waschen des Gels erweitert, um ca. 10 min in jedem Schritt und die Färbung der Zeit, b…

Materials

Material Name	Type	Company	Catalogue Number	Comment
Coomassie Brilliant Blue G-250		AppliChem	A3480	any other CBB G-250 could be used as well
Concentrated HCl