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En utilisant en forme in Vitro et dans les cellules d’enquêter sur petites molécules a induit des changements structurels de l’ARN pré-messager
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Using In Vitro and In-cell SHAPE to Investigate Small Molecule Induced Pre-mRNA Structural Changes
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En utilisant en forme in Vitro et dans les cellules d’enquêter sur petites molécules a induit des changements structurels de l’ARN pré-messager

DOI:
10.3791/59021-v

•

11:58 min

•

January 30, 2019

•

, ,
1Calibr,The Scripps Research Institute, 2Department of Integrative Structural and Computational Biology,The Scripps Research Institute

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 00:3132P-labeled Primer Labeling for In Vitro Selective 2‘-hydroxyl Acylation Analyzed by Primer Extension (SHAPE)
  • 03:44Small Molecule Binding and RNA 2‘-OH Modification
  • 06:29Marker Preparation and Primer Extension
  • 08:59PAGE Analysis
  • 10:15Results of In Vitro and In-cell SHAPE for Analyzing Small Molecule Induced Pre-mRNA Structural Changes
  • 11:02Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Des protocoles détaillés pour les deux in vitro et dans les cellules sélectif 2'-hydroxyle acylation analysés par des expériences de primer extension (forme) pour déterminer la structure secondaire des séquences de l’ARN pré-messager d’intérêt en présence d’une petite molécule RNA ciblage sont présenté dans cet article.

Tags

Keywords: In Vitro SHAPEIn-cell SHAPERNA Secondary StructureSmall MoleculePre-mRNAReverse TranscriptionRadioactive LabelingAcrylamide GelPassive Elution

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