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Mit In-vitro- und In der Zelle Form zu untersuchen, kleines Molekül induzierte Pre-mRNA Strukturveränderungen
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Using In Vitro and In-cell SHAPE to Investigate Small Molecule Induced Pre-mRNA Structural Changes
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Mit In-vitro- und In der Zelle Form zu untersuchen, kleines Molekül induzierte Pre-mRNA Strukturveränderungen

DOI:
10.3791/59021-v

•

11:58 min

•

January 30, 2019

•

, ,
1Calibr,The Scripps Research Institute, 2Department of Integrative Structural and Computational Biology,The Scripps Research Institute

Capitoli

  • 00:04Titolo
  • 00:3132P-labeled Primer Labeling for In Vitro Selective 2‘-hydroxyl Acylation Analyzed by Primer Extension (SHAPE)
  • 03:44Small Molecule Binding and RNA 2‘-OH Modification
  • 06:29Marker Preparation and Primer Extension
  • 08:59PAGE Analysis
  • 10:15Results of In Vitro and In-cell SHAPE for Analyzing Small Molecule Induced Pre-mRNA Structural Changes
  • 11:02Conclusion

Summary

Traduzione automatica

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Detaillierte Protokolle für beide in vitro und in-Cell selektive 2'-Hydroxyl-Acylation von Primer Extension (Form) Experimente zur Bestimmung der sekundären Struktur der Pre-mRNA-Sequenzen von Interesse im Beisein einer RNA-targeting niedermolekularer analysiert werden in diesem Artikel vorgestellt.

Tags

In Vitro SHAPEIn-cell SHAPERNA Secondary StructureSmall MoleculePre-mRNAReverse TranscriptionRadioactive LabelingAcrylamide GelPassive Elution

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