Using Next Generation Sequencing to Identify Mutations Associated with Repair of a CAS9-induced Double Strand Break Near the CD4 Promoter

Changkun Hu; Tyler Doerksen; Taylor Bugbee; Nicholas A. Wallace; Rachel Palinski

doi:10.3791/62583

/

Bruke neste generasjons sekvensering til å identifisere mutasjoner forbundet med reparasjon av et CAS9-indusert dobbeltstrengsbrudd i nærheten av CD4-promotoren

JoVE Journal
Genetica

È necessario avere un abbonamento a JoVE per visualizzare questo. Accedi o inizia la tua prova gratuita.

JoVE Journal Genetica

Using Next Generation Sequencing to Identify Mutations Associated with Repair of a CAS9-induced Double Strand Break Near the CD4 Promoter

Bruke neste generasjons sekvensering til å identifisere mutasjoner forbundet med reparasjon av et CAS9-indusert dobbeltstrengsbrudd i nærheten av CD4-promotoren

DOI:

10.3791/62583-v

•

06:59 min

•

March 31, 2022

•

Changkun Hu*¹, Tyler Doerksen*², Taylor Bugbee, Nicholas A. Wallace, Rachel Palinski³

¹Division of Biology,Kansas State University, ²Kansas State Veterinary Diagnostic Laboratory,Kansas State University, ³Department of Diagnostic Medicine/Pathobiology,Kansas State University

Capitoli

00:05Introduction
00:41Cell Plating
02:21Transfection
04:42Results: Identifying the Mutations Associated with Double Strand Break Repair near the CD4 Promoter
06:15Conclusion

Summary

Traduzione automatica

Presentert her er sgRNA / CAS9 endonuclease og neste generasjons sekvenseringsprotokoll som kan brukes til å identifisere mutasjonene forbundet med dobbel strandbruddreparasjon nær CD4-promotoren.

Bruke neste generasjons sekvensering til å identifisere mutasjoner forbundet med reparasjon av et CAS9-indusert dobbeltstrengsbrudd i nærheten av CD4-promotoren

•

•

•

Capitoli

Summary

Traduzione automatica

Tags

Article

Embed

AGGIUNGI ALLA PLAYLIST

Usage Statistics

Video correlati

Villtype Blokkering PCR Kombinert med direkte sekvensering som en svært følsom metode for påvisning av lavfrekvent somatiske mutasjoner

Påvisning av Kopier nummer Endringer Bruke enkelt celle Sequencing

Optimalisering og sammenligningsanalyse av organellar DNA-berigelsesmetoder som er egnet for neste generasjons sekvensering

Analyse av c-KIT ligand-promotoren ved bruk av kromatinimmunutfelling

Generasjon av innfødte Chromatin Immunoprecipitation sekvensering biblioteker til Nucleosome tetthet analyse

Generering av en gen-forstyrret Streptococcus mutans belastning uten Gene kloning

Neste generasjons sekvensering og bioinformatikk rørledning for å evaluere genetisk determinanter av konstitusjonelle sykdom

Promotoren fange Hei-C: Med høy oppløsning, genomet-bred profilering av arrangøren interaksjoner

Forsterkning av nær full lengde HIV-1-Proviruses for neste generasjons sekvensering

Høy gjennomstrømming identifikasjon av regulatoriske gensekvenser med neste generasjons sekvensering av runde kromosom konformasjon fange (4C-seq)

Read Article