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높은 처리량 시퀀싱을위한 고품질 염색질 면역 침전의 DNA 템플릿의 생성 (칩 SEQ)
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JoVE 신문 생물학
Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)
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높은 처리량 시퀀싱을위한 고품질 염색질 면역 침전의 DNA 템플릿의 생성 (칩 SEQ)

DOI:
10.3791/50286-v

•

09:52 min

•

April 19, 2013

•

, , ,
1Division of Human Genetics,Children’s Hospital of Philadelphia Research Institute, 2Department of Pediatrics, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:59Cross-linking Chromatin
  • 02:27Sonication
  • 04:14Pre-clearing Chromatin
  • 05:15Chromatin Immunoprecipitation
  • 07:10Reversing Cross-link and Purifying DNA
  • 08:12Results: Generation of a High Quality ChIP Template
  • 09:28Conclusion

Summary

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염색질의 immunoprecipitation과 매우 높은 처리량 시퀀싱 (칩 SEQ)의 조합은 특정 조직이나 세포주에서 단백질 DNA 상호 작용을 파악하고 매핑 할 수 있습니다. 설명은 예를 들어 전사 인자 TCF7L2 경험을 사용하여 다음 순서를위한 고품질 칩 템플릿을 생성하는 방법이다.

Tags

ChIP-seqChromatin ImmunoprecipitationHigh-throughput SequencingTranscription FactorsTCF7L2Type 2 DiabetesCancerHCT116Protein-DNA InteractionsGenome Sequencing

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