Journal
/
생체공학
/
Substructuur Analyzer: Een gebruiksvriendelijke workflow voor snelle verkenning en nauwkeurige analyse van cellulaire lichamen in fluorescentiemicroscopie beelden
JoVE 신문
생체공학
Author Produced
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 생체공학
Substructure Analyzer: A User-Friendly Workflow for Rapid Exploration and Accurate Analysis of Cellular Bodies in Fluorescence Microscopy Images
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Substructuur Analyzer: Een gebruiksvriendelijke workflow voor snelle verkenning en nauwkeurige analyse van cellulaire lichamen in fluorescentiemicroscopie beelden

DOI:
10.3791/60990-v

•

14:28 min

•

July 15, 2020

•

, , , , , ,
1Université de Lorraine, CNRS, IMoPA F54000 Nancy France, 2Institut Pasteur, BioImage Analysis Unit, CNRS UMR 3691, Paris, France.

Chapters

  • 00:00Introduction
  • 01:06Download Icy and the “Substructure Analyzer” Protocol on Icy Website
  • 01:30Opening the Protocol
  • 02:03Interacting with the Workflow on Icy
  • 02:49Merging of the Channels of an Image
  • 04:57Segmentation of the Regions of Interest
  • 07:42Fluorescent Signal Detection and Analysis
  • 09:25Run the Protocol
  • 10:35Representative Results
  • 13:48Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

We presenteren een vrij beschikbare workflow gebouwd voor snelle verkenning en nauwkeurige analyse van cellulaire lichamen in specifieke celcompartimenten in fluorescentiemicroscopie beelden. Deze gebruiksvriendelijke workflow is ontworpen op de open-source software Icy en maakt ook gebruik van ImageJ functionaliteiten. De pijplijn is betaalbaar zonder kennis van beeldanalyse.

Tags

Keywords: Substructure AnalyzerUser-friendly WorkflowRapid ExplorationAccurate AnalysisCellular BodiesFluorescence MicroscopyImage SegmentationROI AnalysisIcy SoftwareMulti-channel Image ProcessingImage PreprocessingFeature ExtractionAutomated Data Export

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/60990?article_type=v

Low-Cost Cryo-Light Microscopie Stage Fabrication voor Gecorreleerde Light / Electron Microscopy
check_url/kr/60990?article_type=v

Specimen Voorbereiding, Imaging, en Analyse Protocollen voor Knife-edge Scanning Microscopie
check_url/kr/60990?article_type=v

Cellulaire vetextractie voor gerichte stabiele isotopen Verdunning vloeistofchromatografie-massaspectrometrie Analyse
check_url/kr/60990?article_type=v

Visualisatie van Cortex Organisatie en Dynamiek in Micro-organismen, met behulp van Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy
check_url/kr/60990?article_type=v

Correlatieve microscopie voor 3D Structural Analysis van Dynamic Interactions
check_url/kr/60990?article_type=v

Hoge-resolutie Spatiotemporal Analyse van Receptor Dynamics door Single-molecule fluorescentie microscopie
check_url/kr/60990?article_type=v

3D Orbital Tracking in een gemodificeerde twee-foton microscoop: een toepassing op het volgen van intracellulaire blaasjes
check_url/kr/60990?article_type=v

Van Fast Fluorescentie Imaging om moleculaire diffusie wet op de Live-celmembranen in een Commercial Microscoop
check_url/kr/60990?article_type=v

Fluorescentie-blussen van een liposomaal ingekapseld nabij-infrarood Fluorofoor als een instrument voor<em> In Vivo</em> Optical Imaging
check_url/kr/60990?article_type=v

Creëren van een structureel realistische eindige elementen geometrische Model van een Cardiomyocyte te bestuderen van de rol van cellulaire architectuur in Cardiomyocyte systeembiologie

Read Article