Summary

Isolering af Intakt Mitokondrier fra Skeletal Muscle ved differentialcentrifugering for høj opløsning respirometri Målinger

Published: March 08, 2017
doi:

Summary

Here, a quadriceps muscle specimen is taken from an anaesthetized pig and mitochondria are isolated by differential centrifugation. Then, the respiratory rates of mitochondrial respiratory chain complexes I, II and IV are determined using high-resolution respirometry.

Abstract

Mitochondria are involved in cellular energy metabolism and use oxygen to produce energy in the form of adenosine triphosphate (ATP). Differential centrifugation at low- and high-speed is commonly used to isolate mitochondria from tissues and cultured cells. Crude mitochondrial fractions obtained by differential centrifugation are used for respirometry measurements. The differential centrifugation technique is based on the separation of organelles according to their size and sedimentation velocity. The isolation of mitochondria is performed immediately after tissue harvesting. The tissue is immersed in an ice-cold homogenization medium, minced using scissors and homogenized in a glass homogenizer with a loose-fitting pestle. The differential centrifugation technique is efficient, fast and inexpensive and the mitochondria obtained by differential centrifugation are pure enough for respirometry assays. Some of the limitations and disadvantages of isolated mitochondria, based on differential centrifugation, are that the mitochondria can be damaged during the homogenization and isolation procedure and that large amounts of the tissue biopsy or cultured cells are required for the mitochondrial isolation.

Introduction

Mitokondrie bioenergetik og respiratoriske kapacitet kan studeres ikke blot i permeabiliserede celler eller fibre, men også i isolerede mitokondrier. I den foreliggende undersøgelse beskriver vi en protokol til at isolere intakte skelet muskel mitokondrier bruger differential centrifugering i høj opløsning respirometri målinger.

For at isolere intakte mitokondrier for respirometri, vævet homogeniseres og mitokondrier isoleres ved en konventionel differential centrifugering metode. Den differentielle centrifugering Metoden er baseret på sekventielle centrifugeringer (i en serie af stigende hastighed) af vævshomogenisater blev først indført ved Pallade og medarbejdere næsten 70 år siden en. Vævet først hakket med en saks og homogeniseret mekanisk i en glashomogenisator med en løstsiddende pistil. Bagefter Homogenatet centrifugeres ved lav hastighed, og den resulterende pellet, der indeholder ubrudt væv, cellulæresnavs og kerner kasseres. Derefter supernatanten centrifugeret flere gange ved høj hastighed og det mitokondriske berigede fraktion opsamles. Fordelene ved differentialcentrifugering metode til isolering mitokondrier er, at: i) metoden er hurtig og mitokondrier kan isoleres inden 1-1,5 timer (bør udføres respiratoriske eksperimenter så hurtig som muligt); ii) den er billig; og iii) det er meget effektiv og de opnåede ved differential centrifugering mitokondrier er ren nok til respirometri analyser. Ulemperne ved differentialcentrifugering metode til at isolere mitokondrier er at i) mitokondrier kan blive beskadiget og frakoblet under homogenisering; ii) forurening af mitokondrier med andre cellulære bestanddele (kunne løses ved yderligere vask mitokondrie pellet med yderligere centrifugeringstrin); iii) muligheden for at vælge forskellige mitochondriale subpopulationer, f.eks under differentielle centrifugeringer trin, mitochondria med lavere tætte kan udelukkes 7; og iv) det mitokondriske cellulær omgivende mangler, og kun den teoretiske maksimale respiration kan måles. En anden fremgangsmåde til isolering mitokondrier for respirometri assays er densitetsgradientcentrifugering 2. Ved denne teknik er vævet ekstrakt overtrukket over en opløsning af saccharose eller en Percoll-gradient (med højere densitet ved bunden af ​​centrifugerør) og centrifugeres med en bestemt hastighed, forårsager mitokondrier, der skal isoleres fra andre cellulære komponenter i henhold til deres tætheder. Denne metode anvendes ofte til at isolere hjernens mitokondrier med meget lav forurening fra synaptosomer. Imidlertid er de rottelever mitokondrier isoleret ved densitetsgradientcentrifugering stærkt forurenet med andre cellulære organeller 3. En af begrænsningerne ved denne fremgangsmåde er, at saccharosegradient stede i centrifugerør kan briste såmig mitokondrier (osmotisk chok).

Afhængigt af typen af ​​væv; der er nogle vigtige faktorer at overveje til isolering af intakt mitokondrier ved differential centrifugering. Den første nødvendighed er at homogenisere væv på en skånsom måde. Blødt væv, såsom nyre, hjerne og lever kræver forsigtig mekanisk kræfter, der påføres under homogenisering. Dette står i modsætning til hårde væv, såsom hjerte- og skeletmuskulatur, der kræver meget stærkere mekaniske kræfter. Det hakkede væv er normalt behandlet med proteinase forud for homogeniseringen at blødgøre vævet. Alle puffere anvendt under homogenisering og centrifugering bør være iskold og har en fysiologisk relevant pH med en ionisk og osmotisk styrke kompatibel med cytosol 4, 5.

En af fordelene ved at studere isoleret mitokondrielle bioenergetik er, at cellulære plasmamembraner ikke behøver at være permeabilized med detergenter såsom digitonin eller saponin 4, 6, som kan kompromittere den mitokondriske ydre membran integritet. En anden fordel af det isolerede mitokondrier er fraværet af andre cytosoliske faktorer, som kan forstyrre analysen af ​​de mitochondriale funktioner såsom iltforbrug. Ulemperne ved anvendelse af de isolerede mitokondrier er muligheden for at vælge bestemte mitokondriske populationer under centrifugeringstrin, skader på mitokondrier under homogenisering, og kravet om store mængder biologiske prøver for at opnå et godt udbytte af isolerede mitokondrier 7, 8.

Efter isolation procedure, de respiratoriske satser for mitokondrie komplekser I-, II- og IV-afhængige (stater 2, 3 og 4) bestemmes ved hjælp af høj opløsning respirometri. For komplekse I-drevet respiration, glutamatog malat er tilsat efterfulgt af adenosindiphosphat (ADP). For komplekse II-drevet respiration, er succinat tilsat efterfulgt af ADP. For komplekse IV-drevet respiration, ascorbat og tetramethylphenylendiamine (TMPD) tilsættes efterfulgt af ADP 9, 10, 11, 12. Tilstand 2 vedrører konsum oxygen i nærvær af substrater alene. Tilstand 3 henviser til iltforbruget i nærvær af substrater og ADP. State 4 henviser til iltforbrug efter ADP udtynding. Den respiratoriske kontrol ratio (RCR) er et indeks af kobling for iltforbrug ATP produktion og er beregnet som forholdet mellem stat 3 og stat 4 13, 15.

Sammenfattende beskriver vi en protokol til at isolere funktionelle og intakte skeletmuskulatur mitokondrier ved differential centrifugering og bruge disse isolerede mitochonDRIA for funktionelle og bioenergetic undersøgelser såsom høj opløsning respirometri.

Protocol

Quadriceps muskel biopsi er taget fra en bedøvet gris, hvorfra mitokondrier isoleres ved differentialcentrifugering. Grisen bliver brugt bagefter for et andet eksperiment. Undersøgelsen er udført i overensstemmelse med National Institutes of Health retningslinjer for pasning og anvendelse af forsøgsdyr og med godkendelse af Animal Care udvalg af Canton Bern, Schweiz. 1. Skeletal Muscle Homogenisering og Mitokondriel Isolation Excise 5-10 g quadriceps muskel eksemplar f…

Representative Results

Kompleks I-afhængige respiration Isolerede mitokondrie komplekse I-afhængige respiratoriske satser (stater 2, 3 og 4) bestemmes ved hjælp af høj-opløsning respirometri (figur 1, en repræsentant diagram). Mitochondriale komplekse I substrater, glutamat og malat, tilsættes efterfulgt af tilsætningen af ​​ADP. State 2 henviser til iltforbruget i overværelse af alene substrater. Tilst…

Discussion

I nærværende undersøgelse beskriver vi en protokol til at isolere høj kvalitet, intakt og tæt koblede skeletmuskulatur mitokondrier ved differential centrifugering, som kan anvendes til funktionelle undersøgelser såsom høj opløsning respirometri.

For at isolere intakte og stramt koblede mitokondrier, er der nogle kritiske punkter, der skal overvejes inden for den nuværende protokol. Efter høst af knoglevæv, skal det straks nedsænket i iskold mitokondrie isolation puffer. Alle ce…

Declarações

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

This study was supported by the Swiss National Science Foundation (Grant 32003B_127619).

Materials

ADP Sigma A 4386 Chemical
Antimycin A Sigma A 8674 Chemical, dissolve in ethanol
Ascorbate Merck 1.00127 Chemical
ATP Sigma A 7699 Chemical
BSA Sigma A 6003 Chemical
EGTA fluka 3779 Chemical
Glutamate Sigma, G 1626 Chemical
Hepes Sigma H 7523 Chemical
KCl Merck 1.04936 Chemical
KH2PO4 Merck 1.04873 Chemical
K-lactobionate Sigma L 2398 Chemical
MgCl2 Sigma M 9272 Chemical
Morpholinopropane sulphonic acid (MOPS) Merck 1.06129 Chemical
O2k-Core: Oxygraph-2k  Oroboros Instruments 10000-02 High-resolution respirometry instrument
Proteinase, bacterial Sigma P 8038 Chemical
Sodium azide Sigma S2002 Chemical
Rotenone Sigma R 8875 Chemical, dissolve in ethanol
Succinate Sigma S 2378 Chemical
Schuett homogen-plus semiautomatic homogeniser  schuett-biotec GmbH 3.201 011 Tissue homogenizer
Taurine Sigma T 8691 Chemical
TMPD Sigma T 3134 Chemical

Referências

  1. Hogeboom, G. H., Schneider, W. C., Pallade, G. E. Cytochemical studies of mammalian tissues. I. Isolation of intact mitochondria from rat liver; some biochemical properties of mitochondria and submicroscopic particulate material. J. Biol. Chem. 172, 619-635 (1948).
  2. Sims, N. R. Rapid isolation of metabolically active mitochondria from rat brain and subregions using Percoll density gradient centrifugation. J. Neurochem. 55 (2), 698-707 (1990).
  3. Hartwig, S., et al. A critical comparison between two classical and a kit-based method for mitochondria isolation. Proteomics. 9 (11), 3209-3214 (2009).
  4. Pallotti, F., Lenaz, G. Isolation and subfractionation of mitochondria from animal cells and tissue culture lines. Methods Cell Biol. 65, 1-35 (2001).
  5. Pallotti, F., Lenaz, G. Isolation and subfractionation of mitochondria from animal cells and tissue culture lines. Methods Cell Biol. 80, 3-44 (2007).
  6. Niklas, J., Melnyk, A., Yuan, Y., Heinzle, E. Selective permeabilization for the high-throughput measurement of compartmented enzyme activities in mammalian cells. Anal. Biochem. 416 (2), 218-227 (2011).
  7. Kuznetsov, A. V., et al. Analysis of mitochondrial function in situ in permeabilized muscle fibers, tissues and cells. Nat. Protoc. 3 (6), 965-976 (2008).
  8. Perry, C. G., Kane, D. A., Lanza, I. R., Neufer, P. D. Methods for assessing mitochondrial function in diabetes. Diabetes. 62 (4), 1041-1053 (2013).
  9. Gnaiger, E. Capacity of oxidative phosphorylation in human skeletal muscle: new perspectives of mitochondrial physiology. Int. J. Biochem. Cell Biol. 41 (10), 1837-1845 (2009).
  10. Vuda, M., et al. Effects of catecholamines on hepatic and skeletal muscle mitochondrial respiration after prolonged exposure to faecal peritonitis in pigs. Innate Immun. 18 (2), 217-230 (2012).
  11. Corrêa, T. D., et al. Angiotensin II in septic shock: effects on tissue perfusion, organ function, and mitochondrial respiration in a porcine model of fecal peritonitis. Crit. Care Med. 42 (8), e550-e559 (2014).
  12. Jeger, V., et al. Dose response of endotoxin on hepatocyte and muscle mitochondrial respiration in vitro. Biomed Res Int. 2015, 353074 (2015).
  13. Nicholls, D. G., Ferguson, S. J. . Bioenergetics. 3, (2002).
  14. Chance, B., Williams, G. R. The respiratory chain and oxidative phosphorylation. Adv. Enzymol. Relat. Subj. Biochem. 17, 65-134 (1956).
  15. Brand, M. D., Nicholls, D. G. Assessing mitochondrial dysfunction in cells. Biochem. J. 435 (2), 297-312 (2011).
  16. Gnaiger, E., Méndez, G., Hand, S. C. High phosphorylation efficiency and depression of uncoupled respiration in mitochondria under hypoxia. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (20), 11080-11085 (2000).
  17. Pesta, D., Gnaiger, E. High-resolution respirometry: OXPHOS protocols for human cells and permeabilized fibers from small biopsies of human muscle. Methods Mol. Biol. 810, 25-58 (2012).
  18. Picard, M., et al. Mitochondrial structure and function are disrupted by standard isolation methods. PLoS One. 6 (3), e18317 (2011).
  19. Picard, M., et al. Mitochondrial functional impairment with aging is exaggerated in isolated mitochondria compared to permeabilized myofibers. Aging Cell. 9 (6), 1032-1046 (2010).
  20. Graham, J. M. Purification of a crude mitochondrial fraction by density-gradient centrifugation. Curr. Protoc. Cell. Biol. Chapter 3. 3, (2001).
  21. Franko, A., et al. Efficient isolation of pure and functional mitochondria from mouse tissues using automated tissue disruption and enrichment with anti-TOM22 magnetic beads. PLoS One. 8 (12), 382392 (2013).
  22. Pecinová, A., Drahota, Z., Nůsková, H., Pecina, P., Houštěk, J. Evaluation of basic mitochondrial functions using rat tissue homogenates. Mitochondrion. 11 (5), 722-728 (2011).
  23. Lombardi, A., et al. Characterisation of oxidative phosphorylation in skeletal muscle mitochondria subpopulations in pig: a study using top-down elasticity analysis. FEBS Lett. 475 (2), 84-88 (2000).

Play Video

Citar este artigo
Djafarzadeh, S., Jakob, S. M. Isolation of Intact Mitochondria from Skeletal Muscle by Differential Centrifugation for High-resolution Respirometry Measurements. J. Vis. Exp. (121), e55251, doi:10.3791/55251 (2017).

View Video