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Sample Preparation and Analysis of RNASeq-based Gene Expression Data from Zebrafish
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Preparazione dei campioni e analisi dei dati di espressione genica basati su RNASeq dallo Zebrafish

DOI:
10.3791/56187-v

•

11:42 min

•

October 27, 2017

•

, ,
1Division of Endocrinology, Diabetes and Nutrition, Department of Medicine,University of Maryland School of Medicine

Capítulos

  • 00:05Título
  • 01:04Generating Embryos Through Natural Mating and Staging Embryos
  • 02:22Whole Embryo Dissociation, RNA Extraction and Purify High-quality RNA
  • 04:55Sorting Differentially Expressed Genes
  • 07:00Determine Enriched Pathways
  • 07:57Generation of Pathway Networks and Determination of Enriched GO Terms
  • 09:12Results: RNAseq-based Zebrafish Genome Expression Data for Alstrom and Bardet Biedl Syndromes
  • 10:47Conclusion

Summary

Tadução automática

Tadução automática

Questo protocollo presenta un approccio per l'analisi del trascrittoma intero da embrioni di zebrafish, larve, o ordinato cells. Includiamo isolamento di RNA, analisi dei percorsi dei dati RNASeq e convalida qRT-PCR-basata di cambiamenti di espressione genica.

Tags

RNASeqGene ExpressionZebrafishEmbryoLarvaTranscriptomeSample PreparationRNA ExtractionRNA SequencingBiologia do DesenvolvimentoComparative Analysis

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