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Quantification automatisée basée sur l'image des pièges extracellulaires neutrophiles à l'aide de NETQUANT

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Automated Image-Based Quantification of Neutrophil Extracellular Traps Using NETQUANT

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Quantification automatisée basée sur l'image des pièges extracellulaires neutrophiles à l'aide de NETQUANT

DOI:

10.3791/58528-v

•

07:33 min

•

November 27, 2019

•

Tirthankar Mohanty, Pontus Nordenfelt

¹Department of Clinical Sciences, Division of Infection Medicine,Lund University

Capítulos

00:04Título
00:34Analysis and Quantification of Neutrophil Extracellular Traps (NETs)
02:19Segmentation of Cells in the DNA Channel and the NET Channel
03:41Single-cell Analysis of Identifiable Properties
04:19Comparison of Cell Properties to Identify NET-forming Cells
05:23Result Outputs Demeanor
06:16Results: Analysis of NET Formation
07:07Conclusion

Summary

Tadução automática

Ici, nous présentons un protocole pour générer des pièges extracellulaires neutrophiles (NET) et l'exploitation de NETQUANT, une option logicielle entièrement automatique pour la quantification des NET dans les images d'immunofluorescence.

Tags

Keywords: NETQUANT Automated Image Analysis Neutrophil Extracellular Traps (NETs)Immunofluorescence Imaging Image Segmentation Adaptive Segmentation DNA Channel NET Channel Sample Types Batch Processing Image Metadata Zenodo Nordonfelt Lab

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