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Quantificação automatizada baseada em imagem de armadilhas extracelulares de neutrófilos usando NETQUANT

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Imunologia e Infecção

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JoVE Journal Imunologia e Infecção

Automated Image-Based Quantification of Neutrophil Extracellular Traps Using NETQUANT

Quantificação automatizada baseada em imagem de armadilhas extracelulares de neutrófilos usando NETQUANT

DOI:

10.3791/58528-v

•

07:33 min

•

November 27, 2019

•

Tirthankar Mohanty, Pontus Nordenfelt

¹Department of Clinical Sciences, Division of Infection Medicine,Lund University

Capítulos

00:04Título
00:34Analysis and Quantification of Neutrophil Extracellular Traps (NETs)
02:19Segmentation of Cells in the DNA Channel and the NET Channel
03:41Single-cell Analysis of Identifiable Properties
04:19Comparison of Cell Properties to Identify NET-forming Cells
05:23Result Outputs Demeanor
06:16Results: Analysis of NET Formation
07:07Conclusion

Summary

Tadução automática

Aqui, apresentamos um protocolo para a geração de armadilhas extracelulares de neutrófilos (NETs) e a operação NETQUANT, uma opção de software totalmente automática para quantificação de NETs em imagens de imunofluorescência.

Tags

Keywords: NETQUANT Automated Image Analysis Neutrophil Extracellular Traps (NETs)Immunofluorescence Imaging Image Segmentation Adaptive Segmentation DNA Channel NET Channel Sample Types Batch Processing Image Metadata Zenodo Nordonfelt Lab

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