Proteine ​​Isolamento dal Sviluppare embrionali di topo Cuore Valve Regione

Summary

The analysis of protein expression in young embryonic mouse valves has been hampered by the limited tissue available. This manuscript provides a protocol for preparing protein from developing embryonic mouse valve regions for western blot analysis.

Abstract

Western blot analysis is a commonly employed technique for detecting and quantifying protein levels. However, for small tissue samples, this analysis method may not be sufficiently sensitive to detect a protein of interest. To overcome these difficulties, we examined protocols for obtaining protein from adult human cardiac valves and modified these protocols for the developing early embryonic mouse counterparts. In brief, the mouse embryonic aortic valve regions, including the aortic valve and surrounding aortic wall, are collected in the minimal possible volume of a Tris-based lysis buffer with protease inhibitors. If required based on the breeding strategy, embryos are genotyped prior to pooling four embryonic aortic valve regions for homogenization. After homogenization, an SDS-based sample buffer is used to denature the sample for running on an SDS-PAGE gel and subsequent western blot analysis. Although the protein concentration remains too low to quantify using spectrophotometric protein quantification assays and have sample remaining for subsequent analyses, this technique can be used to successfully detect and semi-quantify phosphorylated proteins via western blot from pooled samples of four embryonic day 13.5 mouse aortic valve regions, each of which yields approximately 1 μg of protein. This technique will be of benefit for studying cell signaling pathway activation and protein expression levels during early embryonic mouse valve development.

Introduction

Essere in grado di identificare e quantificare i livelli di espressione della proteina è una tecnica standard per ragioni sanitarie e di esperimenti basati su celle. Tuttavia, nonostante una lunga interesse per lo sviluppo della valvola cardiaca embrionale precoce, valutando l'espressione della proteina in questo tessuto specifico durante lo sviluppo è attualmente limitato a immunoistochimica sia il pulcino e il mouse ^1,2. Parte della difficoltà di quantificare l'espressione della proteina nelle valvole di sviluppo della maggior parte degli organismi modello (ad esempio, ceci e topo) è la piccola dimensione delle valvole, che limita la quantità di proteine ​​che si possono ottenere. Così, per analisi quantitative, i ricercatori in genere si basano su l'estrazione dell'RNA e l'amplificazione per la successiva PCR quantitativa o analisi microarray ^2-5. Tuttavia, i livelli di espressione di RNA e proteine ​​non sono del tutto correlativo ^6, in modo da concentrarsi su espressione di RNA non è in grado di fornire una rigorosa conto dei numerosi cambiamenti che si verificano in una determinata segnalazionepercorso in diversi momenti durante l'evoluzione. Sulla base di questo limite nella metodologia attualmente disponibili, l'obiettivo di questa procedura è stato quello di sviluppare un protocollo per ottenere in modo affidabile una quantità sufficiente di proteine ​​dalle embrionali di topo in via di sviluppo le regioni valvola cardiaca per l'analisi quantitativa dei cambiamenti che si verificano in diverse vie di segnalazione che sono importanti in la maturazione di questo tessuto.

Le valvole embrionali sono già comunemente dissezionati da topi per l'isolamento di RNA e la successiva analisi di espressione genica ^2-5. Tuttavia, questi studi si sono limitati a usare l'espressione genica come out lettura di segnalare l'attivazione della via, che non consente il rilevamento di rilevare modificazioni post-traduzionali di proteine ​​che possono influenzare la segnalazione a valle. Utilizzando le tecniche di isolamento dell'RNA come punto di partenza, abbiamo iniziato con dissezione delle regioni di interesse. Perché il nostro interesse è stato rilevando proteine ​​fosforilate che erano indicativi di pat segnalazioneattività HWAY durante un periodo specifico di sviluppo della valvola aortica (E13.5-14.5), abbiamo effettuato tutte le dissezioni in tampone Tris senza fosfati e raccolto le valvole in un tampone di lisi a base di Tris con inibitori della proteasi e fosfatasi. Nel nostro caso specifico, solo le regioni valvola aortica sono stati raccolti, ma la regione valvola polmonare possono essere facilmente ottenuti allo stesso tempo. Le regioni valvole erano poi omogeneizzato e combinato con un tampone che viene attualmente utilizzato per studiare l'espressione della proteina in valvole cardiache adulte ^7. Utilizzando piccoli volumi di campione (ad esempio, 2 microlitri) e la messa in comune delle regioni valvole da embrioni con lo stesso genotipo, siamo stati in grado di rilevare le proteine ​​fosforilate e nonphosphorylated al giorno embrionale 13.5 ^8. Poiché le regioni di valvole possono essere congelati e conservati in tampone di lisi, gli embrioni possono essere genotipizzati se necessario prima di pooling.

Questa tecnica amplia il set di strumenti che sono disponibili per la valutazione signalin cellulareg percorsi durante lo sviluppo e fornisce un complimento quantitativo di immunoistochimica, specificatamente per le valvole cardiache in via di sviluppo. Questa tecnica dovrebbe essere di beneficio non solo ai cardiologi di sviluppo, ma anche a tutti i biologi dello sviluppo che lavorano con gli embrioni in fase iniziale sono interessati nelle regioni che contengono tessuti limitata.

Protocol

NOTA: Tutti gli esperimenti sono stati approvati dalla cura e uso degli animali Comitato Istituzionale presso l'Università del North Carolina a Chapel Hill. 1 Excise della valvola aortica Utilizzando una tecnica di eutanasia approvato per la fase embrionale di interesse, eutanasia di un mouse incinta con cuccioli al giorno embrionale desiderata (E) dello sviluppo. Utilizzare etanolo al 70% per sterilizzare l'addome della femmina incinta. Sollevare la pelle ei mu…

Representative Results

Utilizzando questa tecnica di preparazione, siamo stati in grado di rilevare fosforilata Smad 1,5,8 (pSmad) nelle singole regioni della valvola aortica da E13.5 embrioni. Come mostrato nella Figura 1A, la proteina isolata da anche una sola regione valvola è sufficiente per rilevare una banda pSmad debole. Intensità del segnale aumenta in proporzione al numero di regioni valvole che vengono pool. È importante sottolineare che il / rapporto β-actina pSmad rimane pressoché costante tra le d…

Discussion

La capacità di quantificare i livelli di proteine ​​nei primi mesi del topo embrionale e pulcino regioni della valvola cardiaca fornisce un ulteriore strumento per la comprensione degli eventi di segnalazione cellulari critici per lo sviluppo della valvola. Il nostro protocollo qui descritto non differisce molto da procedure di isolamento delle proteine ​​standard. Tuttavia, modificando alcuni passaggi chiave, abbiamo ottenuto con successo proteine ​​fosforilate da estremamente campioni di piccole dimension…

Materials

Name of Reagent/ Equipment	Company	Catalog Number	Comments/Description
Timed-pregnant mouse			To be dissected at the embryonic stage of interest
Stereoscopic microscope	Nikon	SMZ645
0.1 M Tris, pH 7.6
Microscissors	Fine Science Tools	15003-08
Fine forceps, #5	Fine Science Tools	11251-30
Dissecting needle holders	Ted Pella Inc.	13560
Dissecting needles	Ted Pella Inc.	13561-10
Micropipette, 20 μl, with tips
Lysis buffer			50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 150 mM NaCl, 5 mM EDTA, 1% Triton
PhosSTOP	Roche	4906845001	Add 1 tablet to 10 ml lysis buffer
TissueLyser LT	Qiagen	85600
Stainless steel beads	Qiagen	69989
Microcentrifuge