Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Neuroscience

İnsan Subcortex yüksek çözünürlüklü yapısal Manyetik Rezonans Görüntüleme Published: December 30, 2015 doi: 10.3791/53309

Abstract

Bu çalışmanın odak noktası, insan beynini canlı kıyasla postmortem beyin yapısal MRG çözünürlüğü sınırlarını test etmek oldu. In vivo yapısal MR çözünürlüğü sonuçta nabız, solunum ve baş hareketi de dahil olmak üzere fizyolojik gürültü ile sınırlıdır. Görüntüleme donanımı geliştirmeye devam etmekle birlikte, bu milimetre ölçeğinde yapıları çözmek için hala zor. Örneğin, lateral genikulat nükleus primer görsel duyu yolları sinaps (LGN), normalde altı içe geçmiş tek gözlü katmanlar halinde organize talamus görsel röle ve kontrol çekirdeği. Beyin görüntüleme çalışmaları güvenilir az 1 mm kalınlığında olan kendi küçük boyutu nedeniyle bu katmanları ayırt etmek mümkün olmamıştır.

Bir otopsi beyinde yapısal MR çözme limiti kullanarak birden çok görüntü bir uzun süreli (~ 24 saat) üzerinde ortalama test edildi. Amaç bireysel l çözmek mümkün olup olmadığını test etmek olduFizyolojik gürültü yokluğunda LGN ve ayers. Bir proton dansite (PD) 1 ağırlıklı darbe dizisi kayıtlı olması gereken görüntülerin asgari sayısını belirlemek için çözünürlük ve diğer parametreler değişen kullanılan ve güvenilir LGN ve diğer subkortikal bölgeler ayırt etmek ortalaması alındı. Sonuçlar ayrıca insan beyni canlı edinilen görüntüler karşılaştırıldı. In vivo konular klinik uygulamalarda yararlı subkortikal yapıları, ayırt etmek için gerekli PD taramaları minimum sayıda fizyolojik gürültü ek etkilerini belirlemek amacıyla tarandı.

Introduction

Bu araştırmanın amacı, fizyolojik gürültü yokluğunda yapısal MR çözünürlüğü sınırlarını test etmek oldu. Proton dansite (PD) ağırlıklı görüntüler kayıtlı olması gereken görüntülerin asgari sayısını belirlemek için bir uzun süreli (iki ~ 24 saat oturumları) üzerinden bir postmortem beyin edinilen ve subkortikal yapıları çözmek için ortalaması alınmıştır. Karşılaştırma için, PD ağırlıklı görüntüler de seans bir dizi üzerinden insanları yaşayan elde edilmiştir. Özellikle, amaç yaklaşık 1 mm kalınlığında (Şekil 1) insan LGN tüm altı ayrı katmanları, çözmek için en iyi senaryo mümkün olup olmayacağını anlamak için oldu.

figür 1
Şekil 1. İnsan lateral genikulat Nucleus katmanları. LGN laminer yapısının şematik. Magnoselüler (M) tabakaları daha büyük bir nöronal oluşmaktadır(koyu gri tasvir katmanlar 1-2) Hareket ve ders hatlarını çözmekle sorumludur hücre boyutu ve küçük hücre yoğunluğu. Parvoselüler tabakalar (P) (açık gri olarak tasvir tabakalar 4-6) ince formu ve renk giderme sorumlu olan küçük nöronal hücre boyutuna ve daha büyük hücre yoğunluğunda oluşmaktadır. Ölçek çubuğu 1 mm. Lekeli insan LGN 12 dayanan Şekil.

Matris boyutu arttığında MRI Mekansal çözünürlük artırıldı ve görüş alanı-(FOV) ve dilim kalınlığı azaldığı zaman. Ancak, artan çözünürlük voksel hacmi ile orantılıdır gürültü oranı (SNR), sinyali azaltmaktadır. SNR de ölçümlerin sayısının kare kökü ile orantılıdır. Birden fazla görüntü ayrı görüntüleme oturumları bir dizi üzerinden elde edilebilir, ancak yaşayan insanlarda, nihai çözünürlük gibi solunum, dolaşım pulsasyonu ve baş hareketi gibi, fizyolojik gürültü ile sınırlıdır.

Yüksek-resolution (0.35 mm düzlem vokseller) ağırlıklı taramalar elde edildi PD. PD taramaları talamus 1 gri ve beyaz kontrastı geliştirmek ve T 1 ve T 2 etkilerini en aza indirmek görüntüleri sonuçlanır. Bu görüntü, görüntü hacminin protein ve yağ olarak, su ve makro moleküllerin şeklinde proton yoğunluğuna bağlıdır. Nedeniyle mıknatıslanma 2 yüksek boyuna bileşeni için resmin üzerine parlak bir sinyalde bir doku sonuçlarında protonların sayısının artması.

Onlar doku çevreleyen subkortikal yapıların daha yüksek bir kontrast sağlar çünkü PD ağırlıklı taramalar toplanmıştır. Böyle T1 ve T2 ağırlıklı görüntülerde gibi diğer zıtlıklar, 1,3 ƒ belirlenen nedeniyle küçük kontrast-gürültü oranları LGN gibi subkortikal yapılar ortaya koymaya zorluk neden olur.

Aynı şekilde, daha önceki çalışmalarda formalin o PD ağırlıklı görüntüler otopsi beyin resulte sabit bulundugri ve beyaz madde arasındaki daha yüksek kontrast farklılıkları d T1 ve benzeri gri ve beyaz cevher görüntü yoğunluklarını 3,4 vardı T2 ağırlıklı görüntüler karşılaştırıldığında. Altta yatan biyofizik belirleyicileri bu farklılıkları açıklayabilir. Hidrojen protonların (boyuna) T1 ve T2 (enine) gevşeme süreleri doku içinde nasıl su hamle bağlıdır. Bu tür çapraz bağlama proteinleri, formalin çalışma gibi sabitleyiciler. Fiksatifler kullanıldığında su hareketlilik arasındaki farklar, farklı doku tiplerinin arasında azalır. Azaltılmış T1 doku kontrast, fiksasyon sonra görülmüştür iyi kontrast farklılaşma 3, 4 sağlayan tespit ile artan beyin dokularının içindeki protonların görece yoğunluğu farklılıkları, oysa.

Önceki çalışmalar 1.5 T 5,6,7 kullanarak PD ağırlıklı taramalar LGN tespit ve 3 T tarayıcı 8,9 de var. Bu tam kapsamını ana hatlarıyla muktedir bu taramaları elde etmek önemlidirLGN. Subkortikal çekirdekler tam kapsama korumak için, 18 PD ağırlıklı dilimler talamus içinde elde edildi. Her birim, iki çözünürlüğü 1024 matrisin yeniden örneklenmiş (0,15 mm düzlem voksel boyutu), Zincirleme, hareket düzeltilir ve subkortikal yapıların yüksek çözünürlüklü 3 boyutlu görüntü üretmek için ortalama edildi. Aşağıdaki dilim reçete için gerekli olan PD görüntülerin optimum sayıda yaşayan insanlar daha az 15 dakika tarama zamanı azaltarak, 5 oldu. Sadece 1 PD görüntüsü az 3 dakika tarama süresini azaltmak, açık bir şekilde ölüm sonrası beyinde subkortikal bölgeleri ayırmak için gerekli olan (Şekil 2 ve 3).

Bütün bir formalin ile fikse postmortem beyin numunesi 82 ​​yıl yaşta kardiyopulmoner arrest ölmüştü bir kadının tarandı. Tıbbi kayıtların gözden ortaya o vardı: kronik obstrüktif akciğer hastalığı, anjin, üçlü bypass cerrahisi 8 yıl önce ölüm, rahim kanseri histerektomi ile tedavi7 yıl ölüm, hiperlipidemi, glokom, katarakt ve ameliyat öncesinde. Ölüm sonrası beyin numunesi aynı görüntüleme protokolü ile hem de görüntü kalitesi karşılaştırmaları için pek çok saat boyunca, diğer parametreler gibi taranmış, 4 ° C gibi ölüm sonrası beyin en az 3 hafta boyunca% 10 nötr tamponlu formalin içinde sabitlendi daldırma . Sadece optimize parametreler protokol için tarif edilecektir.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

1. Katılımcı ve Postmortem Beyin Takımı-Up

NOT: Tüm görüntüler 32 kanallı kafa bobini ve tüm MR tarama ile 3 T MR tarayıcı kullanılarak elde edildi, oda sıcaklığında yaklaşık 20 ° C gerçekleştirildi. Tüm katılımcılar sağ elle ve yazılı bilgilendirilmiş onam alındı. Her katılımcı nörolojik bozukluklar öyküsü olmayan sağlıklı oldu. Deney protokolü onayladı ve York Üniversitesi İnsan Katılımcılar İnceleme Komitesi'nin yönergeleri takip edildi.

  1. Her katılımcı doldurun ve MRG güvenlik talimatları ve nöro-görüntüleme protokolü detayları hasta onam formu imzalamanız değildir.
  2. Her bir katılımcı için, her kulakta kulaklıklar yerleştirin ve kafa hareketini en aza indirmek için yastıkları ile başını sabitleyin.
  3. Postmortem beyin görüntülemesi için, beyin beyin görüntüleme öncesinde sabittir ve MR kafa bobin dahilinde bir torba veya kap içinde bulunan emin olun. Onun z ekseni ile baş bobin postmortem beyin yerleştirin (üstün inf içinerior) tarayıcının bir delik ile hizalanır. Beyin sapı (posterior) tarayıcı yatağın ayak doğru bakmalıdır.
  4. Ek destek için postmortem beyin çevresinde vakum yastık eller yerleştirin.

2. yerelleştirme ve Subcortex Reçete

NOT: talamus orta beyin ve serebral korteks arasında yer alan beyin merkezinin yakınında bulunan bir çift loblu yapıdır. Dorsal talamus içinde yer alan, insan LGN ~ 10 mm maksimum uzanan küçük subkortikal yapıdır.

  1. Yeni bir katılımcı kaydetmek için, MR görüntüleme yazılımı açın ve sol üst köşesindeki Hasta sekmesine tıklayın. Sonra Register tıklayın.
  2. Uygun hasta bilgileri doldurun ve sonra Sınav sekmesine tıklayın.
  3. Bir Localizer tarama elde etmek için, yeni bir protokol oluşturmak için Sınav Explorer sekmesine tıklayın. Ekranda set-up penceresi gözlemleyin Rutin sekmesini tıklatın ve aşağıdaki parametreleri girin: edinimisüresi 28 sn, satın alma matrisi 160 × 160, 1 dilim, 1.6 mm kalınlığında izotropik voksel boyutu, FOV = 260 mm, FoV faz =% 100, dilim çözünürlüğü =% 69, evre ve kısmi fazı dilim Fourier = 6/8, TR = 3.15 ms, TE = 1.37 msn, Açı = 8 ° çevirin.
  4. (Şekil 4) talamus içindeki subkortikal çekirdekler kapsayan Localizer üzerinde PD görüntüleri elde yanı sıra yapıları çevreleyen için kullanılan dilim seçim kutusunu Yerleşimi.

3. Yüksek çözünürlüklü Yapısal Parametreleri

  1. Yüksek çözünürlüklü PD ağırlıklı taramalar elde etmek için yeni bir protokol oluşturmak. , TR edinimi süresi 179 sn, satın alma matrisi 512 × 512, 0.3 × 0.3 × 1 mm 3 voksel boyutu = 3.25 sn: Ekranda set-up pencerede, Rutin sekmesini tıklatın ve koronal yönde aşağıdaki parametreleri giriniz TE = 32 msn, çevirme açısı = 120 °, Interleaved dilim edinimi, FoV ile = 160 mm, FoV faz =% 100, paralel görüntüleme (GRAPPA) okumak2 bir ivme faktörü.
    1. 32 msn de 5. birinci yankı bir Echo Tren Uzunluk, Turbo Spin Echo dizisini kullanın, bu dizi için etkili yankı olduğunu. SNR maksimize etmek, minimum, 40 Hz / piksele bant genişliği (BW) azaltın. Bir FOV = 160 mm, her 1 mm kalınlığında, tarama süresini azaltmak 18 dilim seçin. Bu levha ilgi subkortikal bölgelerinin yeterli kapsama alanı sağlar.
      , Subkortikal yapıların güvenilir tanımlanması için yukarıda belirtilen parametreler ile 5 çalışır elde: NOT. Toplam tarama süresi sadece ~ 15 dk (Şekil 5). Yağ doygunluk istihdam değildi.
  2. Postmortem beyin görüntülemede, subkortikal yapıların güvenilir kimlik 3,1 (Şekil 6) aynı tarama protokolü takip yalnızca ~ 3 dakika toplam süresi ile sadece bir tarama görülebilir.

4. Görüntü Analizi

NOT: kullanımı, serbestçe kullanılabilir FMRIB en MRG verileri analiz etmekYazılım Kütüphanesi indirmek için de kullanılabilir (FSL) paket (https://www.fmrib.ox.ac.uk/fsl/).

  1. Bir terminal penceresi açın ve NIfTI dönüştürücü bir DICOM ile NIfTI formatında her PD hacmi tarayıcıdan ham DICOM dosyalarını dönüştürebilirsiniz. Bir dizi indirmek için serbestçe kullanılabilir (örn., Https://www.nitrc.org/projects/mricron). Komut satırında, her PD ağırlıklı görüntü çalıştırmak dizine izledi dcm2nii yazın.
  2. Bir terminal penceresi orijinal PD taramanın parametrelerini elde. NIfTI formatında PD tarama ardından komut satırına fslinfo yazın.
  3. Iki çözünürlük ve özgün PD tarama fslinfo parametrelerle tarafından verilen yarım voksel boyutuna sahip yüksek çözünürlüklü boş görüntü hedef birimi oluşturun. Aşağıdaki gibi bu komutun veri girişlerinin düzeni vardır:
    fslcreatehd <xsize> <ysize> <zboyutu> <tsize> <xvoxsize> <yvoxsize> <zvoxsize> <tr> <xorigin> <yorigin> <zorigin> <veri türü> <headername>
    NOT: 3.1 tarif edildiği gibi aşağıdaki parametrelerle orijinal PD tarama toplanır Örneğin, (yani, 512 × 512 matrisi, 18 dilim, 0.3 × 0.3 × 1 mm 3 voksel boyutu, TR = 3.25 ler), aşağıdakileri yazın Komut penceresi içine:
    fslcreatehd 1024 1024 36 1 0,15 0,15 0,5 3,25 0 0 0 4 blankhr.nii.gz
  4. Bir kimlik matrisi kullanılarak dönüşümü tanımlayın. Bir metin dosyası bu gibi görünüyor 'identity.mat' olarak kaydedilmiş herhangi bir metin editörü programı yazın:
    0 0 0
    1 0 0
    0 1 0
    0 0 1
  5. 1024 matris bir 512 toplam çözünürlüğü iki katına her orijinal PH ağırlıklı çalıştırmak upsampling, dönüşümü uygulamak için flört komutunu kullanın ve 0.15 × 0.15 çözünürlükte sonuçlanan her boyutta voksel boyutunu yarıya0.5 mm 3 ×. Her PD hacmi için bir terminal penceresinde, çalıştırmak başına orijinal ve çıkış adlarını değiştirme aşağıdaki flört komutu yazın:
    -interp sinc -in originalPD.nii.gz rEF blankhr.nii.gz -applyxfm -init identity.mat -kasa highresPD.nii.gz flört
    NOT: originalPD.nii.gz kaynak hacmi, istenen çıkış çözünürlüğü blankhr.nii.gz ve highresPD.nii.gz çıkış birimin adıdır.
  6. Yeni bir klasöre tüm yüksek çözünürlüklü görüntüler taşıyın ve bir terminal penceresinde ona gidin.
  7. Her bir katılımcı için, fslmerge kullanarak tek bir 4D dosyası içine tüm altörneklenmez PD görüntüleri birleştirmek. Bir terminal penceresi türü:
    fslmerge -t concat_highresPD * .nii.gz
    NOT: Bu concat_highresPD.nii.gz adında bir 4D dosya oluşturur.
  8. Hareket mcflirt 10 kullanılarak birleştirilmiş dosyayı düzeltin. Bu araç, doğrusal (affine) için otomatik bir sağlam kayıt arası ve kurumlar arası modal beyin görüntüler için izin verir. SeçinDaha doğru bir başka optimizasyon pass sinc enterpolasyon (dahili) kullanır 4 aşamalı düzeltme. Bir terminal penceresi türü:
    mcflirt -in concat_highresPD -kasa mcf_concat_highresPD.nii.gz -stages 4 -plots
    NOT: Bu mcf_concat_highresPD.nii.gz adında bir 4D dosya oluşturur.
  9. Son olarak, 3D görüntü kullanarak fslmaths ortalama oluşturun. Bir terminal penceresi türü:
    fslmaths mcf_concat_highresPD.nii.gz -Tmean mean_highresPD.nii.gz
    NOT: Bu yüksek kaliteye sahip mean_highresPD.nii.gz adında bir 3D dosya oluşturur
  10. Fslview komutunu kullanarak nihai sonucu 3D yüksek çözünürlüklü görüntü gözünüzde canlandırın. Görüntü olduğu dizinde, bir terminal penceresinde aşağıdaki komutu yazın:
    fslview mean_highresPD.nii.gz. "
  11. Söz konusu İB'nin yoğunluk profillerini kontrol edin. Fslview kullanarak bir yatırım getirisi oluşturma (bu örnek için LGN bir bölgede çekilen dikey bir çizgi olabilir). Fslview yüksek çözünürlüklü PD resim yüklemek. Araçlar sekmesine tıklayın,Daha sonra İB'leri çizim görüntüyü büyütmek için tek bir görüntü sekmesine tıklayın. Ardından, Mask oluşturun sekmesine ve ardından Dosya sekmesini tıklatın. Ilgi ROI bir çizgi çizin. Daha sonra Kaydet Dosya tıklayarak yatırım getirisini kaydedin. Yoğunluk karşılaştırmalar ve söz konusu diğer ROI'ler için ROI içinde birden fazla alanlar için hat maskeleri tekrarlayın.
  12. Görüntünün elde edilen yoğunluğu analiz AFNI en 3dmaskdump komutunu kullanın. Görüntüler, görüntü yoğunluklarını ve konumunu ayıklamak için bir terminal penceresinde aşağıdaki komutu kullanın nerede dizininde YG maskenin (result_mask.txt olarak verilen):
    3dmaskdump -o result_mask.txt -noijk -xyz -Maske ROI_linemask.nii.gz PDaverage_image.nii.gz

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

Subcortex talamus içinde reçete edildiğinde, PD ağırlıklı görüntüler dilim seçim kutusunu (Şekil 4) içinde toplanır. SNR hem postmortem ve in vivo tarar ortalamalara sayısını artırarak geliştirilebilir. Görüntü kalitesini belirlemek için, farklı tarama ortalamalarından SNR beyin dışında bazı alanlarda standart sapma ile ortalama beyin bölgesi sinyalini bölerek karşılaştırıldı. SNR SNR olarak hesaplanmıştır = 0.655 * doku / σ doku beyin bölgesi içinde bir ROI ortalama piksel yoğunluğu değerini gösterir u hava 11, σ hava arka plan havada bir ROI gürültü standart sapma gösterir u gölgelenme eserler ücretsizdir ve 0.655 faktör bir büyüklük Resimdeki arkaplan gürültüsünün Rician dağılımı (Şekil 2) gösterir görüntü. Postmortem beyin net demarca gösterir5 PD ağırlıklı ortalama görüntüleri (~ 15 dk) subkortikal yapıların net çizme göstermek için in vivo beyin için gerekli olan minimum ise sadece 1 PD ağırlıklı hacmi (~ 3 dk kazanım süresi) subkortikal yapıların yon, (Şekil 3) . In vivo 5 hacim ortalama 40 birim ortalamasından (Şekil 5) 'e benzer açık subkortikal detay gösterdi; Tek bir postmortem hacmi 100 hacim ortalama (Şekil 6) benzer ayrıntı gösterdi. Biz maksimum ortalama tarama (in vivo 40, 100 postmortem) için hat yoğunluk profili çizilmiştir. Sol ve sağ vivo lgn açıkça altı katman karşılık gelen yoğunluk 6 zirveleri göstermektedir. Bu gürültü nedeniyle sadece sahte sonuç değildi emin olmak için, her aynı zirveleri gözlemleyerek, farklı yatay pozisyonlarda lgn başına üç satır profilini ölçülür. Lgn olarak, katmanlar arasında alanlarda daha az hücre gövdeleri ve daha az yoğun ve inci olması beklenir erefore düşük PD yoğunluğunu göstermektedir. Otopsi Beyinde, katmanlar atfedilebilir şiddeti hiçbir varyasyon (Şekil 7) oldu. Vivo ve MRG edinimi yukarıdaki protokolü izleyen bir ölüm sonrası beyinde birinden Temsilcisi sonuçları karşılaştırılmıştır.

Şekil 2,

Postmortem ve in vivo beyin Görüntüler sayı PD ağırlıklı ortalamalara SNR Şekil 2. karşılaştırılması. SNR (gri gösterilir) hem postmortem taramalar ortalamalara sayısını artırarak ve in vivo tarar düzelmiştir (siyah gösterilir) . Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

Şekil 3,

_content "> Şekil in vivo ve Postmortem Beyin Görüntüleri 3. Doğrudan karşılaştırılması.   (A) sütununda 1 koronal dilim (in vivo) ve sütun aynı parametrelerle 5 PD hacmi ortalamasının 2 (postmortem) beyin. (B) 4 PD hacmi, ortalama, (C) 3 PD hacmi, ortalama, (D) 2 PD hacmi, ortalama, (E) 1 PD hacmi. Postmortem beyin 1 PD hacmi subkortikal yapıların net çizme gösteriyor, oysa in vivo beyin, 5 PD ortalamalar subkortikal yapıların net çizimini göstermektedir. Hem in vivo ve postmortem beyin Panel A'da Beyaz ölçekli çubukları 10 mm, ve beyaz oklar LGN hakkının yerini göstermek ve sol. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

"Şekil

4. PD Dilim Seçim sınırlarını Şekil. Anatomik görüntünün Sagittal görünümü LGN ve beyin sapını içeren talamus çevreleyen dilim Seçim sınırını (beyaz çizgiler) gösteren bir canlı insan beyninde. Dilim Seçim sınırı 18 dilim oluşan PD görüntü kütüğün toplamak için bir şablon olarak kullanıldı, her 1 canlı insanlarda kalın mm ve aynı zamanda postmortem beyin. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

Şekil 5,
In vivo Beyin Görüntüler Şekil 5. (A) kadın (yaş 27) 5 PD hacmi tarar ortalamaların koronal dilim. Edinimi zaman = 179 s, 512 matris bant genişliği = 40 Hz / px, TR = 3.25 s, TE = 32 ms, 18 dilim, 0.3 & #215; 0,3 × 1 mm 3 vokselden [0.15 × 0.15 × 0,5 mm 3 vokselden Upsampling]. Lgn ve diğer subkortikal yapıların Temizle tarif görülmektedir. (B), aynı beyin koronal kesit (A) 'daki ile aynı görüntüleme parametreleri ile, aynı oturumda (toplam satın alma ~ 2 saat) 40 PD hacim ortalama. (A) ve (B) için büyütülmüş görüntüsü Beyaz ölçekli çubukları 10 mm, ve beyaz oklar LGN hakkının yerini göstermek ve sol. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

Şekil 6,

Şekil 6. Postmortem Beyin Görüntüleri (A) 1 PD hacmi tarama edinilen postmortem beyin koronal dilim. Kazanım süresi = 179 saniye, 512 matris bant genişliği = 40 Hz / px, TR= 3.25 sn, TE 32 ms, 18 dilim, 0.3 × 0.3 × 1 mm 3 vokselleri [altörneklenmez 0.15 × 0.15 × 0,5 mm 3 vokseller] =. Subkortikal yapıların Temizle tarif görülmektedir. Beyaz ölçek çubuğu 10 mm ve beyaz oklar sağ konumunu belirtmek ve LGN bıraktı. Anterior pulvinar çekirdeğinin (Apul), CA1-CA3 alanları: postmortem beyin (B) Koronal dilim subkortikal yapıların net çizilmesi ile, 100 PD (~ 5 saat tarama süresi) A. Zoomed görünümde aynı dilim reçete ile hacimlerde ortalama hipokampus, lateral genikulat nükleus (LG), medial genikülat çekirdeği (MG), pulvinar (Pul), talamik retiküler nükleus (Rt), ventral posterior talamik nükleus (VPL). Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

Şekil 7,

in vivo rong> Şekil 7. LGN Hattı Yoğunluk Profilleri. Hat yoğunluğu profilleri LGN (mavi), sağ LGN (yeşil) sol ve ölüm LGN (kırmızı) ve sağ LGN (siyah) sol sonrası. Bu çizgiler, maksimum ortalamalar (in vivo 40, 100 ölüm sonrası) içindir. Sol ve sağ vivo lgn açıkça altı katman karşılık gelen yoğunluk 6 zirveleri göstermektedir. Gürültü ekarte etmek için, LGN sol için ve sağ in vivo üç çizgi profilleri net korelasyon gösteren farklı yatay pozisyonlarda ölçüldü. Sol ve postmortem LGN katmanları atfedilen olabilir yoğunluğu gözlemlenebilir doruklarına sergilemek vermedi sağ. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

Bu çalışma subkortikal bölgelerin yüksek çözünürlüklü PD ağırlıklı görüntüler elde etmek için satın alma ve analiz tekniğinde optimize edilmiş bir protokol tanımlamaktadır. Tarama parametrelerinin bir dizi test edilmiş ve SNR artırmak ve satın almalar sayısını yüksek çözünürlüklü subkortikal yapıları belirlemek için güçlü olmak önemli bir adım azaltmak için matris boyutu, voksel boyutu ve bant genişliği ile ilgili en önemli olanları ile modifiye edilmiştir. Yaşayan insanlar içinde en uygun parametreler bulma ile birlikte, bu araştırma bir postmortem beyin tarayarak hareket eserler ve hasta zaman kısıtlamaları endişe etmeden, ideal koşullarda MRI tarayıcısı mutlak sınırlamalar test etti. Bundan sonraki çalışmalarda, bu yüksek çözünürlüklü görüntü kesit ve numune boyamadan önce bir şablon olarak kullanılabilir.

Önceki çalışmalar yüksek çözünürlüklü PD yapısal görüntüleme için uygun dinlenme süreleri ve optimal protokolleri nitelendirdiler1.5 T 3,13 için formalin ile fikse otopsi beyinleri. Bu çalışmada parametreler klinik optimal azaltılmış tarama süresi, izin, hangi optimize edildi. Biz başarıyla sol ve sağ LGN in vivo ortalama taramada maksimum hat yoğunluğu profillerini rapor. Biz maksimum ortalama tarama (in vivo 40, 100 postmortem) için hat yoğunluk profili çizilmiştir. Sol ve sağ vivo lgn açıkça altı katman karşılık gelen yoğunluk 6 zirveleri göstermektedir. Gürültü ekarte etmek için, biz lgn başına üç satır profil ölçümleri ölçtük.

LGN yükseklikleri bildirildi yanı sıra LGN hacminde bir azalma glokom grubunda 8 bildirildi, kontrollere 7 göre azalış nerede son insan MRG çalışmaları glokom popülasyonlarında lgn atrofi bildirmişlerdir. Olanlar bizim çalışmamızda değerlendirme için edinilen varlık olarak Her iki çalışmada da görüntülerin net olmadığını sınırlıdır. T olmasına rağmenO katmanlar açıkça optimum protokolün 100 hacimleri kazandıktan sonra postmortem beyin gözlenmemiştir lgn (~ tarama süresinin 5 saat) LGN tabakaları yeterince ölüm sonrası ortalama bulunmayan neden farklı olasılıklar bir dizi açıklayabilir. Örneğin, orada çok çok fazla 1 mm kesit kalınlığı, tespit işleminden bulanıklık, hacim-hacim kaydından bulanıklık, yetersiz SNR ve / veya arası laminer kontrast olmuştur ve muhtemelen nedeniyle lgn dejenerasyonuna olabilir Bu özel post mortem beyindeki glokom 7,8 kadar. Buna ek olarak, in vivo beyin kontrolü kantitatif analiz hakkını bulundu ve tüm beyin hacmi 1364,47 cm3 iken LGN hacimleri sırasıyla 167,94 mm 3 ve 168,13 mm 3 idi bıraktı. Post Mortem sağ ve tüm beyin hacmi 909,62 cm 3 iken LGN hacimleri mm 3 LGN 85 73,11 mm 3 ve vardı bıraktı. Hiçbir dif ortaya çıktıin vivo karşılaştırıldığında LGN otopsisi şeklinde Ference. LGN hacmi ve tüm beyin analiz yöntemlerine dayalı gerçekleştirilmiştir önce 9 bildirdi.

Çalışmamızda ilgi bölgeler içinde bir dilim seçim kütüğü kullanarak tıbbi ortamlarda optimum parametreleri bulundu, ancak bizim teknik bir sınırlama tarama süresini artıracak beri in vivo tüm beyin görüntüleme içerir. Örneğin, 1 hacim 128 dilimleri ile aynı parametrelerle toplanan tüm beyin PD ağırlıklı görüntü postmortem beyin tüm beyin yüksek çözünürlüklü görüntüleme için ideal toplamak için ~ 21 dakika alacaktı. Bununla birlikte, in vivo tespiti için gerekli olan 5 ortalamalar en az ile ~ tarama süresinin 105 dakika gerekli olacaktır.

Sonuç olarak, bu çalışmada açıklanan görüntüleme yöntemleri, insan subcortex gelecekteki deneyler için çoğaltılabilir ve diğer görüntüleme modalit kıyasla en yüksek kalitedeBöyle CT ve PET gibi ies. Görme sistemi LGN dahil, bu tür medial genikülat nükleus, alt kollikulus ve koklear nükleus gibi çoklu-duyumsal subkortikal gibi pulvinar gibi yapılar ve işitsel işleme yapıları gibi subkortikal yapılarda diğer gelecek araştırmalar incelenebilir.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Magnetom Trio 3T  MRI Siemens (Erlangen, Germany).
Vacuum cushion hand Siemens Mat No: 4765454 Manufactured by: Johannes-Stark-Stk. 8 D-92224 Amberg

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Devlin, J. T., et al. Reliable identification of the auditory thalamus using multi-modal structural analyses. NeuroImage. 30 (4), 1112-1120 (2006).
  2. Fellner, F., et al. True proton density and T2-weighted turbo spin-echo sequences for routine MRI of the brain. Neuroradiology. 36 (8), 591-597 (1994).
  3. Schumann, C. M., Buonocore, M. H., Amaral, D. G. Magnetic resonance imaging of the post-mortem autistic brain. J Autism Dev Disord. 31 (6), 561-568 (2001).
  4. Tovi, M., Ericsson, A. Measurements of T1 and T2 over time in formalin-fixed human whole-brain specimens. Acta Radiol. 33 (5), 400-404 (1992).
  5. Fujita, N., et al. Lateral geniculate nucleus: anatomic and functional identification by use of MR imaging. Am J Neuroradiol. 22 (9), 1719-1726 (2001).
  6. Bridge, H., Thomas, O., Jbabdi, S., Cowey, A. Changes in connectivity after visual cortical brain damage underlie altered visual function. Brain. 131 (6), 1433-1444 (2008).
  7. Gupta, N., et al. Atrophy of the lateral geniculate nucleus in human glaucoma detected by magnetic resonance imaging. Br J Opthalmol. 93 (1), 56-60 (2009).
  8. Dai, H., et al. Assessment of lateral geniculate nucleus atrophy with 3T MR imaging and correlation with clinical stage of glaucoma. Am J Neuroradiol. 32 (7), 1347-1353 (2011).
  9. McKetton, L., Kelly, K. R., Schneider, K. A. Abnormal lateral geniculate nucleus and optic chiasm in human albinism. J Comp Neurol. 522 (11), 2680-2687 (2014).
  10. Jenkinson, M., Bannister, P., Brady, M., Smith, S. Improved optimization for the robust and accurate linear registration and motion correction of brain images. NeuroImage. 17 (2), 825-841 (2002).
  11. Dietrich, O., Raya, J. G., Reeder, S. B., Reiser, M. F., Schoenberg, S. O. Measurement of signal-to-noise ratios in MR images: influence of multichannel coils, parallel imaging, and reconstruction filters. J Magn Reson Imaging. 26 (2), 375-385 (2007).
  12. Andrews, T. J., Halpern, S. D., Purves, D. Correlated size variations in human visual cortex, lateral geniculate nucleus, and optic tract. J Neurosci. 17 (8), 2859-2868 (1997).
  13. Pfefferbaum, A., Sullivan, E. V., Adalsteinsson, E., Garrick, T., Harper, C. Postmortem MR imaging of formalin-fixed human brain. NeuroImage. 21 (4), 1585-1595 (2004).

Tags

Nörobilim Sayı 106 MRG postmortem beyin lateral genikulat çekirdeği subcortex glokom
İnsan Subcortex yüksek çözünürlüklü yapısal Manyetik Rezonans Görüntüleme<I&gt; İn Vivo</I&gt; Ve Postmortem
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

McKetton, L., Williams, J., Viviano, More

McKetton, L., Williams, J., Viviano, J. D., Yücel, Y. H., Gupta, N., Schneider, K. A. High-resolution Structural Magnetic Resonance Imaging of the Human Subcortex In Vivo and Postmortem. J. Vis. Exp. (106), e53309, doi:10.3791/53309 (2015).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter