Summary

Um Western que mancha o protocolo para o pequeno número de células-tronco hematopoiéticas

Published: August 22, 2018
doi:

Summary

Um padrão ocidental que mancha o protocolo foi otimizado para analisar apenas 500 tronco hematopoiético ou células progenitoras. Otimização envolve cuidado, manipulação da amostra celular, limitando as transferências entre os tubos e lise diretamente as células no buffer de Laemmli sample.

Abstract

Células-tronco hematopoiéticas (linfócitos) são células raras, com a medula óssea de rato contendo apenas ~ 25.000 fenotípica longo prazo repopulados a linfócitos. Um protocolo de mancha ocidental foi otimizado e adequado para a análise de um número pequeno de linfócitos (células de 500-15.000). Fenotípicos linfócitos foram purificados, contados com precisão e lysed diretamente no buffer de Laemmli sample. Lisado contendo igual número de células foram analisado por eletroforese em gel de poliacrilamida sulfato dodecyl de sódio (SDS-PAGE), e o Borrão foi elaborado e processado seguindo mancha protocolos de padrão ocidental. Usando este protocolo, 2.000-5.000 linfócitos podem ser rotineiramente analisados, e em alguns casos os dados podem ser obtidos de até 500 células, em comparação com as células de 20.000 a 40.000 relatadas na maioria das publicações. Este protocolo deve ser geralmente aplicável a outras células hematopoiéticas e permite a análise de rotina de um número pequeno de células usando os procedimentos padrão do laboratório.

Introduction

Células-tronco hematopoiéticas (linfócitos) são células auto renovadora que podem dar origem a todas as linhagens de sangue. Eles são relativamente raras células na medula óssea, tornando difícil a análises bioquímicas. Abordagens adequadas para a análise de células raras, tais como citometria de fluxo, foram extremamente úteis para quantificar a quantidade relativa de marcadores de superfície celular e proteínas intracelulares. No entanto, a análise de proteínas intracelulares exige o uso de procedimentos de permeabilização celular para permitir o acesso do anticorpo, e nem todos os resumos de superfície de célula sobrevivem nestes procedimentos1,2. Além disso, os anticorpos que discriminem entre proteínas diferentes isoformas ou clivagem produtos muitas vezes não estão disponíveis para citometria de fluxo, e, portanto, os investigadores ainda dependem de borrões ocidentais para determinados tipos de análises.

Análise ocidental do borrão de lisados celulares é um procedimento de rotina na maioria dos laboratórios. Células podem ser purificadas em condições nativas que preservam os epítopos de moléculas de superfície celular, e posteriormente, lisados celulares podem ser preparados e analisados. No entanto, a análise de proteínas em rara célula primária populações por Western blot pode exigir a eutanásia de um grande número de animais para obter células suficientes. Ao fazer pequenos ajustes para vários passos, um protocolo de mancha ocidental convencional foi capaz de detectar proteínas em um número relativamente pequeno de linfócitos (500-15.000, dependendo da proteína de interesse). Os ajustes incluem contando com precisão as células, manipular cuidadosamente o centrifugado, reduzindo as transferências de células entre os tubos para minimizar a perda de células, e lise um número definido de células com uma carga concentrada de buffer contendo Proteassoma e inibidores da fosfatase. Muitos relatórios publicados incluem borrões ocidentais obtidos com 20.000 ou mais linfócitos3,4,5,6,7; Este simples procedimento reduzirá o número de células e animais experimentais necessários para produzir dados equivalentes por entre 4 e 40 vezes. O protocolo visa normalizar os resultados em uma base por célula, ao invés de um controle interno. Isto permite a detecção de globais reduções nos níveis de proteína que podem ser ignorados se dados são normalizados para um controle interno. A importância da normalização em uma base por célula foi descrita para a análise de dados de expressão do gene8, e o mesmo princípio aplica-se a quantificação de proteínas por Western blot. Este protocolo otimizado deve ser útil para qualquer um que precisar analisar um número pequeno de células.

Protocol

Todos os procedimentos devem ser efectuados de acordo com orientações de cuidados e uso animal institucional. O procedimento foi desenvolvido para a análise de murino tronco e progenitoras células hematopoiéticas (linfócitos e HPs), mas pode ser adaptado para a análise de outras populações de células. 1. fluxo Cytometry isolamento de linfócitos murino e HPs Colher células-murino da medula óssea, como descrito na literatura6.Nota: Nos dados apr…

Representative Results

Resultados representativos de 500-2.000 purificada linfócitos e HPs são mostrados na Figura 1 e Figura 2. O sinal de β-actina na Figura 1 pode ser detectado de apenas 500 linfócitos e HPs purificado da medula óssea de um rato. Observe que os lysates de carregamento em poços de 1,5 mm produzido um sinal mais forte de 500 HPs de carregamento em poços de 3,0 mm. A Figura 2</s…

Discussion

Mancha ocidental é uma técnica comum para detecção de proteínas específicas e a ativação das vias de sinalização em tecidos ou células. Através da introdução de pequenos ajustes para um procedimento comumente utilizado, fomos capazes de detectar rotineiramente 15 diferentes proteínas (Tabela de materiais) em 15.000 linfócitos e em alguns casos em até 500 linfócitos. The Most passos críticos no presente protocolo são: 1) com precisão contando as células, 2) minimizando o número de t…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Institutos nacionais de saúde conceder R01 CA149976 (distante) com suporte a este trabalho.

Materials

sodium dodecyl sulfate (SDS) Fisher Scientific BP166-500  SDS-PAGE
TEMED Fisher Scientific BP150-20  SDS-PAGE
30% Acrylamidel Bis solution Bio-Rad 1610158  SDS-PAGE
1.5M Tris-HCl pH8.8 TEKNOVA T1588  SDS-PAGE
1.0M Tris-HCl pH6.8 TEKNOVA T1068  SDS-PAGE
Ammonium Persulfate Fisher Scientific BP179-25  SDS-PAGE
mini-protean 3 comb Bio-Rad 1653360  SDS-PAGE

Mini-PROTEAN Tetra Cell
Bio-Rad 1658005EDU   SDS-PAGE
 Transfer System Bio-Rad 1704155EDU transfer
PowerPac HC Power Supply Bio-Rad 1645052EDU  electrophoresis
Imaging System Bio-Rad 1708195  signal detection
4x Laemmli Sample Buffer Bio-Rad 1610747EDU  sample preparation
10x Tris/Glycine/SDS Electrophoresis Buffer Bio-Rad 1610732EDU  electrophoresis
2-Mercaptoethanol Bio-Rad 1610710EDU sample preparation
 RTA Mini PVDF Transfer Kit, for 40 blots Bio-Rad 1704272  transfer
Protease Inhibitor Cocktail Sigma 11697498001 sample preparation
Phosphatase Inhibitor Cocktailrs Gold Biotechnology GB-450-1 sample preparation
EIF4G Cell signaling 2469 WB antibody, validated in 1000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): Fig2
p-Rps6 Cell signaling 4858 WB antibody,validated in 1000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): Fig2
actin(HRP conjugated) abcam ab49900 WB antibody,validated in 500 cells
antibody concentration: 1:5000
reference(figure): Fig1, Fig2
LC-3 Abcam ab48394 WB antibody,validated in 15000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): ref5 (Fig5)
S6 Cell Signaling 2317 WB antibody,validated in 15000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): ref5 (Fig4)
4EBP1 Cell Signaling 9644 WB antibody, validated in 15000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): ref5 (Fig4)
p-4EBP1 Cell Signaling 2855 WB antibody,validated in 15000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): ref5 (Fig4)
TSC2 Cell Signaling 4308 WB antibody,validated in 15000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): ref5 (Fig4)
HSP90 Cell Signaling 4877 WB antibody,validated in 15000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): ref5 (Fig5)
PTEN Cell Signaling 9188 WB antibody,validated in 15000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): ref5 (FigS1)
mTOR Cell Signaling 2983 WB antibody,validated in 15000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): ref5 (FigS1)
p-mTOR Cell Signaling 5536 WB antibody,validated in 15000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): ref5 (FigS1)
PP2AB Cell Signaling 4953 WB antibody,validated in 15000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): ref5 (FigS1)
p-AMPKa Cell Signaling 2535 WB antibody,validated in 15000 cells
antibody concentration: 1:1000
reference(figure): ref5 (FigS1)
actin Santa Cruz sc-47778 WB antibody,validated in 15000 cells
antibody concentration: 1:3000
reference(figure): ref5 (Fig4)
lineage depletion kit (mouse) Miltenyi Biotec 130-090-858 hematopoietic stem and progenitor cells purification
LS columns Miltenyi Biotec 130-041-305 hematopoietic stem and progenitor cells purification
SCF PeproTech 250-03 phosphorylation stimulation
APC-Cy7 c-kit antibody ThermoFisher A15423 cell sorting
anti-B220 ThermoFisher 48-0452-82 cell sorting
anti-CD3e ThermoFisher 48-0031-82 cell sorting
anti-Mac1 ThermoFisher 48-0112-82 cell sorting
anti-Gr1 ThermoFisher 48-5931-82 cell sorting
anti-Ter119 ThermoFisher 48-5921-82 cell sorting
Spacer Plates with 1.0 mm Integrated Spacers Bio-Rad 1653311  SDS-PAGE
BSA Research Products International A30075 membrane blocking
serum Atlanta Biologicals A12450 medium supplement
cell counter Invitrogen AMQAF1000 cell counting
hemocytometer ThermoFisher  S17040 cell counting
flim Denville Scientific E3012 signal detection
medical film processor Konica SRC-101A signal detection
Supersignal West Femto Maximum Sensitivity Substrate Therom Scientific 34096 signal detection
Allegra X-15R Centrifuge (Rotor SX4750A) Beckman Coulter X-15R sample preparation
BLUEstain protein ladder Gold Biotechnology P007-500 electrophoresis
cell sorter BD FACSAria II sample preparation
Incublock Denville Scientific I0510 electrophoresis

References

  1. Krutzik, P. O., Clutter, M. R., Nolan, G. P. Coordinate analysis of murine immune cell surface markers and intracellular phosphoproteins by flow cytometry. J Immunol. 175 (4), 2357-2365 (2005).
  2. Du, J., et al. Signaling profiling at the single-cell level identifies a distinct signaling signature in murine hematopoietic stem cells. Stem Cells. 30 (7), 1447-1454 (2012).
  3. Signer, R. A., Magee, J. A., Salic, A., Morrison, S. J. Haematopoietic stem cells require a highly regulated protein synthesis rate. Nature. 509 (7498), 49-54 (2014).
  4. Wang, J., et al. A differentiation checkpoint limits hematopoietic stem cell self-renewal in response to DNA damage. Cell. 148 (5), 1001-1014 (2012).
  5. Hoshii, T., et al. mTORC1 is essential for leukemia propagation but not stem cell self-renewal. J Clin Invest. 122 (6), 2114-2129 (2012).
  6. Signer, R. A., et al. The rate of protein synthesis in hematopoietic stem cells is limited partly by 4E-BPs. Genes Dev. 30 (15), 1698-1703 (2016).
  7. Cai, X., et al. Runx1 deficiency decreases ribosome biogenesis and confers stress resistance to hematopoietic stem and progenitor cells. Cell Stem Cell. , (2015).
  8. Loven, J., et al. Revisiting global gene expression analysis. Cell. 151 (3), 476-482 (2012).
  9. JoVE Science Education Database. Using a Hemoacytometer to Count Cells. Basic Methods in Cellular and Molecular Biology. , (2017).
  10. JoVE Science Education Database. Separating Protein with SDS-PAGE. Basic Methods in Cellular and Molecular Biology. , (2017).
  11. JoVE Science Education Database. The Western Blot. Basic Methods in Cellular and Molecular Biology. , (2017).
  12. Jackson, R. J., Hellen, C. U., Pestova, T. V. The mechanism of eukaryotic translation initiation and principles of its regulation. Nat Rev Mol Cell Biol. 11 (2), 113-127 (2010).
  13. Eaton, S. L., et al. A guide to modern quantitative fluorescent western blotting with troubleshooting strategies. J Vis Exp. (93), e52099 (2014).

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Cite This Article
Cai, X., Zheng, Y., Speck, N. A. A Western Blotting Protocol for Small Numbers of Hematopoietic Stem Cells. J. Vis. Exp. (138), e56855, doi:10.3791/56855 (2018).

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