Summary

Kvantificering af Efferocytosis af encellede Fluorescens mikroskopi

Published: August 18, 2018
doi:

Summary

Efferocytosis, fagocyterende fjernelse af apoptotiske celler, er forpligtet til at opretholde homøostase og lettes ved receptorer og signalering veje, der giver mulighed for anerkendelse, engulfment og internalisering af apoptotiske celler. Heri, præsenterer vi en Fluorescens mikroskopi protokol til kvantificering af efferocytosis og aktivitet af efferocytic signaling veje.

Abstract

At studere regulering af efferocytosis kræver metoder, der kunne nøjagtigt kvantificere optagelsen af apoptotiske celler og sonde til signalering og cellulære processer, der styrer efferocytosis. Denne kvantificering kan være vanskelige at udføre som apoptotiske celler er ofte efferocytosed stykkevis, således nødvendiggør metoder, der kan præcist afgrænse mellem efferocytosed del af et apoptotiske mål versus resterende unengulfed cellular fragmenter. Den metode beskrevet heri udnytter dual-mærkning tilgange for at nøjagtigt kvantificere dynamikken i efferocytosis og efferocytic kapacitet af efferocytes såsom makrofager. Cytosol af cellen apoptotiske er mærket med en celle-tracking farvestof til at aktivere overvågning af alle apoptotiske celle-afledte materialer, mens overflade biotinylation af cellen apoptotiske giver mulighed for differentiering mellem internaliseret og ikke internaliseret apoptotiske celle fraktioner. Efferocytic kapaciteten af efferocytes bestemmes ved at tage fluorescerende billeder af levende eller faste celler og kvantificere mængden af bundne versus internaliseret mål, differentieret ved streptavidin farvning. Denne tilgang giver flere fordele over metoder såsom flowcytometri, nemlig den nøjagtige afgrænsning af efferocytosed versus efferocytosed apoptotiske celle fraktioner, evnen til at måle efferocytic dynamics af live-celle mikroskopi, og den kapacitet til at udføre undersøgelser af cellulær signalering i celler, der udtrykker fluorescently mærket transgener. Kombineret, tjene de metoder, der er skitseret i denne protokol som grundlag for en fleksibel eksperimenterende tilgang, der kan bruges til at nøjagtigt kvantificere efferocytic aktivitet og afhøre cellulær signalering veje aktive under efferocytosis.

Introduction

Apoptose, eller programmeret celledød er en stærkt reguleret fysiologisk proces, der forekommer i de fleste flercellede organismer og er afgørende for deres udvikling og homøostase1. Ud over at være involveret i normal cellefornyelsen og fosterudviklingen, apoptose giver mulighed for fjernelse af inficerede eller beskadiget celler fra væv og kan udløses i reaktion på infektion, inflammation, kræft, og også af lægelige indgreb såsom strålebehandling eller steroider1. Apoptotiske celler udsætte “spise-mig” signaler på deres celleoverfladen, som er anerkendt af receptorer på en vifte af professionelle og ikke-professionelle fagocytter, kollektivt benævnt “efferocytes”. Engagement i disse receptorer inducerer optagelse og nedbrydning af cellen apoptotiske af efferocyte gennem en proces kendt som efferocytosis2,3. Fosfatidylserin er bedst karakteriseret spise-mig signal drivende efferocytosis. Det er normalt begrænset til den indre folder af plasma membran, med apoptose aktivering en lipid-scramblase, som forstyrrer denne membran asymmetri, dermed udsætte phosphatidylserin på celle overflade4. Fosfatidylserin er fundet på den ekstracellulære overfladen af nogle ikke-apoptotiske celler, såsom modne makrofager og aktiveret blodplader. Disse celler er imidlertid ikke efferocytosed på grund af tilstedeværelsen af “ikke spise mig” signaler, såsom CD47, på deres celle overfladen5,6,7. Udsatte phosphatidylserin genkendes af en bred vifte af efferocytic receptorer udtrykt ved efferocytes. Binding af disse receptorer til phosphatidylserin, aktiveres enten direkte eller gennem støtte af opsonins, signaling veje, der fremmer engulfment af cellen apoptotiske i en membran-bundet vacuole betegnes efferosome8, 9 , 10 , 11 , 12. efferosome sikringer sekventielt med endosomes og lysosomer, som leverer de molekylære maskineri for at forsure efferosome og forringe apoptotiske celle cargo13,14. Når nedbrudt, apoptotiske celle-afledte materialer der handles til genanvendelse endosome — en proces, der begrænser immunrespons mod apoptotiske celle-afledte antigener, og som kan give mulighed for genvinding af næringsstoffer fra apoptotiske celle13, 15. En fejl i efferocytosis medfører nedsat clearance af apoptotiske celler; disse uncleared celler underkastes i sidste ende sekundær nekrose. Nekrotiske celler frigive pro-inflammatoriske cytosole indholdet, patogener og autoantigens i det ekstracellulære miljø, således køre en række infektiøse, inflammatoriske og autoimmune sygdomme16,17. Sammen, apoptose og efferocytosis lette fjernelsen af døende og døde celler og giver mulighed for vedligeholdelsen af væv homøostase.

Undersøger de underliggende efferocytosis molekylære mekanismer kræver metoder, der giver en klar kvantificering af apoptotiske celle optagelse. Denne kvantificering kompliceres af det faktum, at i modsætning til andre optagelse mekanismer såsom endocytose og fagocytose18,19, efferocytosis ikke kan resultere i engulfment af intakt målcellen, resulterer i den stykkevise optagelse af cellen apoptotiske efferocyte20. Protokollen beskrevet heri beskriver en i vitro efferocytosis analyse der giver præcise afgrænsning af den internaliseret versus ikke-internaliseret dele af individuelle apoptotiske celler og kan være kombineret med en række faste celle og Live-celle mikroskopi metoder. Traditionelle fagocytose assays tilføje antistoffer specifikke for fagocyterende målet i slutningen af forsøget for at mærke ikke internaliseret mål, hvor det som vores metode adskiller sig ved mærkning apoptotiske målet med kovalent knyttet biotin21 , 22. mens apoptotiske celle specifikke antistoffer kan bruges i denne analyse, biotinylation tilgangen giver mulighed for enhver protein-bærende mål skal være mærket og undgår potentielle problemer med sekundær antistof krydsreaktivitet hvis immunfarvning udføres . Specifikt, skitsere vi forberedelse af apoptotiske Jurkat celler, der har været dual-farves med både en celle tracking farvestof og biotin. Cellen tracking farvestof giver mulighed for apoptotiske celle-afledte materialer skal være spores under efferocytosis, paa overfladen biotinylation giver mulighed for forskelsbehandling af internaliseret fra ikke-internaliseret dele af efferocytosed apoptotiske celler. Vi beskriver også kultur og forberedelse af J774.2 og THP-1 cellelinjer til brug som murine og menneskelige efferocytes, monocyt-afledte M2 makrofager som et eksempel på primær celle efferocytosis og Jurkat celler til brug som efferocytic mål. Disse metoder kan let anvendes på andre cellelinjer eller primærelementer, målceller under enhver form for celledød (fx apoptose, nekrose og necroptosis) og micron mellemstore efterligner, som simulere apoptotiske celler gennem lipid belægninger eller belægning med ligander specifikke for en efferocytic receptor af interesse.

Den metode, der er skitseret i denne protokol har flere fordele i forhold til flow flowcytometri baseret metoder almindeligvis anvendes i feltet23,24. Ved direkte imaging phagocyt-apoptotiske celle interaktion, kombineret med tydelig mærkning af både samlede og ikke internaliseret apoptotiske cellestof, kan kvantitative foranstaltninger af efferocytosis gøres. Desuden begrænser brugen af pH-ufølsom fluorophores konfunderende faktorer såsom undertrykkelsen af FITC og normal god landbrugspraksis fluorescens på lysosomale pH, der tilintetgør nogle alternative metoder25. Endelig, mens ikke beskrevet i detaljer, disse metoder kan være ansat ved hjælp af efferocytes at udtrykke fluorescently mærket transgener, eller med efter fiksering immunfarvning, at give mulighed for kvantificering af signalering molekyle aktivitet og overvågning af de cellulære processer under efferocytosis.

Protocol

Samling af blod fra raske frivillige forsøgspersoner blev godkendt af Health Science forskning etik Board af University of Western Ontario. Venepunktur blev udført i overensstemmelse med retningslinjerne i Tri-Rådets politik redegørelse om menneskelige forskning. 1. kultur og forberedelse af THP-1 monocyt cellelinie Kultur THP-1 monocytter som en suspension kultur i T25 kolber på 37 ° C + 5% CO2. Celler skal være dyrket i 5 mL af Roswell Park Memorial Institute 1640…

Representative Results

Natten kultur af Jurkat celler med 1 µM staurosporine resultater i apoptose af > 95% af celler, der kan bekræftes med Annexin V farvning (figur 1). Andre celletyper kan anvendes til disse forsøg, selvom koncentrationen af staurosporine og staurosporine behandlingens varighed skal være optimeret til hver cellelinje. For pålidelig påvisning og kvantificering af efferocytosis, > 80% af celler skal være apoptotiske forud for at føje dem til efferocytes. A…

Discussion

De metoder, der er skitseret i denne protokol aktiverer imaging og kvantificering af dynamiske efferocytic processen, brug af både fast-celle og live-celle tilgange. Disse tilgange giver flere fordele sammenlignet med almindeligt ansat flow flowcytometri-baserede metoder23,24. Brugen af inside-out farvning med faste prøver giver en mere robust og nøjagtig kvantificering af hastigheden og omfanget af efferocytosis — ja, mange flow flowcytometri-baserede metod…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Undersøgelsen blev finansieret af canadiske institutter for sundhed Research (CIHR) opererer Grant MOP-123419, naturvidenskab og Engineering Research Rådet af Canada Discovery Grant 418194, og en Ontario Ministeriet for forskning og Innovation tidlige Research Award til BH. DGW bidrog nogle af billederne præsenteres, at optimering af protokoller og skrivning af håndskriftet; Han blev finansieret af et pump-priming tilskud fra university of Liverpool. CY er finansieret af en Vanier Graduate stipendium og CIHR MD/PhD Studentship. De finansielle organer spillede ingen rolle i undersøgelse design, dataindsamling og analyse, beslutningen om at offentliggøre eller forberedelse af manuskriptet.

Materials

RPMI 1640 Media Wisent 3500-000-EL
DMEM Media Wisent 319-005-CL
Fetal Bovine Serum (FBS) Wisent 080-150
PBS Wisent 311-010-CL
18 mm circular glass coverslips #1.5 thickness Electron Microscopy Sciences 72290-08 Size and shape of coverslip is not critical, but 18 mm fit into the wells of a standard 12-well plate which simplifies cell culture
Staurosporine Cayman Chemical 81590 Dissolve in DMSO at 1 mM (1,000x stock solution)
Annexin V-Alexa 488 ThermoFisher R37174
EZ-Link NHS-Biotin ThermoFisher 20217 Store in a dessicator. Do not prepare a stock solution.
DMSO Sigma-Aldrich D2650
CellTrace FarRed ThermoFisher C34572
CellTrace Orange ThermoFisher C34851
Hoescht 33342 ThermoFisher 62249
FITC-Streptavadin ThermoFisher SA1001
Lympholyte-poly cell sepration medium Cedarlane Labs CL5071
Recombinant Human M-CSF Peprotech 200-04
Recombinant Human IL-4 Peprotech 300-25
J774.2 Macrophage Cell Line Sigma-Aldrich 85011428-1VL
THP-1 Human Monocyte Cell Line ATCC TIB-202
Jurkat T Cell Line ATCC TIB-152

References

  1. Elmore, S. Apoptosis: A review of programmed cell death. Toxicologic Pathology. 35 (4), 495-516 (2007).
  2. Toda, S., Hanayama, R., Nagata, S. Two-step engulfment of apoptotic cells. Molecular and Cellular Biology. 32 (1), 118-125 (2012).
  3. Ravichandran, K. S. Find-me and eat-me signals in apoptotic cell clearance: Progress and conundrums. The Journal of Experimental Medicine. 207 (9), 1807-1817 (2010).
  4. Fadok, V. A., Voelker, D. R., Campbell, P. A., Cohen, J. J., Bratton, D. L., Henson, P. M. Exposure of phosphatidylserine on the surface of apoptotic lymphocytes triggers specific recognition and removal by macrophages. Journal of Immunology. 148 (7), 2207-2216 (1992).
  5. Bevers, E. M., Comfurius, P., van Rijn, J. L., Hemker, H. C., Zwaal, R. F. Generation of prothrombin-converting activity and the exposure of phosphatidylserine at the outer surface of platelets. European Journal of Biochemistry. 122 (2), 429-436 (1982).
  6. Callahan, M. K., Williamson, P., Schlegel, R. A. Surface expression of phosphatidylserine on macrophages is required for phagocytosis of apoptotic thymocytes. Cell Death and Differentiation. 7 (7), 645-653 (2000).
  7. Kojima, Y., et al. CD47-blocking antibodies restore phagocytosis and prevent atherosclerosis. Nature. 536, 86-90 (2016).
  8. Seitz, H. M., Camenisch, T. D., Lemke, G., Earp, H. S., Matsushima, G. K. Macrophages and dendritic cells use different Axl/Mertk/Tyro3 receptors in clearance of apoptotic cells. Journal of Immunology. 178, 5635-5642 (2007).
  9. Ichimura, T., Asseldonk, E. J. P. V., Humphreys, B. D., Gunaratnam, L., Duffield, J. S., Bonventre, J. V. Kidney injury molecule-1 is a phosphatidylserine receptor that confers a phagocytic phenotype on epithelial cells. The Journal of Clinical Investigation. 118 (5), 1657-1668 (2008).
  10. Flannagan, R. S., Canton, J., Furuya, W., Glogauer, M., Grinstein, S. The phosphatidylserine receptor TIM4 utilizes integrins as coreceptors to effect phagocytosis. Molecular Biology of the Cell. 25 (9), 1511-1522 (2014).
  11. Park, D., et al. BAI1 is an engulfment receptor for apoptotic cells upstream of the ELMO/Dock180/Rac module. Nature. 450 (7168), 430-434 (2007).
  12. Elliott, M. R., Koster, K. M., Murphy, P. S. Efferocytosis Signaling in the Regulation of Macrophage Inflammatory Responses. Journal of Immunology. 198 (4), 1387-1394 (2017).
  13. Yin, C., Kim, Y., Argintaru, D., Heit, B. Rab17 mediates differential antigen sorting following efferocytosis and phagocytosis. Cell Death & Disease. 7 (12), e2529 (2016).
  14. Kinchen, J. M., et al. A pathway for phagosome maturation during engulfment of apoptotic cells. Nature Cell Biology. 10 (5), 556-566 (2008).
  15. Yin, C., Argintaru, D., Heit, B. Rab17 mediates intermixing of phagocytosed apoptotic cells with recycling endosomes. Small GTPases. , 1-9 (2017).
  16. Silva, M. T. Secondary necrosis: The natural outcome of the complete apoptotic program. FEBS letters. 584 (22), 4491-4499 (2010).
  17. Thorp, E. B. Mechanisms of failed apoptotic cell clearance by phagocyte subsets in cardiovascular disease. Apoptosis. 15 (9), 1124-1136 (2010).
  18. Sarantis, H., Grinstein, S. Monitoring phospholipid dynamics during phagocytosis: application of genetically-encoded fluorescent probes. Methods in Cell Biology. 108, 429-444 (2012).
  19. Steinberg, B. E., Grinstein, S. Analysis of macrophage phagocytosis: Quantitative assays of phagosome formation and maturation using high-throughput fluorescence microscopy. Methods in Molecular Biology. 531, 45-56 (2009).
  20. Wang, J., Hossain, M., Thanabalasuriar, A., Gunzer, M., Meininger, C., Kubes, P. Visualizing the function and fate of neutrophils in sterile injury and repair. Science. 358 (6359), 111-116 (2017).
  21. Scott, C. C., et al. Phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate hydrolysis directs actin remodeling during phagocytosis. The Journal of Cell Biology. 169 (1), 139-149 (2005).
  22. Greenlee-Wacker, M. C., Rigby, K. M., Kobayashi, S. D., Porter, A. R., DeLeo, F. R., Nauseef, W. M. Phagocytosis of Staphylococcus aureus by human neutrophils prevents macrophage efferocytosis and induces programmed necrosis. Journal of Immunology. 192 (10), 4709-4717 (2014).
  23. Wootton, D. G., et al. Recovery from pneumonia requires efferocytosis which is impaired in smokers and those with low body mass index and enhanced by statins. Thorax. 71 (11), 1052-1054 (2016).
  24. Miksa, M., Komura, H., Wu, R., Shah, K. G., Wang, P. A novel method to determine the engulfment of apoptotic cells by macrophages using pHrodo succinimidyl ester. Journal of Immunological Methods. 342 (1-2), 71-77 (2009).
  25. Kneen, M., Farinas, J., Li, Y., Verkman, A. S. Green fluorescent protein as a noninvasive intracellular pH indicator. Biophysical Journal. 74 (3), 1591-1599 (1998).
  26. Schindelin, J., et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nature Methods. 9 (7), 676-682 (2012).
  27. Johnson, D. E., Ostrowski, P., Jaumouillé, V., Grinstein, S. The position of lysosomes within the cell determines their luminal pH. The Journal of Cell Biology. 212 (6), 677-692 (2016).
  28. Evans, A. L., Blackburn, J. W. D., Yin, C., Heit, B. Quantitative efferocytosis assays. Methods in Molecular Biology. 1519, 25-41 (2017).
  29. Icha, J., Weber, M., Waters, J. C., Norden, C. Phototoxicity in live fluorescence microscopy, and how to avoid it. BioEssays. 39 (8), (2017).
  30. Flannagan, R. S., Harrison, R. E., Yip, C. M., Jaqaman, K., Grinstein, S. Dynamic macrophage "probing" is required for the efficient capture of phagocytic targets. The Journal of Cell Biology. 191 (6), 1205-1218 (2010).
  31. Joshi, G. N., Gilberti, R. M., Knecht, D. A. Single cell analysis of phagocytosis, phagosome maturation, phagolysosomal leakage, and cell death following exposure of macrophages to silica particles. Methods in Molecular Biology. 1519, 55-77 (2017).
  32. Karaji, N., Sattentau, Q. J. Efferocytosis of Pathogen-Infected Cells. Frontiers in Immunology. 8 (DEC), 1863 (1863).
  33. Harrison, R. E., Bucci, C., Vieira, O. V., Schroer, T. A., Grinstein, S. Phagosomes fuse with late endosomes and/or lysosomes by extension of membrane protrusions along microtubules: role of Rab7 and RILP. Molecular and Cellular Biology. 23 (18), 6494-6506 (2003).
  34. Reiners, J. J., Kleinman, M., Kessel, D., Mathieu, P. A., Caruso, J. A. Nonesterified cholesterol content of lysosomes modulates susceptibility to oxidant-induced permeabilization. Free Radical Biology & Medicine. 50 (2), 281-294 (2011).
  35. Boya, P., et al. Lysosomal membrane permeabilization induces cell death in a mitochondrion-dependent fashion. The Journal of Experimental Medicine. 197 (10), 1323-1334 (2003).
  36. Fairn, G. D., Grinstein, S. How nascent phagosomes mature to become phagolysosomes. Trends in Immunology. , 1-9 (2012).
  37. Canton, J., Khezri, R., Glogauer, M., Grinstein, S. Contrasting phagosome pH regulation and maturation in human M1 and M2 macrophages. Molecular Biology of the Cell. 25 (21), 3330-3341 (2014).
  38. Phanse, Y., et al. Analyzing cellular internalization of nanoparticles and bacteria by multi-spectral imaging flow cytometry. Journal of Visualized Experiments. (64), e3884 (2012).
  39. Sommer, C., Straehle, C., Kothe, U., Hamprecht, F. A. Ilastik: Interactive learning and segmentation toolkit. 2011 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro. , 230-233 (2011).
  40. Davies, S. P., Reynolds, G. M., Stamataki, Z. Clearance of apoptotic cells by tissue epithelia: A putative role for hepatocytes in liver efferocytosis. Frontiers in Immunology. 9, (2018).
  41. Ismail, O. Z., Zhang, X., Bonventre, J. V., Gunaratnam, L. G protein α12(Gα12) is a negative regulator of kidney injury molecule-1-mediated efferocytosis. American Journal of Physiology. Renal Physiology. 310 (7), F607-F620 (2016).
  42. Vaught, D. B., Stanford, J. C., Cook, R. S. Efferocytosis creates a tumor microenvironment supportive of tumor survival and metastasis. Cancer Cell & Microenvironment. 2 (1), (2015).
  43. Heit, B., Yeung, T., Grinstein, S. Changes in mitochondrial surface charge mediate recruitment of signaling molecules during apoptosis. American Journal of Physiology. Cell Physiology. 300 (1), C33-C41 (2011).
  44. Múnera, J. O., Wells, J. M. Generation of Gastrointestinal Organoids from Human Pluripotent Stem Cells. Methods in Molecular Biology. 1597, 167-177 (2017).
  45. Truman, L. A., et al. CX3CL1/fractalkine is released from apoptotic lymphocytes to stimulate macrophage chemotaxis. Blood. 112 (13), 5026-5036 (2008).
  46. Evans, A. L., et al. Antagonistic Coevolution of MER Tyrosine Kinase Expression and Function. Molecular Biology and Evolution. , (2017).
  47. Flannagan, R. S., Heit, B., Heinrichs, D. E. Intracellular replication of Staphylococcus aureus in mature phagolysosomes in macrophages precedes host cell death, and bacterial escape and dissemination. Cellular Microbiology. , (2015).
  48. Mubaid, F., Brown, C. M. Less is More: Longer Exposure Times with Low Light Intensity is Less Photo-Toxic. Microscopy Today. 25 (06), 26-35 (2017).
  49. Bogdanov, A. M., Kudryavtseva, E. I., Lukyanov, K. A. Anti-fading media for live cell GFP imaging. PloS One. 7 (12), e53004 (2012).
  50. Rossner, M., Yamada, K. M. What’s in a picture? The temptation of image manipulation. The Journal of Cell Biology. 166 (1), 11-15 (2004).
  51. Sage, D., et al. DeconvolutionLab2: An open-source software for deconvolution microscopy. Methods. 115, 28-41 (2017).
  52. Ma, G. Z. M., Stankovich, J., Kilpatrick, T. J., Binder, M. D., Field, J. Polymorphisms in the receptor tyrosine kinase MERTK gene are associated with multiple sclerosis susceptibility. PloS One. 6 (2), e16964 (2011).
  53. Thorp, E., Cui, D., Schrijvers, D. M., Kuriakose, G., Tabas, I. Mertk receptor mutation reduces efferocytosis efficiency and promotes apoptotic cell accumulation and plaque necrosis in atherosclerotic lesions of apoe-/- mice. Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. 28 (8), 1421-1428 (2008).
  54. Nguyen, K. -. Q. N., et al. Overexpression of MERTK Receptor Tyrosine Kinase in Epithelial Cancer Cells Drives Efferocytosis in a Gain-of-Function Capacity. The Journal of Biological Chemistry. 289 (37), 25737-25749 (2014).
  55. Morimoto, K., et al. Lovastatin enhances clearance of apoptotic cells (efferocytosis) with implications for chronic obstructive pulmonary disease. Journal of Immunology. 176 (12), 7657-7665 (2006).
check_url/58149?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Taruc, K., Yin, C., Wootton, D. G., Heit, B. Quantification of Efferocytosis by Single-cell Fluorescence Microscopy. J. Vis. Exp. (138), e58149, doi:10.3791/58149 (2018).

View Video