Summary

Subcellulær billeddannelse af neuronal calciumhåndtering in vivo

Published: March 17, 2023
doi:

Summary

De nuværende metoder beskriver en ikke-ratiometrisk tilgang til calciumbilleddannelse i høj opløsning i subcompartment in vivo i Caenorhabditis elegans ved hjælp af let tilgængelige genetisk kodede calciumindikatorer.

Abstract

Calcium (Ca 2+) billeddannelse er i vid udstrækning blevet brugt til at undersøge neuronal aktivitet, men det bliver stadig mere klart, at subcellulær Ca2+ håndtering er en afgørende komponent i intracellulær signalering. Visualiseringen af subcellulær Ca2+ dynamik in vivo, hvor neuroner kan studeres i deres oprindelige, intakte kredsløb, har vist sig teknisk udfordrende i komplekse nervesystemer. Gennemsigtigheden og det relativt enkle nervesystem hos nematoden Caenorhabditis elegans muliggør cellespecifik ekspression og in vivo-visualisering af fluorescerende tags og indikatorer. Blandt disse er fluorescerende indikatorer, der er blevet modificeret til brug i cytoplasmaet, såvel som forskellige subcellulære rum, såsom mitokondrier. Denne protokol muliggør ikke-ratiometrisk Ca 2+ billeddannelse in vivo med en subcellulær opløsning, der tillader analyse af Ca2+ dynamik ned til niveauet for individuelle dendritiske rygsøjler og mitokondrier. Her bruges to tilgængelige genetisk kodede indikatorer med forskellige Ca 2+ affiniteter til at demonstrere brugen af denne protokol til måling af relative Ca2+ niveauer inden for cytoplasma eller mitokondriematrix i et enkelt par excitatoriske interneuroner (AVA). Sammen med de genetiske manipulationer og langsgående observationer, der er mulige i C. elegans, kan denne billeddannelsesprotokol være nyttig til at besvare spørgsmål om, hvordan Ca2+ håndtering regulerer neuronal funktion og plasticitet.

Introduction

Calciumioner (Ca2+) er meget alsidige bærere af information i mange celletyper. I neuroner er Ca2+ ansvarlig for den aktivitetsafhængige frigivelse af neurotransmittere, reguleringen af cytoskeletal motilitet, finjustering af metaboliske processer samt mange andre mekanismer, der kræves for korrekt neuronal vedligeholdelse og funktion 1,2. For at sikre effektiv intracellulær signalering skal neuroner opretholde lave basale Ca2+ niveauer i deres cytoplasma3. Dette opnås ved hjælp af kooperative Ca 2+ håndteringsmekanismer, herunder optagelse af Ca2+ i organeller såsom endoplasmatisk retikulum (ER) og mitokondrier. Disse processer, ud over arrangementet af Ca 2+-permeable ionkanaler i plasmamembranen, resulterer i heterogene niveauer af cytoplasmatisk Ca2+ i hele neuronen.

Ca 2+ heterogenitet under hvile og neuronal aktivering giver mulighed for forskelligartet, placeringsspecifik regulering af Ca 2+-afhængige mekanismer 1. Et eksempel på de koncentrationsspecifikke virkninger af Ca 2+ er frigivelsen af Ca 2+ fra ER gennem inositol 1,4,5-trisphosphat (InsP 3) receptorer. Lave Ca2+ niveauer i kombination med InsP3 er nødvendige for åbningen af receptorens calciumgennemtrængelige pore. Alternativt hæmmer høje Ca2+ niveauer både direkte og indirekte receptoren4. Betydningen af Ca 2+ homeostase for korrekt neuronal funktion understøttes af beviser, der tyder på, at forstyrret intracellulær Ca2+ håndtering og signalering er et tidligt skridt i patogenesen af neurodegenerative lidelser og naturlig aldring 5,6. Specifikt er unormal Ca2+ optagelse og frigivelse af ER og mitokondrier forbundet med begyndelsen af neuronal dysfunktion ved Alzheimers sygdom, Parkinsons sygdom og Huntingtons sygdom 6,7.

Undersøgelsen af Ca 2+ dyshomeostase under naturlig aldring eller neurodegeneration kræver langsgående observation af Ca2+ niveauer med subcellulær opløsning i en levende, intakt organisme, hvor den oprindelige cellulære arkitektur (dvs. arrangementet af synapser og fordeling af ionkanaler) opretholdes. Til dette formål giver denne protokol vejledning om brugen af to let tilgængelige, genetisk kodede Ca 2+ sensorer til registrering af Ca2+ dynamik in vivo med høj rumlig og tidsmæssig opløsning. De repræsentative resultater opnået ved hjælp af den beskrevne metode i C. elegans demonstrerer, hvordan ekspressionen af Ca 2+ indikatorer i cytoplasma eller mitokondriematrix af enkelte neuroner kan muliggøre hurtig erhvervelse af fluorescerende billeder (op til 50 Hz), der illustrerer Ca 2+ dynamikken med den ekstra evne til at skelne Ca 2+ niveauerne inden for enkelt rygsøjlelignende strukturer og individuelle mitokondrier.

Protocol

1. Oprettelse af transgene stammer Ved hjælp af en kloningsmetode efter eget valg8,9, klonekspressionsvektorer til at indeholde Pflp-18- eller Prig-3-promotoren (for AVA-specifikt signal i ventralnervestrengen) efterfulgt af den valgte Ca2+-indikator og derefter en 3′ UTR (se diskussionen for mere information)10. En liste over plasmider og deres kilder findes i supplerende ta…

Representative Results

Disse to protokoller muliggør hurtig erhvervelse af differentielle Ca2+ niveauer inden for de subcellulære regioner og organeller af individuelle neuritter in vivo med høj rumlig opløsning. Den første protokol muliggør måling af cytoplasmatisk Ca2+ med høj tidsmæssig og rumlig opløsning. Dette demonstreres her ved hjælp af det cellespecifikke udtryk for GCaMP6f i den glutamaterge AVA-kommando interneuroner15, hvis neuritter løber hele længden af den vent…

Discussion

Den første overvejelse ved implementering af den beskrevne metode indebærer valg af en Ca2+ indikator med ideelle egenskaber for det givne forskningsspørgsmål. Cytoplasmatiske Ca 2+ indikatorer har typisk en høj affinitet for Ca 2+, og følsomheden af disse indikatorer over for Ca2+ er omvendt relateret til kinetikken (on/off rate)16,17. Det betyder, at enten Ca2+ følsomhed eller kinetik skal prioritere…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Dette arbejde blev støttet af National Institutes of Health (NIH) (R01- NS115947 tildelt F. Hoerndli). Vi vil også gerne takke Dr. Attila Stetak for pAS1-plasmidet.

Materials

100x/1.40 Oil objective   Olympus   UPlanSApo
10x/0.40 Objective  Olympus   UPlanSApo
22 mm x 22 mm Cover glass  VWR  48366-227 
Agarose SFR  VWR  J234-100G 
Beam homogenizer Andor Technologies Borealis upgrade to CSU-X1
CleanBench laboratory table  TMC  With vibration control
Disposable culture tubes VWR  47729-572  13 mm x 100 mm
Environmental chamber Thermo Scientific 3940 Set to 20 °C
Filter wheel or slider ASI For 25 mm diameter filters
FJH 185 Caenorhabditis Genetics Center  FJH 185 Worm strain
FJH 597 Caenorhabditis Genetics Center FJH 597 Worm strain
GFP bandpass emission filter  Chroma  525 ± 50 nm (25 mm diameter)
ILE laser combiner  Andor Technologies  4 laser lines 
ILE solid state 488 nm laser Andor Technologies  50 mW
ImageJ National Institutes of Health Version 1.52a
IX83 Spinning disk confocal microscope  Olympus  With Yokogawa CSU-X1 spinning disc
iXon Ultra EMCCD camera  Andor Technologies 
Low auto-fluorescence immersion oil  Olympus  Z-81226
MetaMorph  Molecular Devices  Version 7.10.1 
Microscope control box Olympus IX3-CBH
Muscimol  MP Biomedical / Sigma 02195336-CF 
pAS1 AddGene 194970 Plasmid
pBSKS Stratagene
pCT61 Plasmid available from Hoerndli/Maricq lab upon request
pJM23 Plasmid available from Hoerndli/Maricq lab upon request
pKK1  AddGene  194969 Plasmid
Polybead microspheres  Polysciences Inc.  00876-15  0.094 µm
Stability chamber Norlake Scientific NSRI241WSW/8H Set to 15 °C
Stage controller ASI With filter wheel control
Standard microscope slide Premiere 9108W-E 75 mm x 25 mm x 1 mm
Touch panel controller Olympus I3-TPC
Z-drift corrector  Olympus  IX3-ZDC2

References

  1. Berridge, M. J. Neuronal calcium signaling. Neuron. 21 (1), 13-26 (1998).
  2. Brini, M., Calì, T., Ottolini, D., Carafoli, E. Neuronal calcium signaling: Function and dysfunction. Cellular and Molecular Life Sciences. 71 (15), 2787-2814 (2014).
  3. Brini, M., Calì, T., Ottolini, D., Carafoli, E. Intracellular calcium homeostasis and signaling. Metal Ions in Life Sciences. 12, 119-168 (2013).
  4. Berridge, M. J. The inositol trisphosphate/calcium signaling pathway in health and disease. Physiological Reviews. 96 (4), 1261-1296 (2016).
  5. Schrank, S., Barrington, N., Stutzmann, G. E. Calcium-handling defects and neurodegenerative disease. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 12 (7), 035212 (2020).
  6. Pchitskaya, E., Popugaeva, E., Bezprozvanny, I. Calcium signaling and molecular mechanisms underlying neurodegenerative diseases. Cell Calcium. 70, 87-94 (2018).
  7. Jadiya, P., et al. Impaired mitochondrial calcium efflux contributes to disease progression in models of Alzheimer’s disease. Nature Communications. 10 (1), 3885 (2019).
  8. Zeiser, E., Frøkjær-Jensen, C., Jorgensen, E., Ahringer, J. MosSCI and gateway compatible plasmid toolkit for constitutive and inducible expression of transgenes in the C. elegans germline. PLoS One. 6 (5), 20082 (2011).
  9. Zhu, B., Cai, G., Hall, E. O., Freeman, G. J. In-FusionTM assembly: Seamless engineering of multidomain fusion proteins, modular vectors, and mutations. Biotechniques. 43 (3), 354-359 (2007).
  10. Evans, T. C. Transformation and Microinjection. WormBook. , (2006).
  11. Giordano-Santini, R., Dupuy, D. Selectable genetic markers for nematode transgenesis. Cellular and Molecular Life Sciences. 68 (11), 1917-1927 (2011).
  12. Stiernagle, T. Maintenance of C. elegans. WormBook. , (2006).
  13. Stiernagle, T. Maintenance of C. elegans: Transferring worms grown on NGM plates. WormBook. , (2006).
  14. Ogama, T. A beginner’s guide to improving image acquisition in fluorescence microscopy. The Biochemist. 42 (6), 22-27 (2020).
  15. Mellem, J. E., Brockie, P. J., Madsen, D. M., Maricq, A. v. Action potentials contribute to neuronal signaling in C. elegans. Nature Neuroscience. 11 (8), 865-867 (2009).
  16. Zhang, Y., et al. Fast and sensitive GCaMP calcium indicators for imaging neural populations. bioRxiv. , (2021).
  17. Kerruth, S., Coates, C., Dürst, C. D., Oertner, T. G., Török, K. The kinetic mechanisms of fast-decay red-fluorescent genetically encoded calcium indicators. Journal of Biological Chemistry. 294 (11), 3934-3946 (2019).
  18. de Juan-Sanz, J., et al. Axonal endoplasmic reticulum Ca2+ content controls release probability in CNS nerve terminals. Neuron. 93 (4), 867-881 (2017).
  19. Fung, W., Wexler, L., Heiman, M. G. Cell-type-specific promoters for C. elegans glia. Journal of Neurogenetics. 34 (3-4), 335-346 (2020).
  20. Ali, F., Kwan, A. C. Interpreting in vivo calcium signals from neuronal cell bodies, axons, and dendrites: a review. Neurophotonics. 7 (1), 011402 (2019).
  21. Tian, L., et al. Imaging neural activity in worms, flies and mice with improved GCaMP calcium indicators. Nature Methods. 6 (12), 875-881 (2009).
  22. Mank, M., et al. A genetically encoded calcium indicator for chronic in vivo two-photon imaging. Nature Methods. 5 (9), 805-811 (2008).
  23. Birkner, A., Tischbirek, C. H., Konnerth, A. Improved deep two-photon calcium imaging in vivo. Cell Calcium. 64, 29-35 (2017).
  24. Ryan, K. C., Laboy, J. T., Norman, K. R. Deregulation of mitochondrial calcium handling due to presenilin loss disrupts redox homeostasis and promotes neuronal dysfunction. Antioxidants. 11 (9), 1642 (2022).
  25. Yang, H. H., et al. Subcellular imaging of voltage and calcium signals reveals neural processing in vivo. Cell. 166 (1), 245-257 (2016).
  26. Takahashi, N., Oertner, T. G., Hegemann, P., Larkum, M. E. Active cortical dendrites modulate perception. Science. 354 (6319), 1587-1590 (2016).
  27. Nicoletti, M., et al. Biophysical modeling of C. elegans neurons: Single ion currents and whole-cell dynamics of AWCon and RMD. PLoS One. 14 (7), 0218738 (2019).
  28. Church, P. J., Stanley, E. F. Single L-type calcium channel conductance with physiological levels of calcium in chick ciliary ganglion neurons. The Journal of Physiology. 496, 59-68 (1996).
  29. O’Hare, J. K., et al. Compartment-specific tuning of dendritic feature selectivity by intracellular Ca 2+ release. Science. 375 (6586), (2022).
  30. Mclntire, S. L., Jorgensen, E., Horvitz, H. R. Genes required for GABA function in Caenorhabditis elegans. Nature. 364 (6435), 334-337 (1993).
  31. Doser, R. L., Amberg, G. C., Hoerndli, F. J. Reactive oxygen species modulate activity-dependent AMPA receptor transport in C. elegans. The Journal of Neuroscience. 40 (39), 7405-7420 (2020).
  32. Wu, J., et al. A long Stokes shift red fluorescent Ca2+ indicator protein for two-photon and ratiometric imaging. Nature Communications. 5, 5262 (2014).
  33. Cho, J. -. H., et al. The GCaMP-R family of genetically encoded ratiometric calcium indicators. ACS Chemical Biology. 12 (4), 1066-1074 (2017).
  34. Smith, J. J., et al. A light sheet fluorescence microscopy protocol for Caenorhabditis elegans larvae and adults. Frontiers in Cell and Developmental Biology. 10, 1012820 (2022).
  35. Müller, M., et al. Mitochondria and calcium regulation as basis of neurodegeneration associated with aging. Frontiers in Neuroscience. 12, 470 (2018).
  36. Nikoletopoulou, V., Tavernarakis, N. Calcium homeostasis in aging neurons. Frontiers in Genetics. 3, 200 (2012).
  37. Chen, C. -. H., Chen, Y. -. C., Jiang, H. -. C., Chen, C. -. K., Pan, C. -. L. Neuronal aging: Learning from C. elegans. Journal of Molecular Signaling. 8 (1), 14 (2013).
  38. Saberi-Bosari, S., Huayta, J., San-Miguel, A. A microfluidic platform for lifelong high-resolution and high throughput imaging of subtle aging phenotypes in C. elegans. Lab on a Chip. 18 (20), 3090-3100 (2018).
  39. Sridhar, N., Fajrial, A. K., Doser, R. L., Hoerndli, F. J., Ding, X. Surface acoustic wave microfluidics for repetitive and reversible temporary immobilization of C. elegans. Lab on a Chip. 22 (24), 4882-4893 (2022).
check_url/64928?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Doser, R., Knight, K. M., Deihl, E., Hoerndli, F. Subcellular Imaging of Neuronal Calcium Handling In Vivo. J. Vis. Exp. (193), e64928, doi:10.3791/64928 (2023).

View Video