Summary

Subcellulær avbildning av nevronal kalsiumhåndtering in vivo

Published: March 17, 2023
doi:

Summary

De nåværende metodene beskriver en ikke-ratiometrisk tilnærming for høyoppløselig, subkompartmental kalsiumavbildning in vivo i Caenorhabditis elegans ved bruk av lett tilgjengelige genetisk kodede kalsiumindikatorer.

Abstract

Avbildning av kalsium (Ca 2+) har i stor grad blitt brukt til å undersøke nevronaktivitet, men det blir stadig tydeligere at subcellulær Ca2+-håndtering er en avgjørende komponent i intracellulær signalering. Visualiseringen av subcellulær Ca2+ dynamikk in vivo, hvor nevroner kan studeres i deres innfødte, intakte kretser, har vist seg teknisk utfordrende i komplekse nervesystemer. Gjennomsiktigheten og det relativt enkle nervesystemet til nematoden Caenorhabditis elegans muliggjør cellespesifikt uttrykk og in vivo visualisering av fluorescerende koder og indikatorer. Blant disse er fluorescerende indikatorer som er modifisert for bruk i cytoplasma, samt forskjellige subcellulære rom, som mitokondriene. Denne protokollen muliggjør ikke-ratiometrisk Ca 2+-avbildning in vivo med en subcellulær oppløsning som tillater analyse av Ca2+-dynamikk ned til nivået av individuelle dendrittiske pigger og mitokondrier. Her brukes to tilgjengelige genetisk kodede indikatorer med forskjellige Ca 2+ affiniteter for å demonstrere bruken av denne protokollen for å måle relative Ca2+ nivåer i cytoplasma eller mitokondriematrisen i et enkelt par eksitatoriske interneuroner (AVA). Sammen med de genetiske manipulasjonene og longitudinelle observasjonene som er mulige i C. elegans, kan denne bildeprotokollen være nyttig for å svare på spørsmål om hvordan Ca2+ -håndtering regulerer nevronfunksjon og plastisitet.

Introduction

Kalsiumioner (Ca2+) er svært allsidige bærere av informasjon i mange celletyper. I nevroner er Ca2+ ansvarlig for aktivitetsavhengig frigjøring av nevrotransmittere, regulering av cytoskeletal motilitet, finjustering av metabolske prosesser, samt mange andre mekanismer som kreves for riktig nevronvedlikehold og funksjon 1,2. For å sikre effektiv intracellulær signalering må nevroner opprettholde lave basale Ca2+ nivåer i deres cytoplasma3. Dette oppnås ved kooperative Ca 2+ håndteringsmekanismer, inkludert opptak av Ca2+ i organeller som endoplasmatisk retikulum (ER) og mitokondrier. Disse prosessene, i tillegg til arrangementet av Ca 2+-permeable ionekanaler i plasmamembranen, resulterer i heterogene nivåer av cytoplasmatisk Ca2+ gjennom nevronet.

Ca 2+ heterogenitet under hvile og nevronaktivering muliggjør mangfoldig, stedsspesifikk regulering av Ca2+-avhengige mekanismer1. Et eksempel på de konsentrasjonsspesifikke effektene av Ca 2 + er frigjøring av Ca2 + fra ER gjennom inositol 1,4,5-trisfosfat (InsP3) reseptorer. Lave Ca2+ nivåer i kombinasjon med InsP3 er nødvendig for åpning av reseptorens kalsiumgjennomtrengelige pore. Alternativt hemmer høye Ca2+ nivåer både direkte og indirekte reseptoren4. Betydningen av Ca 2+ homeostase for riktig nevronfunksjon støttes av bevis som tyder på at forstyrret intracellulær Ca2+ håndtering og signalering er et tidlig skritt i patogenesen av nevrodegenerative lidelser og naturlig aldring 5,6. Spesielt er unormalt Ca2+ opptak og frigjøring av ER og mitokondrier knyttet til utbruddet av nevronal dysfunksjon i Alzheimers sykdom, Parkinsons sykdom og Huntingtons sykdom 6,7.

Studien av Ca 2+ dyshomeostase under naturlig aldring eller nevrodegenerasjon krever langsgående observasjon av Ca2+ nivåer med subcellulær oppløsning i en levende, intakt organisme der den opprinnelige cellulære arkitekturen (dvs. arrangementet av synapser og distribusjon av ionkanaler) opprettholdes. For dette formål gir denne protokollen veiledning om bruk av to lett tilgjengelige, genetisk kodede Ca 2+ sensorer for registrering av Ca2+ dynamikk in vivo med høy romlig og tidsmessig oppløsning. De representative resultatene som er oppnådd ved hjelp av den beskrevne metoden i C. elegans, demonstrerer hvordan ekspresjonen av Ca2+ indikatorer i cytoplasma eller mitokondriell matrise av enkeltneuroner kan tillate rask oppkjøp av fluorescerende bilder (opptil 50 Hz) som illustrerer Ca 2 + dynamikken med den ekstra evnen til å skille Ca2 + nivåer innenfor enkelte ryggradslignende strukturer og individuelle mitokondrier.

Protocol

1. Opprette transgene stammer Ved hjelp av en valgfri metode 8,9, klon ekspresjonsvektorer for å inneholde Pflp-18 eller Prig-3 promotoren (for AVA-spesifikt signal i ventral nervestreng), etterfulgt av Ca2+ indikator for valg, og deretter en 3′ UTR (se diskusjonen for mer informasjon)10. En liste over plasmider og deres kilder finnes i tilleggstabell 1. F?…

Representative Results

Disse to protokollene muliggjør rask oppkjøp av differensial Ca2+ nivåer innenfor de subcellulære områdene og organeller av individuelle neuritter in vivo med høy romlig oppløsning. Den første protokollen tillater måling av cytoplasmatisk Ca2+ med høy temporal og romlig oppløsning. Dette demonstreres her ved å bruke det cellespesifikke uttrykket av GCaMP6f i de glutamatergiske AVA-kommandointernevronene15, hvis nevritter løper hele lengden av den ventral…

Discussion

Den første vurderingen ved implementering av metoden som er beskrevet, innebærer valg av en Ca2+ indikator med ideelle egenskaper for det gitte forskningsspørsmålet. Cytoplasmatiske Ca 2+-indikatorer har vanligvis høy affinitet for Ca 2+, og sensitiviteten til disse indikatorene til Ca 2+ er omvendt relatert til kinetikken (på/av-hastighet)16,17. Dette betyr at enten Ca2+ følsomhet eller kinetikk må p…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Dette arbeidet ble støttet av National Institutes of Health (NIH) (R01- NS115947 tildelt F. Hoerndli). Vi vil også takke Dr. Attila Stetak for pAS1-plasmidet.

Materials

100x/1.40 Oil objective   Olympus   UPlanSApo
10x/0.40 Objective  Olympus   UPlanSApo
22 mm x 22 mm Cover glass  VWR  48366-227 
Agarose SFR  VWR  J234-100G 
Beam homogenizer Andor Technologies Borealis upgrade to CSU-X1
CleanBench laboratory table  TMC  With vibration control
Disposable culture tubes VWR  47729-572  13 mm x 100 mm
Environmental chamber Thermo Scientific 3940 Set to 20 °C
Filter wheel or slider ASI For 25 mm diameter filters
FJH 185 Caenorhabditis Genetics Center  FJH 185 Worm strain
FJH 597 Caenorhabditis Genetics Center FJH 597 Worm strain
GFP bandpass emission filter  Chroma  525 ± 50 nm (25 mm diameter)
ILE laser combiner  Andor Technologies  4 laser lines 
ILE solid state 488 nm laser Andor Technologies  50 mW
ImageJ National Institutes of Health Version 1.52a
IX83 Spinning disk confocal microscope  Olympus  With Yokogawa CSU-X1 spinning disc
iXon Ultra EMCCD camera  Andor Technologies 
Low auto-fluorescence immersion oil  Olympus  Z-81226
MetaMorph  Molecular Devices  Version 7.10.1 
Microscope control box Olympus IX3-CBH
Muscimol  MP Biomedical / Sigma 02195336-CF 
pAS1 AddGene 194970 Plasmid
pBSKS Stratagene
pCT61 Plasmid available from Hoerndli/Maricq lab upon request
pJM23 Plasmid available from Hoerndli/Maricq lab upon request
pKK1  AddGene  194969 Plasmid
Polybead microspheres  Polysciences Inc.  00876-15  0.094 µm
Stability chamber Norlake Scientific NSRI241WSW/8H Set to 15 °C
Stage controller ASI With filter wheel control
Standard microscope slide Premiere 9108W-E 75 mm x 25 mm x 1 mm
Touch panel controller Olympus I3-TPC
Z-drift corrector  Olympus  IX3-ZDC2

References

  1. Berridge, M. J. Neuronal calcium signaling. Neuron. 21 (1), 13-26 (1998).
  2. Brini, M., Calì, T., Ottolini, D., Carafoli, E. Neuronal calcium signaling: Function and dysfunction. Cellular and Molecular Life Sciences. 71 (15), 2787-2814 (2014).
  3. Brini, M., Calì, T., Ottolini, D., Carafoli, E. Intracellular calcium homeostasis and signaling. Metal Ions in Life Sciences. 12, 119-168 (2013).
  4. Berridge, M. J. The inositol trisphosphate/calcium signaling pathway in health and disease. Physiological Reviews. 96 (4), 1261-1296 (2016).
  5. Schrank, S., Barrington, N., Stutzmann, G. E. Calcium-handling defects and neurodegenerative disease. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 12 (7), 035212 (2020).
  6. Pchitskaya, E., Popugaeva, E., Bezprozvanny, I. Calcium signaling and molecular mechanisms underlying neurodegenerative diseases. Cell Calcium. 70, 87-94 (2018).
  7. Jadiya, P., et al. Impaired mitochondrial calcium efflux contributes to disease progression in models of Alzheimer’s disease. Nature Communications. 10 (1), 3885 (2019).
  8. Zeiser, E., Frøkjær-Jensen, C., Jorgensen, E., Ahringer, J. MosSCI and gateway compatible plasmid toolkit for constitutive and inducible expression of transgenes in the C. elegans germline. PLoS One. 6 (5), 20082 (2011).
  9. Zhu, B., Cai, G., Hall, E. O., Freeman, G. J. In-FusionTM assembly: Seamless engineering of multidomain fusion proteins, modular vectors, and mutations. Biotechniques. 43 (3), 354-359 (2007).
  10. Evans, T. C. Transformation and Microinjection. WormBook. , (2006).
  11. Giordano-Santini, R., Dupuy, D. Selectable genetic markers for nematode transgenesis. Cellular and Molecular Life Sciences. 68 (11), 1917-1927 (2011).
  12. Stiernagle, T. Maintenance of C. elegans. WormBook. , (2006).
  13. Stiernagle, T. Maintenance of C. elegans: Transferring worms grown on NGM plates. WormBook. , (2006).
  14. Ogama, T. A beginner’s guide to improving image acquisition in fluorescence microscopy. The Biochemist. 42 (6), 22-27 (2020).
  15. Mellem, J. E., Brockie, P. J., Madsen, D. M., Maricq, A. v. Action potentials contribute to neuronal signaling in C. elegans. Nature Neuroscience. 11 (8), 865-867 (2009).
  16. Zhang, Y., et al. Fast and sensitive GCaMP calcium indicators for imaging neural populations. bioRxiv. , (2021).
  17. Kerruth, S., Coates, C., Dürst, C. D., Oertner, T. G., Török, K. The kinetic mechanisms of fast-decay red-fluorescent genetically encoded calcium indicators. Journal of Biological Chemistry. 294 (11), 3934-3946 (2019).
  18. de Juan-Sanz, J., et al. Axonal endoplasmic reticulum Ca2+ content controls release probability in CNS nerve terminals. Neuron. 93 (4), 867-881 (2017).
  19. Fung, W., Wexler, L., Heiman, M. G. Cell-type-specific promoters for C. elegans glia. Journal of Neurogenetics. 34 (3-4), 335-346 (2020).
  20. Ali, F., Kwan, A. C. Interpreting in vivo calcium signals from neuronal cell bodies, axons, and dendrites: a review. Neurophotonics. 7 (1), 011402 (2019).
  21. Tian, L., et al. Imaging neural activity in worms, flies and mice with improved GCaMP calcium indicators. Nature Methods. 6 (12), 875-881 (2009).
  22. Mank, M., et al. A genetically encoded calcium indicator for chronic in vivo two-photon imaging. Nature Methods. 5 (9), 805-811 (2008).
  23. Birkner, A., Tischbirek, C. H., Konnerth, A. Improved deep two-photon calcium imaging in vivo. Cell Calcium. 64, 29-35 (2017).
  24. Ryan, K. C., Laboy, J. T., Norman, K. R. Deregulation of mitochondrial calcium handling due to presenilin loss disrupts redox homeostasis and promotes neuronal dysfunction. Antioxidants. 11 (9), 1642 (2022).
  25. Yang, H. H., et al. Subcellular imaging of voltage and calcium signals reveals neural processing in vivo. Cell. 166 (1), 245-257 (2016).
  26. Takahashi, N., Oertner, T. G., Hegemann, P., Larkum, M. E. Active cortical dendrites modulate perception. Science. 354 (6319), 1587-1590 (2016).
  27. Nicoletti, M., et al. Biophysical modeling of C. elegans neurons: Single ion currents and whole-cell dynamics of AWCon and RMD. PLoS One. 14 (7), 0218738 (2019).
  28. Church, P. J., Stanley, E. F. Single L-type calcium channel conductance with physiological levels of calcium in chick ciliary ganglion neurons. The Journal of Physiology. 496, 59-68 (1996).
  29. O’Hare, J. K., et al. Compartment-specific tuning of dendritic feature selectivity by intracellular Ca 2+ release. Science. 375 (6586), (2022).
  30. Mclntire, S. L., Jorgensen, E., Horvitz, H. R. Genes required for GABA function in Caenorhabditis elegans. Nature. 364 (6435), 334-337 (1993).
  31. Doser, R. L., Amberg, G. C., Hoerndli, F. J. Reactive oxygen species modulate activity-dependent AMPA receptor transport in C. elegans. The Journal of Neuroscience. 40 (39), 7405-7420 (2020).
  32. Wu, J., et al. A long Stokes shift red fluorescent Ca2+ indicator protein for two-photon and ratiometric imaging. Nature Communications. 5, 5262 (2014).
  33. Cho, J. -. H., et al. The GCaMP-R family of genetically encoded ratiometric calcium indicators. ACS Chemical Biology. 12 (4), 1066-1074 (2017).
  34. Smith, J. J., et al. A light sheet fluorescence microscopy protocol for Caenorhabditis elegans larvae and adults. Frontiers in Cell and Developmental Biology. 10, 1012820 (2022).
  35. Müller, M., et al. Mitochondria and calcium regulation as basis of neurodegeneration associated with aging. Frontiers in Neuroscience. 12, 470 (2018).
  36. Nikoletopoulou, V., Tavernarakis, N. Calcium homeostasis in aging neurons. Frontiers in Genetics. 3, 200 (2012).
  37. Chen, C. -. H., Chen, Y. -. C., Jiang, H. -. C., Chen, C. -. K., Pan, C. -. L. Neuronal aging: Learning from C. elegans. Journal of Molecular Signaling. 8 (1), 14 (2013).
  38. Saberi-Bosari, S., Huayta, J., San-Miguel, A. A microfluidic platform for lifelong high-resolution and high throughput imaging of subtle aging phenotypes in C. elegans. Lab on a Chip. 18 (20), 3090-3100 (2018).
  39. Sridhar, N., Fajrial, A. K., Doser, R. L., Hoerndli, F. J., Ding, X. Surface acoustic wave microfluidics for repetitive and reversible temporary immobilization of C. elegans. Lab on a Chip. 22 (24), 4882-4893 (2022).
check_url/64928?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Doser, R., Knight, K. M., Deihl, E., Hoerndli, F. Subcellular Imaging of Neuronal Calcium Handling In Vivo. J. Vis. Exp. (193), e64928, doi:10.3791/64928 (2023).

View Video