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Concentration des métabolites issus de communautés planctoniques à faible densité de l'environnement en utilisant métabolomique résonance magnétique nucléaire
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Concentration of Metabolites from Low-density Planktonic Communities for Environmental Metabolomics using Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy
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Concentration des métabolites issus de communautés planctoniques à faible densité de l'environnement en utilisant métabolomique résonance magnétique nucléaire

DOI:
10.3791/3163-v

•

11:47 min

•

April 07, 2012

•

, , , , ,
1Biosphere Oriented Biology Research Unit,RIKEN Advanced Science Institute, 2Graduate School of Nanobioscience, Yokohama City University, 3Advanced NMR Metabomics Research Team,RIKEN Plant Science Center, 4Graduate School of Bioagricultural Science,Nagoya University

Chapters

  • 00:02Title
  • 01:28Preparation of filters to remove extractables and filtration of sample for metabolite concentration
  • 04:44Extraction of aqueous-soluble metabolites
  • 07:48NMR spectroscopy and data analysis
  • 11:15Conclusions

Summary

Automatic Translation

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Une méthode pour l'extraction de métabolite communautés planctoniques microbiens est présenté. Échantillonnage ensemble de la communauté est réalisée par filtration sur des filtres spécialement préparés. Après lyophilisation, aqueuse-solubles métabolites sont extraits. Cette approche permet une application de la métabolomique environnementaux trans-omique enquêtes de communautés microbiennes naturelles ou expérimentales.

Tags

ConcentrationMetabolitesLow-densityPlanktonic CommunitiesEnvironmental MetabolomicsNuclear Magnetic Resonance SpectroscopyNMR SpectroscopyGas Chromatography-mass SpectrometryGC-MSUntargeted AnalysesStructural InformationQuantitative AnalysisStatistical AnalysisMetabolite Spectra DatabasesOmics LevelsTranscriptomicsGenomicsPhysiological ResponsesTaxaSensitivityNatural Microbial Systems

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