Метод метаболитов извлечения из микробных сообществ планктона представлена. Всего выборки сообщества достигается путем фильтрации на специально подготовленных фильтров. После лиофилизации, водно-растворимых метаболитов выделяются. Такой подход позволяет для применения экологических метаболомики к транс-omics исследования природных и экспериментальных микробных сообществ.