Journal
/
Biology
/
DamID-配列：アデニンメチル化DNA断片のハイスループットシークエンシングによるタンパク質-DNA相互作用のゲノムワイドなマッピング
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
DamID-seq: Genome-wide Mapping of Protein-DNA Interactions by High Throughput Sequencing of Adenine-methylated DNA Fragments
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

DamID-配列：アデニンメチル化DNA断片のハイスループットシークエンシングによるタンパク質-DNA相互作用のゲノムワイドなマッピング

DOI:
10.3791/53620-v

•

09:14 min

•

January 27, 2016

•

, ,
1Department of Cell Biology,Yale University School of Medicine

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:58Generation and Expression of Fusion Proteins and Free Dam Proteins
  • 03:12Library Preparation: Fragmentation
  • 05:29Library Preparation: Size Selection
  • 07:26Results: Detecting Lamin B1 Binding Regions on the Mouse Chromosome One
  • 08:20Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

我々は、高スループットシーケンシング（DamID-SEQ）に、DNAアデニンメチルトランスフェラーゼ識別（DamID）を結合することにより、本明細書のアッセイを説明します。この改良された方法は、より高い解像度、より広いダイナミックレンジを提供し、可能にする等のChIP-seqの、RNA-配列などの他のハイスループットシークエンシングデータと併せてDamID、配列データを分析します

Tags

DamID-seqProtein-DNA InteractionsHigh-throughput SequencingAdenine-methylated DNANuclear OrganizationTranscription RegulationLentiviral ExpressionGenomic DNA IsolationAdenine-methylated DNA Amplification

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

DNAフラグメントをElectroeluting

の定量と自動ハイスループットゲノムワイドRNAiスクリーニング C.エレガンス</em

DNA断片の分離のためのアガロースゲル電気泳動

自動化を使用して染色体のハイスループット物理マッピング<em>その場で</em>ハイブリダイゼーション

ゲノムワイドな遺伝子欠失で<em>ストレプトコッカス血統</em>ハイスループットPCRによる

ハイスループットシーケンシングのための高品質クロマチン免疫沈降DNAテンプレート（チップ-SEQ）の生成

タンパク質-DNA相互作用の研究のための単一分子マニピュレーションとイメージングを組み合わせる

ハイスループットシークエンシングによりマイクロRNA定量のための低分子RNA分子の高効率ライゲーション

転写後調節される遺伝子の化学モジュレーターのためのハイスループットスクリーニング

シロイヌナズナタンパク質-DNA相互作用の同定のための免疫沈降アッセイクロマチン<em>インビボ</em

Read Article