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DamID-SEQ : 아데닌 - 메틸화 된 DNA 단편의 높은 처리량 시퀀싱에 의해 단백질 DNA 상호 작용의 게놈 넓은 매핑
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DamID-seq: Genome-wide Mapping of Protein-DNA Interactions by High Throughput Sequencing of Adenine-methylated DNA Fragments
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DamID-SEQ : 아데닌 - 메틸화 된 DNA 단편의 높은 처리량 시퀀싱에 의해 단백질 DNA 상호 작용의 게놈 넓은 매핑

DOI:
10.3791/53620-v

•

09:14 min

•

January 27, 2016

•

, ,
1Department of Cell Biology,Yale University School of Medicine

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:58Generation and Expression of Fusion Proteins and Free Dam Proteins
  • 03:12Library Preparation: Fragmentation
  • 05:29Library Preparation: Size Selection
  • 07:26Results: Detecting Lamin B1 Binding Regions on the Mouse Chromosome One
  • 08:20Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

우리는 높은 처리량 시퀀싱 (DamID-SEQ)에 DNA 아데닌의 메틸화 식별 (DamID)을 결합하여 여기에 분석을 설명합니다. 이 개선 된 방법은 높은 해상도와 넓은 동적 범위를 제공하며, 허용 등과 칩 서열, RNA-SEQ 같은 다른 높은 처리량 시퀀싱 데이터와 함께 DamID-서열 데이터 분석

Tags

DamID-seqGenome-wide MappingProtein-DNA InteractionsHigh Throughput SequencingAdenine-methylated DNA FragmentsNuclear OrganizationTranscription RegulationMammalian CellsGenomic RegionsAmyloidTranscription FactorsHigh ResolutionDNA MicroarraysCross-analysisGene CloningDamID VectorLentiviral StocksLentiviral Expression SystemCotransfectionLentivirus Infection

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