Journal
/
/
Zuordnung von RNA-RNA-Wechselwirkungen unter Verwendung von biotinyliertem Psoralen
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Mapping RNA-RNA Interactions Globally Using Biotinylated Psoralen
DOI:

11:32 min

May 24, 2017

, , ,

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:12Treatment of HeLa Cells with Biotinylated Psoralen RNA Extraction, and Fragmentation
  • 02:25RNA Size Selection and Elution
  • 04:41Enrichment of RNA Crosslinking Regions
  • 05:57Proximity Ligation
  • 07:34Reverse Crosslinking of Biotinylated Psoralen, and Amplification of cDNA
  • 09:13The SPLASH Workflow and Representative Results
  • 10:50Conclusion

Summary

Automatic Translation

Hier beschreiben wir die Methode des S- Zensierens von P- Soralen-vernetzten, l- igierten und S- gewählten H- Ybriden (SPLASH), die eine genomweite Abbildung von intramolekularen und intermolekularen RNA-RNA-Wechselwirkungen in vivo ermöglichen. SPLASH kann angewendet werden, um RNA-Interaktome von Organismen einschließlich Hefe, Bakterien und Menschen zu untersuchen.

Related Videos

Read Article