Gel-seq: A Method for Simultaneous Sequencing Library Preparation of DNA and RNA Using Hydrogel Matrices

Gordon D. Hoople; Andrew Richards; Yan Wu; Albert P. Pisano; Kun Zhang

doi:10.3791/57315

/

Gel-seq: Een methode voor de voorbereiding van de bibliotheek van de gelijktijdige Sequencing van DNA en RNA met Hydrogel Matrices

JoVE Journal
Bioengineering

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Bioengineering

Gel-seq: A Method for Simultaneous Sequencing Library Preparation of DNA and RNA Using Hydrogel Matrices

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Gel-seq: Een methode voor de voorbereiding van de bibliotheek van de gelijktijdige Sequencing van DNA en RNA met Hydrogel Matrices

DOI:

10.3791/57315-v

•

09:19 min

•

March 26, 2018

•

Gordon D. Hoople*¹, Andrew Richards*², Yan Wu, Albert P. Pisano, Kun Zhang

¹Department of Engineering,University of San Diego, ²Department of Bioengineering,University of California, San Diego, ³Department of Mechanical and Aerospace Engineering,University of California, San Diego

Chapters

00:04Title
00:42Gel-seq Cassette Fabrication
03:12Gel Separation
04:36Sample Recovery
06:53Results: Gel-seq Compared with Conventional Methods
08:26Conclusion

Summary

Automatic Translation

Gel-seq kan onderzoekers gelijktijdig bereiden bibliotheken voor beide DNA - en RNA-seq op de te verwaarlozen extra kosten vanaf 100-1000 cellen met behulp van een eenvoudige hydrogel-apparaat. Dit document stelt een gedetailleerde aanpak voor de fabricage van zowel het apparaat als het biologische protocol voor het genereren van gepaarde bibliotheken.