/
/
ExCYT: Ett grafiskt användargränssnitt för att effektivisera analys av högdimensionella flödescytometri Data
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
1The Bloomberg~Kimmel Institute for Cancer Immunotherapy,Johns Hopkins University School of Medicine, 2The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center,Johns Hopkins University School of Medicine, 3Department of Biomedical Engineering,Johns Hopkins University School of Medicine, 4Department of Immunology,Johns Hopkins University School of Medicine, 5Department of Pathology,Johns Hopkins University School of Medicine
Chapters
- 00:04Title
- 00:24t-SNE Distributed Stochastic Neighbor Embedding (SNE)
- 01:30Cluster Analysis, Filtration, and Visualization
- 03:22Results: Representative Recapitulation of Myeloid and Lymphoid Sub-Population Data
- 04:53Conclusion
ExCYT är en MATLAB-baserat grafiskt användargränssnitt (GUI) som tillåter användare att analysera deras flöde flödescytometri data via vanligen anställd analystekniker för högdimensionella data inklusive dimensionalitet minskning via t-SNE, en mängd automatiserade och manuella klustring metoder, heatmaps och romanen högdimensionella flöde tomter.
