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ExCYT: A Graphical User Interface for Streamlining Analysis of High-Dimensional Cytometry Data

ExCYT: Uma Interface gráfica do usuário para racionalizar a análise de dados de alta dimensão Cytometry

DOI:
10.3791/57473-v

•

05:12 min

•

January 16, 2019

•

, , , , , ,
1The Bloomberg~Kimmel Institute for Cancer Immunotherapy,Johns Hopkins University School of Medicine, 2The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center,Johns Hopkins University School of Medicine, 3Department of Biomedical Engineering,Johns Hopkins University School of Medicine, 4Department of Immunology,Johns Hopkins University School of Medicine, 5Department of Pathology,Johns Hopkins University School of Medicine

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:24t-SNE Distributed Stochastic Neighbor Embedding (SNE)
  • 01:30Cluster Analysis, Filtration, and Visualization
  • 03:22Results: Representative Recapitulation of Myeloid and Lymphoid Sub-Population Data
  • 04:53Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

ExCYT é um baseado em MATLAB Graphical User Interface (GUI) que permite aos usuários analisar seus dados de citometria de fluxo via comumente empregadas técnicas de análise dos dados de alta dimensão incluindo redução de dimensionalidade através de t-PND, uma variedade de automático e manual fluxo de alta dimensão romance, heatmaps e métodos de clustering parcelas.

Tags

CytometryHigh-dimensional AnalysisT-SNEClusteringCell PopulationsMarker-specific AnalysisThresholdHeat MapBox PlotFlow Plot

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