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Séquençage de l’ultra longue lecture pour l’analyse de l’ADN génomique ensemble
JoVE Journal
Bioengineering
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JoVE Journal Bioengineering
Ultra-long Read Sequencing for Whole Genomic DNA Analysis
DOI:

10:34 min

March 15, 2019

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Chapters

  • 00:04Title
  • 01:24High-molecular Weight (HMW) DNA Extraction
  • 03:11Ultra-long DNA Library Construction – Mechanical Shearing-based Protocol
  • 05:19Ultra-long DNA Library Construction – Transposase Fragmentation-based Protocol
  • 06:23Sequencing on the Nanopore Device
  • 07:52Results: Ultra-long DNA Sequencing Protocol
  • 09:38Conclusion

Summary

Automatic Translation

Long-lire des séquences facilitent considérablement l’assemblage des génomes complexes et caractérisation de variation structurale. Les auteurs décrivent une méthode pour générer des séquences ultra longues de plateformes de séquençage nanopore-basé. L’approche adopte une extraction d’ADN optimisée suivie de préparations de bibliothèque modifiée pour générer des centaines de kilobases se lit avec une couverture modérée à partir des cellules humaines.

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