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Muy largo leer la secuencia para el análisis de la DNA de Genomic entero
JoVE Journal
Bioengineering
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JoVE Journal Bioengineering
Ultra-long Read Sequencing for Whole Genomic DNA Analysis
DOI:

10:34 min

March 15, 2019

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Chapters

  • 00:04Title
  • 01:24High-molecular Weight (HMW) DNA Extraction
  • 03:11Ultra-long DNA Library Construction – Mechanical Shearing-based Protocol
  • 05:19Ultra-long DNA Library Construction – Transposase Fragmentation-based Protocol
  • 06:23Sequencing on the Nanopore Device
  • 07:52Results: Ultra-long DNA Sequencing Protocol
  • 09:38Conclusion

Summary

Automatic Translation

Secuencias de largo leer facilitan enormemente el montaje de genomas complejos y la caracterización de la variación estructural. Se describe un método para generar secuencias muy largas por plataformas de secuenciación basada en nanopore. El enfoque adopta una extracción de ADN optimizada seguida por las preparaciones de la biblioteca modificada para generar cientos de kilobases Lee con una cobertura moderada de células humanas.

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