वर्तमान प्रोटोकॉल एक असंतत सुक्रोज घनत्व ढाल के माध्यम से centrifugation द्वारा साइनोबैक्टीरिया से phycobilisomes के अलगाव का विवरण देता है। बरकरार phycobilisomes के अंश 77K फ्लोरोसेंट उत्सर्जन स्पेक्ट्रम और SDS-पेज विश्लेषण द्वारा पुष्टि कर रहे हैं। परिणामस्वरूप phycobilisome अंश TEM और मास स्पेक्ट्रोमेट्री विश्लेषण के नकारात्मक धुंधला के लिए उपयुक्त हैं।