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Ein hochgradig skalierbarer Ansatz zur Durchführung ökologischer Untersuchungen von selbstsüchtigen Caenorhabditis-Nematoden
JoVE Journal
Biology
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JoVE Journal Biology
A Highly Scalable Approach to Perform Ecological Surveys of Selfing Caenorhabditis Nematodes
DOI:

09:10 min

March 01, 2022

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:34Collection Preparation
  • 01:21Field Collection
  • 02:21Plating Out Field Collections and Isolating Nematodes from Collections
  • 04:06Exporting S-Plates from Fulcrum
  • 04:41Check for Proliferation on S-Plates
  • 05:26Lysis of Isofemale Lines
  • 06:22PCR of SSU and ITS2 Sequences
  • 07:00Identifying Nematodes and Processing the Collection Data
  • 08:04Results: Identifying Nematodes with Sanger Sequencing and Sequence BLAST
  • 08:40Conclusion

Summary

Automatic Translation

Dieses Protokoll kann verwendet werden, um groß angelegte ökologische Untersuchungen von sich selbst lebenden Caenorhabditis-Nematoden durchzuführen. Der Hauptvorteil dieser Methode ist die effiziente Organisation und Analyse von ökologischen und molekularen Daten, die mit den aus der Natur gesammelten Nematoden verbunden sind.

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