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Herramienta de edición de genes CRISPR para el análisis de redes de clústeres de microARN
JoVE Journal
Biology
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JoVE Journal Biology
CRISPR Gene Editing Tool for MicroRNA Cluster Network Analysis
DOI:

10:40 min

April 25, 2022

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:58Preparation of CRISPR Gene Editing and Guide RNA Design to Generate miRNA Cluster Knockout Cell Lines
  • 02:06Generation of Stable Lentiviral Cell Lines Carrying the DOX-Inducible Cas9 Expression Cassette
  • 03:20Performing CRISPR Reactions by Cas9 Induction and Synthetic Guide RNA Transfection of Cells Using a High-Throughput Format
  • 07:22PCR Genotyping of CRISPR Cell Lines Using Crude Cell Lysates
  • 08:37Results: High-Throughput CRISPR Experimental Design to Generate Multiple miR-888 Cluster Deletion Combinations
  • 09:51Conclusion

Summary

Automatic Translation

Este protocolo describe un flujo de trabajo de edición de genes de repeticiones palindrómicas cortas (CRISPR) agrupadas regularmente interespaciadas de alto rendimiento para el análisis de redes de clústeres de microARN que permite la generación rápida de un panel de líneas celulares modificadas genéticamente que llevan combinaciones únicas de eliminación de miembros de grupos de miRNA de hasta 35 kb dentro de un solo experimento.

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