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Caracterización de microbioma marca Next-Generation 16S rRNA Amplicon ordenando
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Tick Microbiome Characterization by Next-Generation 16S rRNA Amplicon Sequencing
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Caracterización de microbioma marca Next-Generation 16S rRNA Amplicon ordenando

DOI:
10.3791/58239-v

•

07:21 min

•

August 25, 2018

•

,
1Department of Biology,San Francisco State University

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:44Tick Surface Sterilization, DNA Purification, and 16S rRNA Gene Amplification
  • 02:3016S Amplicon Purification
  • 03:59Sample Barcoding and Purification
  • 04:58Library Quantification and Normalization
  • 06:01Results: Community Ecology of the Ixodes Microbiome
  • 06:43Conclusion

Summary

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Aquí presentamos un protocolo de secuenciación de próxima generación para la secuenciación de rRNA 16S que permite la identificación y caracterización de comunidades microbianas en vectores. Este método implica la extracción de ADN, amplificación y código de barras de muestras mediante PCR, secuenciación en una celda de flujo y bioinformática para que coincida con los datos de la secuencia a la información filogenética.

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Keywords: Tick MicrobiomeNext-generation 16S RRNA Amplicon SequencingVector-borne Disease EcologyMicrobiome CharacterizationTick CollectionDNA ExtractionAmplicon PCRContamination ControlAmplification Bias

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