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Isolement des noyaux à partir de tumeurs cérébrales fraîchement congelées pour l’ARN-seq à noyau unique et ATAC-seq
JoVE 杂志
癌症研究
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JoVE 杂志 癌症研究
Nuclei Isolation from Fresh Frozen Brain Tumors for Single-Nucleus RNA-seq and ATAC-seq
DOI:

06:22 min

August 25, 2020

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:01Tissue Dissection and Dissociation
  • 03:20Gradient Centrifugation and Isolation of Nuclei
  • 04:56Results: Comparison of UMIs and Genes Obtained from Different Human Brain snRNA-seq Datasets
  • 05:57Conclusion

Summary

自动翻译

L’hétérogénéité intratumorale est une caractéristique inhérente aux tumeurs, y compris les gliomes. Nous avons développé un protocole simple et efficace qui utilise une combinaison de tampons et de centrifugation par gradient pour isoler des noyaux uniques à partir de tissus de gliome frais congelés pour des études de séquençage de l’ARN à noyau unique et de l’ATAC.

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