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Isolamento dei nuclei da tumori cerebrali freschi congelati per RNA-seq a nucleo singolo e ATAC-seq
JoVE 杂志
癌症研究
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JoVE 杂志 癌症研究
Nuclei Isolation from Fresh Frozen Brain Tumors for Single-Nucleus RNA-seq and ATAC-seq
DOI:

06:22 min

August 25, 2020

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:01Tissue Dissection and Dissociation
  • 03:20Gradient Centrifugation and Isolation of Nuclei
  • 04:56Results: Comparison of UMIs and Genes Obtained from Different Human Brain snRNA-seq Datasets
  • 05:57Conclusion

Summary

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L'eterogeneità intratumorale è una caratteristica intrinseca dei tumori, compresi i gliomi. Abbiamo sviluppato un protocollo semplice ed efficiente che utilizza una combinazione di tamponi e centrifugazione a gradiente per isolare singoli nuclei da tessuti di glioma freschi congelati per studi di sequenziamento di RNA a nucleo singolo e ATAC.

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