Journal
/
癌症研究
/
Выделение ядер из свежезамороженных опухолей головного мозга для одноядерных РНК-seq и ATAC-seq
JoVE 杂志
癌症研究
需要订阅 JoVE 才能查看此.  登录或开始免费试用。
JoVE 杂志 癌症研究
Nuclei Isolation from Fresh Frozen Brain Tumors for Single-Nucleus RNA-seq and ATAC-seq
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Выделение ядер из свежезамороженных опухолей головного мозга для одноядерных РНК-seq и ATAC-seq

DOI:
10.3791/61542-v

•

06:22 min

•

August 25, 2020

•

, , , , , ,
1Neurology Clinic and National Center for Tumor Diseases,University Hospital Heidelberg, 2Bioinformatics and Omics Data Analytics,German Cancer Research Center (DKFZ), 3Clinical Cooperation Unit Neurooncology,German Cancer Research Center (DKFZ), 4Division of Experimental Neurosurgery, Department of Neurosurgery,University of Heidelberg, INF 400, Heidelberg, Germany

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:01Tissue Dissection and Dissociation
  • 03:20Gradient Centrifugation and Isolation of Nuclei
  • 04:56Results: Comparison of UMIs and Genes Obtained from Different Human Brain snRNA-seq Datasets
  • 05:57Conclusion

Summary

自动翻译

自动翻译

Внутриопухоловная гетерогенность является неотъемлемой чертой опухолей, в том числе и глиом. Мы разработали простой и эффективный протокол, который использует комбинацию буферов и градиентного центрифугирования для выделения одиночных ядер из свежезамороженных тканей глиомы для исследований секвенирования одноядерной РНК и ATAC.

Tags

Keyword Extraction: Nuclei IsolationFresh Frozen Brain TumorsSingle-nucleus RNA-seqATAC-seqTumor EvolutionTumor CompositionNuclei PreparationTranscriptional StudiesEpigenetic StudiesArchival Frozen TumorsNuclei Lysis BufferNuclear MembraneNuclei CentrifugationNuclei ResuspensionHB Buffer

Article

Embed

添加到播放列表

Usage Statistics

Related Videos

check_url/cn/61542?article_type=v

Следующее поколение Секвенирование для обнаружения осуществимых Мутации в твердых и жидких опухолей
check_url/cn/61542?article_type=v

Трансплантация опухолей головного мозга у детей в мозг в иммунокомпетентные хозяева для долгосрочного изучения поведения опухолевых клеток и лекарственного ответа
check_url/cn/61542?article_type=v

Развитие человека доклинических модели Osteoclastogenesis от периферической крови моноциты совместно культивируемых с линии клеток рака молочной железы
check_url/cn/61542?article_type=v

Обнаружение CDH1 редких Стенограмма вариант в тканях свежемороженые рака желудка на основе чипа цифровой ПЦР
check_url/cn/61542?article_type=v

Получение Рак стволовых клеток Сферы от гинекологических и опухолей рака молочной железы
check_url/cn/61542?article_type=v

Поколение ортотопических опухолей поджелудочной железы и Ex vivo Характеристика опухоли-проникновения T клеточной цитотоксичности
check_url/cn/61542?article_type=v

Ортотопическая трансплантация опухолей молочной железы как доклинические модели рака молочной железы
check_url/cn/61542?article_type=v

Быстрый процесс скрининга для определения потенциальной комбинированной терапии GBM с использованием стволовых клеток глиомы, полученных от пациента
check_url/cn/61542?article_type=v

Оптимизация ATAC-Seq для исследований эпигенетики рака
check_url/cn/61542?article_type=v

Получение опухолевых органоидов и фибробластов рака поджелудочной железы из свежих тканей

Read Article