Journal
/
癌症研究
/
Kernisolatie van vers bevroren hersentumoren voor single-nucleus RNA-seq en ATAC-seq
JoVE 杂志
癌症研究
需要订阅 JoVE 才能查看此.  登录或开始免费试用。
JoVE 杂志 癌症研究
Nuclei Isolation from Fresh Frozen Brain Tumors for Single-Nucleus RNA-seq and ATAC-seq
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Kernisolatie van vers bevroren hersentumoren voor single-nucleus RNA-seq en ATAC-seq

DOI:
10.3791/61542-v

•

06:22 min

•

August 25, 2020

•

, , , , , ,
1Neurology Clinic and National Center for Tumor Diseases,University Hospital Heidelberg, 2Bioinformatics and Omics Data Analytics,German Cancer Research Center (DKFZ), 3Clinical Cooperation Unit Neurooncology,German Cancer Research Center (DKFZ), 4Division of Experimental Neurosurgery, Department of Neurosurgery,University of Heidelberg, INF 400, Heidelberg, Germany

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:01Tissue Dissection and Dissociation
  • 03:20Gradient Centrifugation and Isolation of Nuclei
  • 04:56Results: Comparison of UMIs and Genes Obtained from Different Human Brain snRNA-seq Datasets
  • 05:57Conclusion

Summary

自动翻译

自动翻译

Intratumorale heterogeniteit is een inherent kenmerk van tumoren, waaronder gliomen. We ontwikkelden een eenvoudig en efficiënt protocol dat een combinatie van buffers en gradiëntcentrifugatie gebruikt om enkele kernen te isoleren uit vers bevroren glioomweefsels voor single nucleus RNA en ATAC-sequencingstudies.

Tags

Keyword Extraction: Nuclei IsolationFresh Frozen Brain TumorsSingle-nucleus RNA-seqATAC-seqTumor EvolutionTumor CompositionNuclei PreparationTranscriptional StudiesEpigenetic StudiesArchival Frozen TumorsNuclei Lysis BufferNuclear MembraneNuclei CentrifugationNuclei ResuspensionHB Buffer

Article

Embed

添加到播放列表

Usage Statistics

Related Videos

check_url/cn/61542?article_type=v

Next Generation Sequencing voor de detectie van beroep Mutaties in vaste en vloeibare Tumoren
check_url/cn/61542?article_type=v

Transplantatie van zebravis-pediatrische hersentumoren in immuungecompetente gastheren voor langdurige studie van tumorcellen gedrag en drugrespons
check_url/cn/61542?article_type=v

Ontwikkeling van een menselijke preklinische Model van Osteoclastogenesis uit perifeer bloed monocyten mede gekweekt met borst kanker cellijnen
check_url/cn/61542?article_type=v

Detectie van een CDH1 zeldzame Transcript Variant in vers bevroren maagkanker weefsels door Chip gebaseerde digitale PCR
check_url/cn/61542?article_type=v

Het verkrijgen van kanker stamcelbollen van gynaecologische en borstkankertumoren
check_url/cn/61542?article_type=v

Generatie van Orthotopic alvleesklier tumoren en ex vivo karakterisering van tumor-Infiltrerende T cel cytotoxiciteit
check_url/cn/61542?article_type=v

Orthotopische transplantatie van borsttumoren als preklinische modellen voor borstkanker
check_url/cn/61542?article_type=v

Een snelle screeningsworkflow om potentiële combinatietherapie voor GBM te identificeren met behulp van patiënt-afgeleide glioomstamcellen
check_url/cn/61542?article_type=v

ATAC-Seq Optimalisatie voor Kanker Epigenetica Onderzoek
check_url/cn/61542?article_type=v

Oprichting van van alvleesklierkanker afgeleide tumororganoïden en fibroblasten uit vers weefsel

Read Article