Journal
/
Biologie
/
في سيليكو تحديد وتوصيف الحمض النووي الريبي السيرك أثناء التفاعلات بين المضيف والممرض
Journal JoVE
Biologie
Author Produced
Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu.  Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.
Journal JoVE Biologie
In Silico Identification and Characterization of circRNAs During Host-Pathogen Interactions
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

في سيليكو تحديد وتوصيف الحمض النووي الريبي السيرك أثناء التفاعلات بين المضيف والممرض

DOI:
10.3791/64565-v

•

10:27 min

•

October 21, 2022

•

, , ,
1Institute of Biological Sciences, Faculty of Science,Universiti Malaya, 2Centre for Research in Biotechnology for Agriculture (CEBAR),Universiti Malaya

Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 01:02CircRNA Predictions
  • 01:46Differential Expression Analysis and Filtering of DE circRNAs
  • 03:26Predicting the circRNA-miRNA Interaction Using Circr
  • 05:05Construction of the ceRNA Network
  • 06:34Functional Enrichment Analysis
  • 07:49Results: Functional Analysis of DE circRNAs Parental Genes Using GO and KEGG Enrichment
  • 09:43Conclusion

Summary

Traduction automatique

Traduction automatique

يشرح البروتوكول المقدم هنا خط أنابيب السيليكو الكامل اللازم للتنبؤ بالحمض النووي الريبي الدائري وتوصيفه وظيفيا من بيانات نسخ تسلسل الحمض النووي الريبي التي تدرس تفاعلات المضيف والممرض.

Tags

Keywords: CircRNAHost-pathogen InteractionsIn Silico IdentificationCharacterizationBioinformaticsRNA-seq AnalysisDifferential Expression AnalysisCiriquantPrepDE.pyCiri DE ReplicateLinuxProgrammingProtocolWorkflow

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

check_url/fr/64565?article_type=v

تحديد وتوصيف ارتباط بالغليكوزيل باستخدام بروتين معين إندو وexoglycosidases
check_url/fr/64565?article_type=v

تحليل سريع لالوراثية طلائي-الوسيطة اشارة خلال تجديد الشعر
check_url/fr/64565?article_type=v

يعيش التصوير من تخليص الخلية أفكارك أثناء<em> ذبابة الفاكهة</em> مرحلة التطور الجنيني
check_url/fr/64565?article_type=v

على البروتين MultiBac مجمع منصة الإنتاج في EMBL
check_url/fr/64565?article_type=v

Pyrosequencing لتحديد وتوصيف الميكروبية
check_url/fr/64565?article_type=v

الحكمة البروتين: A منضدة لل<em> في السيليكون</em><em> دي نوفو</em> تصميم الجزيئات الحيوية
check_url/fr/64565?article_type=v

تحديد سرعة التفاعلات الكيميائية الوراثية في<em> خميرة الخباز</em
check_url/fr/64565?article_type=v

مناعي لونين الفحص لتحديد نبات الأرابيدوبسيس التفاعلات-DNA البروتين<em> في فيفو</em
check_url/fr/64565?article_type=v

نبات مروج التحليل: تحديد وتوصيف للعقيدات الجذرية المروج محددة في الفول المشتركة
check_url/fr/64565?article_type=v

تحديد المنظمين رواية نتح النبات من خلال فحص التصوير الحراري على نطاق واسع في Helianthus Annuus

Read Article