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Biologie
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在计算机中
宿主-病原体相互作用过程中circRNA的鉴定和表征
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE
Biologie
In Silico
Identification and Characterization of circRNAs During Host-Pathogen Interactions
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在计算机中
宿主-病原体相互作用过程中circRNA的鉴定和表征
DOI:
10.3791/64565-v
•
10:27 min
•
October 21, 2022
•
Mathanakumara Ealam Selvan*
1
,
Kai Shen Lim*
1
,
Chee How Teo
,
Yat-Yuen Lim
1
Institute of Biological Sciences, Faculty of Science
,
Universiti Malaya
,
2
Centre for Research in Biotechnology for Agriculture (CEBAR)
,
Universiti Malaya
Chapitres
00:04
Introduction
01:02
CircRNA Predictions
01:46
Differential Expression Analysis and Filtering of DE circRNAs
03:26
Predicting the circRNA-miRNA Interaction Using Circr
05:05
Construction of the ceRNA Network
06:34
Functional Enrichment Analysis
07:49
Results: Functional Analysis of DE circRNAs Parental Genes Using GO and KEGG Enrichment
09:43
Conclusion
Summary
Traduction automatique
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Deutsch (German)
עברית (Hebrew)
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русский (Russian)
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Türkçe (Turkish)
Traduction automatique
此处提交的协议解释了从研究宿主-病原体相互作用的RNA测序转录组数据中预测和功能表征circRNA所需的完整
计算机
管道。
Tags
CircRNA
Host-pathogen Interactions
In Silico Identification
Characterization
Bioinformatics
RNA-seq Analysis
Differential Expression Analysis
Ciriquant
PrepDE.py
Ciri DE Replicate
Linux
Programming
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