/

/

ב Silico זיהוי ואפיון של circRNAs במהלך אינטראקציות פונדקאי-פתוגן

Journal JoVE
Biologie
Author Produced

Un abonnement à JoVE est nécessaire pour voir ce contenu. Connectez-vous ou commencez votre essai gratuit.

Journal JoVE Biologie

In Silico Identification and Characterization of circRNAs During Host-Pathogen Interactions

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

ב Silico זיהוי ואפיון של circRNAs במהלך אינטראקציות פונדקאי-פתוגן

DOI:

10.3791/64565-v

•

10:27 min

•

October 21, 2022

•

Mathanakumara Ealam Selvan*¹, Kai Shen Lim*¹, Chee How Teo, Yat-Yuen Lim

¹Institute of Biological Sciences, Faculty of Science,Universiti Malaya, ²Centre for Research in Biotechnology for Agriculture (CEBAR),Universiti Malaya

Chapitres

00:04Introduction
01:02CircRNA Predictions
01:46Differential Expression Analysis and Filtering of DE circRNAs
03:26Predicting the circRNA-miRNA Interaction Using Circr
05:05Construction of the ceRNA Network
06:34Functional Enrichment Analysis
07:49Results: Functional Analysis of DE circRNAs Parental Genes Using GO and KEGG Enrichment
09:43Conclusion

Summary

Traduction automatique

הפרוטוקול המוגש כאן מסביר את צנרת הסיליקו המלאה הדרושה לחיזוי ולאפיון פונקציונלי של CirRNAs מנתוני שעתוק ריצוף RNA החוקרים אינטראקציות מארח-פתוגן.

Tags

Keywords: CircRNA Host-pathogen Interactions In Silico Identification Characterization Bioinformatics RNA-seq Analysis Differential Expression Analysis Ciriquant PrepDE.py Ciri DE Replicate Linux Programming Protocol Workflow

Article

Embed

AJOUTER À LA PLAYLIST

Usage Statistics

Vidéos Connexes

זיהוי ואפיון של חלבונים באמצעות glycosylation ספציפי אנדו ו exoglycosidases

ניתוח גנטי מהיר של איתות אפיתל-mesenchymal במהלך התחדשות שיער

חי הדמיה של חיסול תאים אפופטוטיים במהלך<em> דרוזופילה</em> עובר

פלטפורמת הפקת MultiBac החלבון המורכבת בEMBL

Pyrosequencing לזיהוי ואפיון חיידקים

חוכמת חלבון: Workbench ל<em> בסיליקון</em><em> דה נובו</em> עיצוב של ביומולקולות

מהיר זיהוי של אינטראקציות גנטיות כימיות ב<em> Saccharomyces cerevisiae</em

הכרומטין immunoprecipitation Assay עבור זיהוי של אינטראקציות החלבון-דנ"א ארבידופסיס<em> In vivo</em

מי קולחין יזם: זיהוי ואפיון של השורש גולה יזם ספציפי בתוך השעועית נפוצות

זיהוי של הרגולטורים הרומן של דיות צמח על ידי הקרנת הדמיה תרמית בקנה מידה גדול בהליוציץ השנתי

Read Article