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À Silico Identification et caractérisation des ARNcirc au cours des interactions hôte-pathogène
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
In Silico Identification and Characterization of circRNAs During Host-Pathogen Interactions
DOI:

10:27 min

October 21, 2022

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Chapitres

  • 00:04Introduction
  • 01:02CircRNA Predictions
  • 01:46Differential Expression Analysis and Filtering of DE circRNAs
  • 03:26Predicting the circRNA-miRNA Interaction Using Circr
  • 05:05Construction of the ceRNA Network
  • 06:34Functional Enrichment Analysis
  • 07:49Results: Functional Analysis of DE circRNAs Parental Genes Using GO and KEGG Enrichment
  • 09:43Conclusion

Summary

Traduction automatique

Le protocole soumis ici explique le pipeline in silico complet nécessaire pour prédire et caractériser fonctionnellement les circRNA à partir de données de transcriptome de séquençage de l’ARN étudiant les interactions hôte-pathogène.

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