Summary
ここでは、HIVに感染した個体および健全なコントロールからヒト一次単球を分離、培養、トランスフェクション、および区別するための最適化されたプロトコルです。
Abstract
ヒト免疫不全ウイルス(HIV)は、1990年代半ばに併用抗レトロウイルス療法(cART)が導入されたにもかかわらず、依然として大きな健康上の懸念事項である。抗レトロウイルス療法は、効率的に全身性ウイルス負荷を低下させ、正常なCD4+T細胞数を復元するが、それは完全に機能的な免疫系を再構成しない。cARTを受けているHIV感染者の機能不全免疫系は、免疫活性化、免疫細胞の早期老化、または持続的な炎症によって特徴付けられる。これらの状態は、HIV感染に関連する併発因子と共に、細胞および動物モデルでは容易に再現できない疾患に複雑さを加える。これらの患者における免疫機能障害の根底にある分子事象を調べるために、インビトロでヒト一次単球を培養および操作するシステムをここに提示する。具体的には、このプロトコルは、cARTを受けているHIV感染個体から得られる一次CD14+単球の培養およびトランスフェクション、ならびにHIV陰性対照から可能である。この方法は、単球および単球由来マクロファージの単離、培養、およびトランスフェクションを含む。市販のキットと試薬が採用されている間、このプロトコルは、miRNA模倣および阻害剤およびsiRNAを用いた単球の付着およびトランスフェクションを成功させるための重要なヒントと最適化された条件を提供する。
Introduction
ヒト免疫不全ウイルス-1(HIV-1)感染は重度の免疫機能障害を引き起こし、日和見感染や後天性免疫不全症候群(AIDS)を引き起こす可能性がある。cARTを受けているHIV感染患者は、ウイルス負荷が低く、正常なCD4+T細胞数を特徴とするが、免疫系の機能はこれらの個体において損なわれ得るが、癌を発症するリスクの増加に関連する機能不全免疫応答につながる。cART上のHIV患者における免疫機能障害のメカニズムはほとんど未知のままである。したがって、患者由来の免疫細胞を特徴付け、その生物学と機能を調べるのは、現在のHIV研究の重要な要素です。
単球およびマクロファージは免疫応答の主要な調節剤であり、HIV感染において基本的な役割を果たす2,3,4,5.本質的に異種およびプラスチックは、マクロファージを広く古典的に活性化(M1)または代替活性化(M2)に分類することができる。この一般的な分類は実験条件を設定する際に必要であるが、マクロファージの偏光状態は、種々のサイトカイン6、7、8、9によって逆転してもよい。いくつかの研究は、単球および樹状細胞に対するHIV感染の影響を調査しているが、単球媒介応答の分子詳細はほとんど不明である6,7,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19.免疫細胞の調節および機能に関与する因子の中で、microRNA(miRNA)は、遺伝子発現後に転写的に調節する短い非コードRNA、主要な細胞経路(すなわち、増殖、分化、発達、およびアポトーシス)20の文脈において重要な役割を果たすることが示されている。これらの分子は、マクロファージ21の機能的分極化を指示するために不可欠な転写因子の重要な調節因子として記載されている。cARTを受けているHIV感染者からの単球におけるmiRNAの潜在的な役割が調査されているが、現場での進歩は、はるかに多くの作業を必要とする22、23、24、25、26。本論文では、HIVに感染した患者と対照からmiRNAとsiRNAを原発性ヒト単球にトランスフェクトする最適化された方法について論じる。
このプロトコルは、技術的な手順の連続性は臨床サンプルを扱うときに不要な実験変数を排除するのに役立つため、市販の試薬およびキットに依存しています。それにもかかわらず、この方法は、重要なヒント(すなわち、プレートへの細胞の付着を促進するために無血清媒体を用いためっきまたは短時間のインキュベーションの細胞数)を提供する。さらに、このプロトコルで使用される偏光条件は、公開された作品27、28、29に由来する。
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Protocol
以下に説明するすべての方法は、ルイジアナ州立大学健康科学センターニューオーリンズ機関審査委員会によって承認されています.インフォームド・コンセントを得た後、すべての血液を採取した。
注:全手順は、生物学的材料の処理に注意が必要になるように、バイオセーフティレベル2(BSL2)施設の滅菌条件下で行われます。特に、各工程は、バイオセーフティキャビネット下で滅菌技術を用いて行われる。血液、血液製剤、細胞、または細胞産物ピペットを含む各ステップの後、適切な処分の前にフード内の廃棄物容器から10%の漂白剤ですべてのプラスチック材料(すなわち、血清学的ピペット、ピペットチップ、チューブ)をすすぐることが重要です。
1. 免疫磁気陰性選択による原発性ヒト単球の単離
- 4つの10 mLエチレンジアミンテトラ酢酸(EDTA)真空管(チューブあたり10 mLの血液)で、新鮮なヒト全血(HIV+患者または健康対照のいずれかから)を収集します。バイオセーフティキャビネットの下で滅菌技術を使用して、血液のすべての40 mLを1つの50 mL円錐プロピレンチューブに移します。
- 選択したヒト単球単球単離キット(材料の表)のメーカーのプロトコルに従って、キットで提供される単球単一細胞分離カクテルを血液のチューブに2 mL追加します。ボルテックス磁気ビーズは、キットにも設け、30s用、血液の管に2mLを加える。
- 40 mL 未満の血液が使用可能な場合は、追加した試薬をスケールダウンします。溶液を混合するには、プラスチック25 mL血清ピペットで上下にピペットし、室温(RT)で5分間インキュベートします。
- 血液混合物を4つの50 mLチューブに均等に分離し、1 mM EDTAを含む滅菌リン酸緩衝生理食塩水(PBS)を30mL各チューブに加えます。プラスチック25 mL血清ピペットで上下にピペットで混合します。
- チューブを磁石ホルダーに10分間入れ、抗体共役磁気ビーズを取り外します。各血液サンプルの一貫したインキュベーションと分離時間を可能にするために、チューブごとに1つずつ、4つの磁石ホルダーを同時に使用します。
- ピペットを使用して、各チューブの中央から内容物を描き、磁石ホルダーに残ります。赤血球(10mL開始体積の10%以下)を引き出さないように注意し、4つの新しい50 mLチューブのいずれかに内容物を入れます。
- 50mLのチューブに500μLのボルテックス磁気ビーズを加えます。ピペットは25 mLピペットで上下にピペットし、RTで5分間インキュベートします。次に、チューブを磁石ホルダーに5分間入れます。
- 磁石ホルダーを4本の新しい50mLチューブの1つに入れながら、各チューブの中央から内容物を慎重に転送します。新しい50 mLチューブを磁石ホルダーに5分間直接置きます。
- 慎重に4つの新しい50 mLチューブのいずれかに各チューブの中心から内容物を転送します。すべての新しい50 mLチューブを300 x gで5分間回転させ、上清を吸引し、4つの細胞ペレットをすべて合計10mLの滅菌PBSで再スピンします。
- 血球計を用いたトリパンブルーの除外によって細胞をカウントする。
注:8-20 x 106細胞は、一般に、全血の40mLから得られる。
2. 原発性ヒト単球の培養
- 37°Cの水浴を使用して、1%ペニシリンストレプトマイシン(ペン/ストレップ)を補充した温かい無血清RPMI 1640媒体、および(バイオセーフティキャビネットの下で無菌技術を使用し続けている間)1x 106細胞/mLの濃度でこのメディアで単離された単球を再懸濁する。
- 6ウェルプレートまたは35mm皿(最終的な細胞数は1 x 106細胞/プレートでなければなりません)に再懸濁した細胞の1 mLを追加し、5%CO2で37°Cのインキュベーターに入れます。細胞が付着するまで0.5~1.0時間待ちます。
- 37°水浴を使用して、温熱不活化(HI)胎児ウシ血清(FBS)。各プレートにFBSの100 μL(最終濃度10%)を加えます。細胞に成長因子を加えるマクロファージ分化を促進する。
- 25 ng/mLの顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM-CSF)を媒体に添加することにより、M1様表現型の主マクロファージ。M2様表現型に対する主マクロファージは、50ng/mLのマクロファージコロニー刺激因子(M-CSF)を媒体28に添加することにより、
注:GM-CSFおよびM-CSFの両方は、M1またはM2のプライミング細胞がそれぞれ7、28、30である間、一般的なマクロファージ表現型(M0)に単球分化を可能にする。
- 25 ng/mLの顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM-CSF)を媒体に添加することにより、M1様表現型の主マクロファージ。M2様表現型に対する主マクロファージは、50ng/mLのマクロファージコロニー刺激因子(M-CSF)を媒体28に添加することにより、
3. 培養中の原発ヒト単球のトランスフェクション
- miRNA模倣または阻害剤またはsiRNAを有するトランスフェクト単球は、ポリマー系トランスフェクション試薬(材料表)を含有するキットを用いた。
- トランスフェクションキットのメーカーのプロトコルに従い(そしてバイオセーフティキャビネットの下で滅菌技術を使用し続ける)、まず、選択されたmiRNA模倣/阻害剤またはsiRNAをバッファー内の最終濃度1.83μMに希釈し、1x 106細胞のトランスフェクション当たり10μLの希釈模倣/阻害剤を調製します。
- 提供されたポリマーを1μLの新しい1.5 mLマイクロ遠心管に加えてトランスフェクション試薬を調製し、すぐに90μLの緩衝液を加えます(トランスフェクションあたり合計91μLの試薬)。3-5 sのための渦。
- 希釈されたmiRNA模倣/阻害剤またはsiRNAの10μLを含むチューブにトランスフェクション溶液のピペット90μL。穏やかなピペットで混ぜ、RTで15分間インキュベートします。
- 1 x 106めっき単球の1つの井戸(または皿)に100μLのトランスフェクション複合体を加えます。37°Cで4時間細胞をインキュベートし、GM-CSFまたはM-CSFのいずれかを含む完全な培地(RPMI 1640を1%ペニシリン・ストレプトマイシンと10%熱不活性化FBSで補充)の3mLに交換します。
4. M1/M2の差別化と活性化
- 単球は、培養中のめっき時に広いM0マクロファージに分化し始める。めっき後3日目に、バイオセーフティキャビネットの下で滅菌技術を使用し続け、新鮮なRMPI 1640媒体(ペニシリン・ストレプトマイシン1%、熱不活性化FBS10%、および25ng/mL GM-CSFを補う)の3mLでメディアを交換し、M1様偏光または50ng/mL MFを促進します。これらの条件で細胞を培養し、初期めっきから合計6日間、インキュベーターで37°、5%CO2で培養する。
- M1-マクロファージ表現型への素子細胞の偏光を進めるために、細胞媒体を5%熱不活性化FBS、1%ペン/ストレップ、100ng/mL大腸菌由来リポ多糖(LPS)、および20ng/mLインターフェロンガンマ(IFN γ)を含む新しい媒体に置き換えることによって、インキュベーションの6日目に細胞を活性化する。
- M2-マクロファージ表現型への素子細胞の偏光を進めるために、細胞媒体を5%の熱不活性化FBS、1%ペン/ストレップ、10 ng/mL M-CSF、および20 ng/mLインターロイキン4(IL-4)を含む新しい媒体に置き換えることによって、インキュベーションの6日目に細胞を活性化します。
- 24時間後、RNA、タンパク質、またはフローサイトメトリー分析用の細胞を採取します。
- 細胞を採取する準備ができたら、PBSで皿2xで細胞を洗浄します(RNA抽出の場合はRTで、またはタンパク質抽出のために氷上で冷却)。分化したマクロファージがプレートにしっかりと取り付けられているため、細胞をプレートに直接リゼし、RNAおよびタンパク質分析用の材料を得ます。
- フローサイトメトリーのための材料の収集のために、皿に2 mM EDTAを含むPBSを追加し、37°で10分間細胞をインキュベートし、皿から細胞を穏やかに掻き取り、標準プロトコルで進む前に1.5 mLマイクロ遠心管で内容物を収集します。
5. フローサイトメトリー
- 培養培地を除去するためにPBS中の細胞をすすす。100,000細胞(各フローサイトメトリー条件あたり)をスピンダウンし、HuFcR結合阻害剤の2μLを含むPBSの100μLでペレットを再サスペンドします。RTで15分間インキュベートします。
- 50 μLの染色バッファーを加え、所望の抗体(ここでは、CD80、CD83、CD163、CD209を使用)を推奨量で添加します。
- ゆっくりと混ぜ、暗闇の中で4°Cで30分間インキュベートします。
- 2xをPBSで洗浄し、染色された細胞を150μLのPBSで再サスペンドしてから、サンプルをサイトフルオリメータで実行します。
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Representative Results
記載された手順を用いて、HIV感染者および健康なドナーからの原発性ヒト単球を単離した。ここで提示されたすべてのデータは、低い(<20コピー/mL)または検出不能なウイルス負荷と通常のCD4+T細胞数を有するcARTを受けているHIV+被験者から得られた。単離直後に細胞を染色し、フローサイトメトリーを行い、細胞集団の純度を確認した。結果は、>97%の細胞がCD14に対して陽性に染色されたことを示した(データは示されていない)。マクロファージの偏光のために、公開されたプロトコルが28を使用した。原発性ヒト単球をGM-CSFまたはM-CSFの存在下で6日間培養した。6日目に、細胞はM1またはM2マクロファージのいずれかに向かって活性化された。活性化後24時間、細胞を採取し、マクロファージ細胞マーカーのフローサイトメトリー分析のために染色した。
図1は、非活性化T0細胞と比較した場合のCD80およびCD83のレベルの増加およびCD163のレベルの低下を有するM1活性化対照(図1A)および患者由来(図1B)細胞の代表的なヒストグラム、ならびにCD163およびCD209のレベルが増加したM2活性細胞を示す。パネルCは、M1およびM2偏光細胞におけるCD80、CD83、CD163、およびCD209の発現を示す。グラフは、3つのコントロールおよび3つのHIV由来の細胞セットから得られた平均データを表します。予想通り、M2偏光細胞に比べてM1ではCD80およびCD83の発現量が増加し、CD209およびCD163はM1偏光細胞と比較してM2でより高発現した。興味深いことに、CD80およびCD83は、HIV由来細胞と比較して対照由来細胞においてより高く発現しているように見えた。しかしながら、HIV由来細胞における偏光マーカーの偏光レベルをコントロールと比較して偏光および/または発現する能力の潜在的な違いは、さらなる調査を必要とする。GM-CSF、M-CSF、LPS、およびIFN-γが治療として選択されたが、成長因子、サイトカイン、または刺激剤の他の組み合わせがこのプロトコル28で使用され得る。
予備実験の結果、単離手順が成功した結果、採取した単球を6枚のウェルプレートにめっきし、スクランブルされた近赤外線標識miRNAでトランスフェクトしてトランスフェクション効率を決定した。細胞を蛍光共焦点顕微鏡により24時間ポストトランスフェクションで画像化した。この方法により、フローサイトメトリー(図2A)および共焦点顕微鏡(図2B)により決定されるトランスフェクションの>90%効率が達成された。
次に、トランスフェクション後の細胞の生存率を判定した。図3は、細胞の生存率を示し、2人の患者(図3A)および2つのコントロール(図3B)に由来する細胞の平均として測定し、1日目(図3A)または4日目(図3B)でトランスフェクトし、7日目に収穫する。この実験では、50,000個の細胞を96個のマルチウェルプレート上にめっきし、プロトコルに従ってトランスフェクトした。一般に、トランスフェクションは、細胞の成熟の段階およびトランスフェクション条件(すなわち、モック、スクランブルsiRNA/miRNA、またはsiRNA/miRNA)に関係なく、細胞の生存率を有意に低下させなかった。なお、図3は、患者由来細胞(パネルA)および対照由来細胞(パネルB)から得られたデータを表す。これは、1つのサンプルで完全な実験を行うのに十分な細胞(1日目および4日目のトランスフェクションの生存率とウェスタンブロットの両方、トランスフェクション当たり6つの異なる条件で)を得ることができたので、必要であった。それにもかかわらず、この図は、対照または患者由来の細胞のいずれかで得られる代表的な結果を提供する。
次いで、標的mRNAに対するsiRNAトランスフェクションの有効性を、タンパク質発現を評価して評価した。図4の結果は、これらの細胞に非常に豊富な翻訳調節剤であるEIF4EBP1の効果的なダウンレギュレーションを示し、1日目(図4A)と4日目の両方で特異的なsiRNAを用いたトランスフェクション時(図4A)を示す(図4C)。同じレギュレータはまた、様々な制御条件下で発現を維持した(すなわち、トランスフェクトされていない、モック、スクランブルsiRNA、およびトランスフェクション試薬を用いないEIF4EBP1 siRNA:siR*)。1日目および4日目トランスフェクションのウェスタンブロット実験の定量を、それぞれ図4B及び図4Dに示す。また、HIV由来細胞のRT-qPCRにより1日目または4日目のトランスフェクション後のmiR-146a-5pの発現レベルを決定した(図4E)。miRNA模倣でトランスフェクトされた細胞は、トランスフェクトされていない細胞に対するmiRNA発現の48~72倍の増加を示したが、すべてのトランスフェクションコントロールは顕著な変化を示さない。
図1:単球由来マクロファージは、M1またはM2マクロファージ表現型に対して正常に偏光し、活性化される。1つの健制御(A)および1つのHIV由来細胞サンプル(B)に由来する細胞のフローサイトメトリー分析結果は、CD80、CD83、CD163、およびCD209のレベルを示す。実験は、2つの追加のコントロールと同様の結果を持つ2つの追加のHIV陽性サンプルで繰り返した。対象となる細胞集団は、前方および側面散乱パラメータに基づいてゲートされ、その後、二重の判別が続いた。(C)M1およびM2偏光細胞におけるCD80、CD83、CD163、およびCD209を示す棒グラフ。グラフは、3つのコントロール(Ctrl)および3つのHIV由来(Pts)細胞セットから得られた平均データと標準偏差を表します。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図2:原発性ヒトCD14+細胞がmiRNAで効率的にトランスフェクトされる。(A)健康対照に由来する一次単球のフローサイトメトリー分析は、24時間のトランスフェクション後、>90%トランスフェクション効率を示す。(B)24時間後のトランスフェクションを撮影した代表的な共焦点画像は、現場内のすべての細胞が近赤外線色素(白色)で共役したmiRNAを発現することを示す。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図3:トランスフェクトされた細胞の生存率グラフバーは、2つのHIV+患者(A)および2つの健康なコントロール(B)の平均細胞生存率を表し、比色アッセイを用いて決定し、miR-146a-5pまたはsiRNAをEIF4EBP1(siRNA)にトランスフェクションした後、1日目(A)または4日目(B)で適切なコントロールを、すべて7日目に試験した。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
図4:CD14+単球のsiRNA/miRNAトランスフェクション後分離時のタンパク質レベルの効率的なダウンレギュレーションコントロールおよびHIV由来単球(1x106細胞)を、EIF4EBP1 mRNAに対してsiRNAを用いて1日目(A)または4日目(C)後分離後にトランスフェクトした。パネル(B)および(D)は、GAPDHと比較したEIF4EBP1発現の定量を表し、患者(Pt)または制御(Ctrl)(A)または患者または対照(B)に対してトランスフェクトされていない場合のモックに対するモックに対するパーセンテージとして表されます。(E)4日目(棒1~4)または1日目(右棒)でトランスフェクトしたHIV由来細胞におけるmiR-146a-5p発現を示す2つの実験の代表的な棒グラフを、7日目に収穫した。折り畳み変化は、トランスフェクトされていないサンプル(siR =siRNA)に対して計算されます。siR*またはmiR-145a-5p*は、トランスフェクション試薬を使用しないsiRNAまたはmiR-146a-5pを用いた細胞のインキュベーションを示す。実験を対照由来細胞で2倍繰り返し、本質的に同じ結果を生成した(データは示していない)。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
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Discussion
提示されたプロトコルは、単球およびマクロファージを研究するためのモデルとしてHIV感染被験者からの一次細胞の使用を示す。HIV+cARTを受けている患者は、何年も感染症と共に生きており、また、侵害された免疫系に関連する他の共感染を持つことができます。HIV慢性感染の存在下で免疫調節を研究するために、細胞を患者から直接採取した。miRNAが細胞の発達と分化に大きな役割を果たしていることが示されているように、プロトコルはこれらの一次細胞におけるmiRNA発現を操作する能力に焦点を当てています(図2、図3、図4)。同じ手順を使用すると、このプロトコルは siRNA にも非常に適しています (図 3、図 4)。成熟マクロファージの潜在的な貪食活性のために、模擬およびスクランブルsiRNA制御に加えて、トランスフェクション試薬が省略される制御(図3および図4でsiR*またはmiR*として示される)が使用される。データは、トランスフェクション試薬が細胞への適切なsiRNA/miRNA送達に必要であることを確認し、試薬を使用しない場合と同様に、細胞はすでにマクロファージに分化している場合でもmiRNAまたはsiRNAを自発的に取り込まない(めっきおよび偏光後4日目、図3および図4)。
ヒト一次CD14+単球の単離およびトランスフェクションに市販のキットを使用する一方で、手順を再現可能かつ成功させるために最適化された重要なステップがあります。具体的には、1)めっきされた細胞数は、その生存および分化のために重要であり、1x 106細胞/35mm皿が最も有効であることがわかった。2)単離されたばかりのCD14+細胞は、FBSの存在下で播種した場合、培養皿に均一に付着しない。その結果、トランスフェクション後に培地4時間を交換すると、未接続の細胞はすべて除去され、プレート間の条件が非常に可変になります。3)トランスフェクション後の培地4時間を置き換えると、トランスフェクションの効率に影響を及ぼさないままトランスフェクション試薬による毒性を低減することが分かった。4)トランスフェクション条件は、製造業者が推奨する濃度(25nM)よりも少ないsiRNAまたはmiRNA(15nM)を必要とするように最適化された。5)細胞の非常に付着性のために、プレートに直接リシス緩衝液を添加すると、収穫されたタンパク質またはRNAの濃度が大幅に改善される。ただし、プレートから細胞を除去する必要がある場合(すなわち、フローサイトメトリー分析のために)、EDTAでPBSを使用し、細胞を穏やかに削ることをお勧めします。収集した細胞の数を約20%~30%減らすため、さらなる解析のために十分な細胞数を得るために実験を計画することが重要です。
この手順を正しく行うと、高純度の CD14+単球の集団の取得、miRNA などの siRNA および小さな RNA のトランスフェクション、培養条件、および M1 または M2 マクロファージへの差別化が示されます。この方法は、HIV以外の複雑な疾患や感染症を研究するために適用することができます。
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Disclosures
著者たちは何も開示する必要はない。
Acknowledgments
著者らは、患者サンプルを提供するためのHIV臨床/腫瘍バイオレポジトリコアと、フローサイトメトリー分析を提供するための細胞免疫学代謝コアに感謝したいと考えています。このプロジェクトは、NIH P20GM121288とP30GM114732によって資金提供されました。
Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
0.5M EDTA | Invitrogen | AM9260G | |
BD Vacutainer Plastic Blood Collection Tubes with K2EDTA | BD Biosciences | 366643 | |
Brilliant Stain Buffer | BD Horizon | 563794 | Flow cytometry |
CD14 PerCP | Invitrogen | 46-0149-42 | Flow cytometry- conjugated antibody |
CD163 BV711 | BD Horizon | 563889 | Flow cytometry- conjugated antibody |
CD209 BV421 | BD Horizon | 564127 | Flow cytometry- conjugated antibody |
CD80 FITC | BD Horizon | 557226 | Flow cytometry- conjugated antibody |
CD83 APC | BD Horizon | 551073 | Flow cytometry- conjugated antibody |
Easy 50 EasySep Magnet | StemCell Technologies | 18002 | |
Easy Sep Direct Human Monocyte Isolation Kit | StemCell Technologies | 19669 | |
EIF4EBP1 mAb | Cell Signaling | 9644 | Monoclonal antibody for Western blot |
EIF4EBP1 siRNA | Santa Cruz | sc-29594 | |
Fetal Bovin Serum Defined Heat Inactivated | Hyclone | SH30070.03HI | |
Gallios Flow Cytometer | Beckman Coulter | B43618 | |
GAPDH mAb | Santa Cruz | SC-47724 | Monoclonal antibody for Western blot |
HuFcR Binding Inhibitor | eBiosciences | 14-9161-73 | Flow cytometry- blocking buffer |
Kaluza Analysis Software | Beckman Coulter | B16406 | Software to analyze flow cytometry data |
Lipopolysaccharides from Escherichia coli O55:B5 | Sigma | L4524 | |
miRCURY LNA microRNA Mimic hsa-miR-146a-5p | Qiagen | YM00472124 | |
MISSION miRNA Negative Control | Sigma | HMC0002 | Scrambled miRNA conjugated with a near infrared dye |
Nunc 35mm Cell Culture Dish | Thermo Scientific | 150318 | |
PBS | Gibco | 20012027 | |
Penicillin-Streptomycin | Gibco | 15140122 | |
Recombinant Human GM-CSF | R&D Systems | 215-GM-050 | |
Recombinant Human IFN-γ | R&D Systems | 285-IF-100 | |
Recombinant Human IL-4 | R&D Systems | 204-IL-010 | |
Recombinant Human M-CSF | R&D Systems | 216-MC-025 | |
RPMI 1640 with L-Glutamine | Corning | 10040CVMP | |
Scrambled Control siRNA | Santa Cruz | sc-37007 | |
Viromer Blue Transfection Reagent Kit | Lipocalyx | VB-01LB-01 | |
WST-1 Cell Proliferation Reagent | Roche | 5015944001 | Colorimetric assay to assess cell viability |
References
- Slim, J., Saling, C. F. A Review of Management of Inflammation in the HIV Population. Biomedical Research International. 2016, 3420638 (2016).
- Herskovitz, J., Gendelman, H. E. HIV and the Macrophage: From Cell Reservoirs to Drug Delivery to Viral Eradication. Journal of Neuroimmune Pharmacology. 14 (1), 52-67 (2019).
- Machado Andrade, V., Stevenson, M. Host and Viral Factors Influencing Interplay between the Macrophage and HIV-1. Journal of Neuroimmune Pharmacology. 14 (1), 33-43 (2019).
- Merino, K. M., Allers, C., Didier, E. S., Kuroda, M. J. Role of Monocyte/Macrophages during HIV/SIV Infection in Adult and Pediatric Acquired Immune Deficiency Syndrome. Frontiers in Immunology. 8, 1693 (2017).
- Wacleche, V. S., Tremblay, C. L., Routy, J. P., Ancuta, P. The Biology of Monocytes and Dendritic Cells: Contribution to HIV Pathogenesis. Viruses. 10 (2), (2018).
- Davis, M. J., et al. Macrophage M1/M2 polarization dynamically adapts to changes in cytokine microenvironments in Cryptococcus neoformans infection. MBio. 4 (3), e00264 (2013).
- Raggi, F., et al. Regulation of Human Macrophage M1-M2 Polarization Balance by Hypoxia and the Triggering Receptor Expressed on Myeloid Cells-1. Frontiers in Immunology. 8, 1097 (2017).
- Van Overmeire, E., et al. M-CSF and GM-CSF Receptor Signaling Differentially Regulate Monocyte Maturation and Macrophage Polarization in the Tumor Microenvironment. Cancer Research. 76 (1), 35-42 (2016).
- Vogel, D. Y., et al. Human macrophage polarization in vitro: maturation and activation methods compared. Immunobiology. 219 (9), 695-703 (2014).
- Almeida, M., Cordero, M., Almeida, J., Orfao, A. Different subsets of peripheral blood dendritic cells show distinct phenotypic and functional abnormalities in HIV-1 infection. AIDS. 19 (3), 261-271 (2005).
- Ciesek, S., et al. Impaired TRAIL-dependent cytotoxicity of CD1c-positive dendritic cells in chronic hepatitis C virus infection. Journal of Viral Hepatitis. 15 (3), 200-211 (2008).
- Granelli-Piperno, A., Golebiowska, A., Trumpfheller, C., Siegal, F. P., Steinman, R. M. HIV-1-infected monocyte-derived dendritic cells do not undergo maturation but can elicit IL-10 production and T cell regulation. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 101 (20), 7669-7674 (2004).
- Hearps, A. C., et al. HIV infection induces age-related changes to monocytes and innate immune activation in young men that persist despite combination antiretroviral therapy. AIDS. 26 (7), 843-853 (2012).
- Heggelund, L., et al. Stimulation of toll-like receptor 2 in mononuclear cells from HIV-infected patients induces chemokine responses: possible pathogenic consequences. Clinical and Experimental Immunology. 138 (1), 116-121 (2004).
- Hernandez, J. C., et al. Up-regulation of TLR2 and TLR4 in dendritic cells in response to HIV type 1 and coinfection with opportunistic pathogens. AIDS Research and Human Retroviruses. 27 (10), 1099-1109 (2011).
- Hernandez, J. C., Latz, E., Urcuqui-Inchima, S. HIV-1 induces the first signal to activate the NLRP3 inflammasome in monocyte-derived macrophages. Intervirology. 57 (1), 36-42 (2014).
- Low, H. Z., et al. TLR8 regulation of LILRA3 in monocytes is abrogated in human immunodeficiency virus infection and correlates to CD4 counts and virus loads. Retrovirology. 13, 15 (2016).
- Sachdeva, M., Sharma, A., Arora, S. K. Functional Impairment of Myeloid Dendritic Cells during Advanced Stage of HIV-1 Infection: Role of Factors Regulating Cytokine Signaling. PLoS ONE. 10 (10), e0140852 (2015).
- Sachdeva, M., Sharma, A., Arora, S. K. Increased expression of negative regulators of cytokine signaling during chronic HIV disease cause functionally exhausted state of dendritic cells. Cytokine. 91, 118-123 (2017).
- Bartel, D. P. MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function. Cell. 116 (2), 281-297 (2004).
- Li, H., Jiang, T., Li, M. Q., Zheng, X. L., Zhao, G. J. Transcriptional Regulation of Macrophages Polarization by MicroRNAs. Frontiers in Immunology. 9, 1175 (2018).
- Hu, X., et al. Genome-Wide Analyses of MicroRNA Profiling in Interleukin-27 Treated Monocyte-Derived Human Dendritic Cells Using Deep Sequencing: A Pilot Study. International Journal of Molecular Sciences. 18 (5), (2017).
- Huang, J., et al. MicroRNA miR-126-5p Enhances the Inflammatory Responses of Monocytes to Lipopolysaccharide Stimulation by Suppressing Cylindromatosis in Chronic HIV-1 Infection. Journal of Virology. 91 (10), (2017).
- Lodge, R., et al. Host MicroRNAs-221 and -222 Inhibit HIV-1 Entry in Macrophages by Targeting the CD4 Viral Receptor. Cell Reports. 21 (1), 141-153 (2017).
- Ma, L., Shen, C. J., Cohen, E. A., Xiong, S. D., Wang, J. H. miRNA-1236 inhibits HIV-1 infection of monocytes by repressing translation of cellular factor VprBP. PLoS ONE. 9 (6), e99535 (2014).
- Riess, M., et al. Interferons Induce Expression of SAMHD1 in Monocytes through Down-regulation of miR-181a and miR-30a. Journal of Biological Chemistry. 292 (1), 264-277 (2017).
- Buchacher, T., Ohradanova-Repic, A., Stockinger, H., Fischer, M. B., Weber, V. M2 Polarization of Human Macrophages Favors Survival of the Intracellular Pathogen Chlamydia pneumoniae. PLoS ONE. 10 (11), e0143593 (2015).
- Jaguin, M., Houlbert, N., Fardel, O., Lecureur, V. Polarization profiles of human M-CSF-generated macrophages and comparison of M1-markers in classically activated macrophages from GM-CSF and M-CSF origin. Cellular Immunology. 281 (1), 51-61 (2013).
- Lacey, D. C., et al. Defining GM-CSF- and macrophage-CSF-dependent macrophage responses by in vitro models. Journal of Immunology. 188 (11), 5752-5765 (2012).
- Tarique, A. A., et al. Phenotypic, functional, and plasticity features of classical and alternatively activated human macrophages. American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 53 (5), 676-688 (2015).