נורמליזציה נולד עבור טומוגרפיה Fluorescence הקרנה אופטית עבור הדמיה בלב שלם
Summary
אנו מציעים גישה מנורמל נולד עבור טומוגרפיה הקרנה אופטי (BnOPT) אשר מהווה את מאפייני הקליטה של דגימות צילמו להשיג מדויק כמותי שחזורים הקרינה טומוגרפית. אנו משתמשים באלגוריתם המוצע לשחזר את התפלגות הקרינה בדיקה מולקולרית בתוך איברי חיה קטנה.
Abstract
טומוגרפיה הקרנה אופטית היא טכניקת הדמיה תלת ממדית, כי כבר הציג לאחרונה ככלי הדמיה בעיקר בביולוגיה התפתחותית והבעה מחקרים הגן. הטכניקה מעבד מדגם הביולוגי שקוף אופטית ידי הראשון dehydrating אותם ולאחר מכן הצבת בתערובת של בנזיל אלכוהול ו בנזיל בנזואט ביחס של 2:1 (באב או מוריי פתרון של נקה). הטכניקה הופכת דגימות ביולוגיות שקוף אופטית ידי הראשון dehydrating אותם פתרונות אתנול מדורגים ואז למקם אותם בתערובת של בנזיל אלכוהול ו בנזיל בנזואט ביחס של 2:1 (באב או פתרון ברור של מוריי) כדי לנקות. לאחר תהליך ניקוי תרומת פיזור במדגם, ניתן להפחית באופן משמעותי ועשה כמעט זניח ואילו תרומתו הקליטה לא ניתן למנוע לחלוטין. כאשר מנסים לשחזר את התפלגות הקרינה בתוך המדגם תחת חקירה, תרומה זו משפיעה על שחזורים מוביל, בהכרח, על חפצים התמונה שגיאות כימות .. אמנם הקליטה יכול להיות מופחת נוסף עם קביעות של שבועות או חודשים בתקשורת ניקוי, זה יוביל לאובדן הדרגתי של הקרינה ואת זמן ריאלית עיבוד המדגם. הדבר נכון כאשר הן בשחזור סוכנים בניגוד אקסוגניים (סוכנים בניגוד מולקולרית), כמו גם בניגוד אנדוגני (למשל שחזורים של חלבוני ניאון הביע גנטית).
Protocol
Acknowledgements
ג Vinegoni מודה תמיכה של המכונים הלאומיים לבריאות (NIH) מענק 1-RO1-EB006432.
References
- Sharpe, J., Ahlgren, U., Perry, P., Hill, B., Ross, A., Hecksher-Sorensen, J., Baldock, R., Davidson, D. Optical projection tomography as a tool for 3D microscopy and gene expression studies. Science. 296, 541-544 (2002).
- Lee, K., Avondo, J., Morrison, H., Blot, L., Stark, M., Sharpe, J., Bangham, A., Coen, E. Visualizing plant development and gene in three dimensions using optical projection tomography. Plant Cell. 18, 2145-2156 (2006).
- Oldham, M., Sakhalkar, H., Wang, Y. M., Guo, P. Y., Oliver, T., Bentley, R., Vujaskovic, Z., Dewhirst, M. Three-dimensional imaging of whole rodent organs using optical computed and emission tomography. J. Biomed. Opt. 12, 1-10 (2007).
- Ntziachristos, V., Weissleder, R. Experimental three-dimensional fluorescence reconstruction of diffuse media by use of a normalized Born approximation. Opt. Lett. 26, 893-895 (2001).
