Summary

Dannelse av biomembranen Mikromatriser med en nal-basert Assembly Method

Published: May 08, 2014
doi:

Summary

Støttede lipid bilayers og naturlige membran partikler er praktiske systemer som kan tilnærme egenskapene til cellemembraner og bli innlemmet i en rekke analytiske strategier. Her viser vi en metode for å forberede mikromatriser sammensatt av støttede lipid dobbeltlag-belagt SiO 2 perler, fosfolipid blemmer eller naturlige membran partikler.

Abstract

Lipide dobbeltlagsmembraner danne plasmamembranen av celler, og definerer grensene for subcellulære organeller. I naturen er disse membraner er heterogene blandinger av mange typer av lipider, inneholde membranbundne proteiner og er dekorert med karbohydrater. I noen eksperimenter, er det ønskelig å kople de biofysiske og biokjemiske egenskaper til lipid-dobbeltlag fra de av naturlig membran. Slike tilfeller krever bruk av modellsystemer slik som store vesikler, liposomer eller støttet lipid dobbeltlag (SLBs). Matriser av SLBs er spesielt attraktive for sensing applikasjoner og hermet celle-celle interaksjoner. Her beskriver vi en ny metode for å danne SLB arrays. Submicron diameter SiO 2 perler er først belagt med lipid bilayers å danne sfæriske SLBs (SSLBs). Perlene ble deretter satt inn på en matrise av mikro-fabrikerte submikron-diameter mikrobrønner. Fremstillingen teknikken bruker en "nal" for å rense substratoverflaten, mens leaving bak SSLBs som har slått seg ned i mikrobrønner. Denne metoden krever ingen kjemisk endring av mikro underlaget, og heller ikke noen spesielle rettet ligander på SSLB. Mikro er opptatt av enkelt perler fordi brønnen diameter er innstilt til å være akkurat større enn diameteren perle. Vanligvis er mer 75% av brønnene er opptatt, mens resten forblir tom. I buffer SSLB matriser viser langsiktig stabilitet på mer enn en uke. Flere typer av SSLBs kan plasseres i en enkelt rekke ved serie avsetning, og de matriser kan benyttes for avføling, som demonstrerer vi ved å karakterisere interaksjonen mellom koleratoksin med gangliosid GM1. Vi viser også at fosfolipid-vesikler uten bead støtter og biomembraner fra cellulære kilder kan være sammenstilt med den samme metode og celle-spesifikke membranlipider kan identifiseres.

Introduction

Lipid-dobbeltlag-membraner er viktige strukturer i naturen. Cellular plasmamembraner og organelle membraner er sammensatt av lipid dobbeltlag som inneholder en rekke molekyler som er nødvendig for liv. Mange livsnødvendige prosesser forekommer på overflaten av celler eller mediert av molekyler assosiert med lipid-dobbeltlag-membraner. Faktisk er mange legemidler mål-prosesser eller molekyler funnet på eller i membraner 1,2. Det er derfor nødvendig å analytisk undersøke prosesser, for eksempel kjemiske reaksjoner eller kovalente bindende hendelser som oppstår på membran flater. Fordi naturlige membraner kan være vanskelig å isolere og / eller grensesnitt med sensorer, benytter mange forskere forenklet modell membraner for å utføre analytiske studier. En rekke modellmembransystemer er beskrevet i litteraturen, som strekker seg fra store vesikler som kan være flere titalls til flere hundre mikron i diameter til liposomer med nanoskala dimensjoner 3,4. Alternatively, planar lipid bilayers avsatt på fast underlag, dvs. støttet lipid dobbeltlag (SLBs), kan være dannet på en rekke ulike overflater, og har vært mye brukt i biofysiske, biokjemiske og analytiske applikasjoner fem. Kopling SLBs med elektriske eller optiske materialer muliggjør undersøkelse av membran biokjemi og biofysikken ved bruk av forskjellige analytiske teknikker. Fluorescens mikroskopi 6, elektrokjemi 7, optisk spektroskopi 8, scanning probe mikros 9, overflate plasmonresonans 10, og massespektrometri 11 har alle blitt ansatt for å studere struktur og egenskaper av SLBs.

SLB arrays gir ekstra allsidighet i utformingen av sensorer for multiplex analyser 12,13. Andre programmer bruker SLB arrays for å etterligne krysset som utgjør mellom immunceller 14. Tilberedningsmetoder for SLB arrays har variert fra microfluidic nærmer 15 til de som benytter fysiske barrierer mellom tilstøtende SLB patcher. 16 Andre grupper har brukt trykkmetoder 17, fotokjemisk mønster 18 og ulike nanoengineering nærmer 19 å opprette SLB arrays.

I denne utredningen og medfølgende video viser vi en metode for forming SLB arrays ved å deponere SLB-belagte SiO 2 perler inn bestilte matriser av mikro 20. Vi viser til SLB-belagte SiO 2 perler som sfæriske støttede lipid dobbeltlag (SSLBs). Denne teknikken er en forlengelse av tidligere arbeid som er laget matriser av fosfolipid-vesikler og biomembraner avledet fra naturlige kilder 21, hvorfra vi viser også eksempelresultater. Andre metoder for arraying biomembrane partikler eller blemmer har stolt på mønstre av spesifikke målgruppe ligander på overflater som assosierer med utfyllende ligander som finnes på vesikkel overflaten. Eksempler inkluderer biotin-avidin foreningen 22,23 og DNA hybridisering ordninger 24. Vår tilnærming krever bare et mikromatrise uten målretting eller anerkjennelse moieties nødvendige. Størrelsen på SSLBs defineres av diameteren av SiO to kulestøttene, som har lav poly-dispersitet. Ved å justere diameteren mikro å bare større enn diameteren SSLB, legger seg bare en enkelt SSLB inn i hver mikrobrønn. Et poly (dimetylsiloksan) (PDMS) nalen deretter fjernes fra overflaten alle SSLBs som ikke er immobilisert i mikrobrønner. De mikrobrønner og resulterende SSLB matriser har høy tetthet (~ 10 5 SSLBs / mm 2) med 3 mikrometer senter-til senteravstanden, og heksagonale periodisitet. Ved serie deponering SSLBs med forskjellig lipid sammensetning, er det mulig å lage flerkomponent matriser med tilfeldig plasserte SSLBs. For å demonstrere sensing evnen til SSLB arrays, brukte vi et samspill av kolera toksin (CTx) med en ganglioside (GM1) innarbeidet i SSLBs. Mednaturlige membran-partikler var vi i stand til å oppdage cellespesifikke lipider i multikomponent matriser inneholdende membranmaterialet fra to forskjellige celletyper.

Protocol

En. Microfabrication av mikro Array Underlag Start med en 4 tommers silisiumskive med 100 nm av termisk vokst oksid. Spin SPR-955 0,7 fotoresist på silikonskiven ved 4000 opm i 30 sek. Bake på en varmeplate ved 115 ° C i 90 sek. Expose fotoresist. Bruk en maske som vil skape en mikrometer hull anordnet i et sekskantet oppstilling med et 3 mikrometer periode hvor matrisen omfatter et 2 mm x 2 mm-området. Eksponer skive i en i-linje stepper ved hjelp av en tr…

Representative Results

Når SiO to perler blandes med en løsning av vesikler som består av fosfolipider, fluorescerende lipider og andre lipider slik som gangliosider, vesikler briste på kuleflater SiO 2 for å danne SSLBs, som vist skjematisk i figur 1a. Etter vasking av SSLBs, blir en dråpe SSLB løsningen plassert på en mikrorekke og kulene får lov til å slå seg ned til overflaten. (Fig. 1B1) Dette kan også gjøres med en suspensjon av fosfolipid-vesikler eller naturlige memb…

Discussion

I dette arbeidet viser vi at monodisperse SiO to kuler belagt med støttede lipid dobbeltlag kan være sammenstilt i mikro arrays uten behov for målretting ligander på lipid-dobbeltlag, eller substratets overflate, og de ​​matriser kan anvendes for å karakterisere toksin-lipid interaksjonene. Den dissosiasjonskonstant beregnet vi for CTx/GM1 binding sammenligner gunstig, gitt stor spredning av verdiene i litteraturen, med en tidligere rapport av Winter et al. Hvor kolloidal sammenstilling av l…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Dette arbeidet ble støttet med tilskudd til SHO fra National Institutes of Health (R01 GM092993), National Science Foundation (NSF KARRIERE Award og DBI 0.964.216), Office of Naval Research (ONR) Young Investigator Program og Minnesota Partnership Award for bioteknologi og Medisinsk Genomics. Device fabrikasjon ble utført ved University of Minnesota Nanofabrication Center (NFC), som mottar støtte fra NSF gjennom National Nanoteknologi Infrastructure Network. Dette arbeidet ble også støttet med tilskudd til MR fra National Institutes of Health (NS048357, R21 NS073684), National Multiple Sclerosis Society (CA1060A11), den Applebaum, Hilton, Peterson og Sanford Foundations og MCNEILUS familien. Forfatterne ønsker å takke Hyungsoon Im for å få hjelp med illustrasjoner og Shailabh Kumar for hjelp med scanning elektronmikroskopi.

Materials

4-inch silicon wafers University Wafer 425
Shipley MEGAPOSIT SPR955-CM 0.7 photoresist MicroChem SPR955-CM
Shipley MICROPOSIT CD-26 developer MicroChem CD-26
i-line stepper Canon 2500 i3 stepper
Vision 320 reactive ion etcher Advanced Vacuum Vision 320 RIE
Deep trench reactive ion etcher Plasma Therm SLR-770
Atomic layer depostion system Cambridge NanoTech Savannah
Dow Corning Sylgard 184 poly(dimethylsiloxane) kit Ellsworth Adhesives 184 SIL ELAST KIT 0.5KG
egg phosphatidylcholine Avanti Polar Lipids 840051C
1,2-dipalmitoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-(lissamine rhodamine B sulfonyl) ammonium salt Avanti Polar Lipids 810158C
monosialoganglioside GM1  Avanti Polar Lipids 860065P
Silica beads Bangs Laboratories SS03N/4666 Packaging on the bead container states the beads are 900 nm in diameter. However, after light-scattering and electron microscopy we determined the beads are roughly 700 nm in diameter.
Cholera toxin B-subunit, Alexa 488 conjugate Molecular Probes C-34775
Anti-oligodentrocyte antibody IgM O4, NorthernLights 557 conjugate R&D Systems NL1326R
FM1-43 Molecular Probes T-3136
Eppendorf MiniSpin centrifuge Fisher Scientific 05-401-09

References

  1. Drews, J. Drug discovery: A Historical Perspective. Science. 287 (5460), 1960-1964 (1126).
  2. Cooper, M. A. Advances in Membrane Receptor Screening and Analysis. J. Mol. Recognit. 17 (4), 286-315 (2004).
  3. Voskuhl, J., Ravoo, B. J. Molecular Recognition of Bilayer Besicles. Chem. Soc. Rev. 38 (2), 495-505 (2009).
  4. Walde, P., Cosentino, K., Engel, H., Stano, P. Giant Vesicles: Preparations and Applications. Chembiochem. 11 (7), 848-865 (1002).
  5. Castellana, E. T., Cremer, P. S. Solid Supported Lipid Bilayers: From Biophysical Studies to Sensor Design. Surf. Sci. Rep. 61 (10), 429-444 (2006).
  6. Johnson, J. M., Ha, T., Chu, S., Boxer, S. G. Early Steps of Supported Bilayer Formation Probed by Single Vesicle Fluorescence Assays. Biophys. J. 83 (6), 3371-3379 (2002).
  7. Krysinski, P., Zebrowska, A., Michota, A., Bukowska, J., Becucci, L., Moncelli, M. R. Tethered Mono- and Bilayer Lipid Membranes on Au and Hg. Langmuir. 17 (13), 3852-3857 (2001).
  8. Li, L., Wang, H. F., Cheng, J. X. Quantitative Coherent anti-Stokes Raman Scattering Imaging of Lipid Distribution in Coexisting Domains. Biophys. J. 89 (5), 3480-3490 (2005).
  9. Richter, R. P., Brisson, A. R. Following the Formation of Supported Lipid Bilayers on Mica: A Study Combining AFM, QCM-D, and Ellipsometry. Biophys. J. 88 (5), 3422-3433 (2005).
  10. Dahlin, A., Zäch, M., Rindzevicius, T., Käll, M., Sutherland, D. S., Höök, F. Localized Surface Plasmon Resonance Sensing of Lipid-Membrane-Mediated Biorecognition Events. J. Am. Chem. Soc. 127 (14), 5043-5048 (2005).
  11. Kraft, M. L., Weber, P. K., Longo, M. L., Hutcheon, I. D., Boxer, S. G. Phase Separation of Lipid Membranes Analyzed with High-Resolution Secondary Ion Mass Spectrometry. Science. 313 (5795), 1948-1951 (2006).
  12. Groves, J. T., Boxer, S. G. Micropattern Formation in Supported Lipid Membranes. Acc. Chem. Res. 35 (3), 149-157 (2002).
  13. Bally, M., Bailey, K., Sugihara, K., Grieshaber, D., Vörös, J., Stadler, B. Liposome and Lipid Bilayer Arrays Towards Biosensing Applications. Small. 6 (22), 2481-2497 (2010).
  14. Groves, J. T., Dustin, M. L. Supported Planar Bilayers in Studies on Immune Cell Adhesion and Communication. J. Immunol. Methods. 278 (1-2), 19-32 .
  15. Yang, T. L., Jung, S. Y., Mao, H. B., Cremer, P. S. Fabrication of Phospholipid Bilayer-Coated Microchannels for On-Chip Immunoassays. Anal. Chem. 73 (2), 165-169 (2001).
  16. Groves, J. T., Ulman, N., Boxer, S. G. Micropatterning Fluid Lipid Bilayers on Solid Supports. Science. 275 (5300), 651-653 (1997).
  17. Hovis, J. S., Boxer, S. G. Patterning and Composition Arrays of Supported Lipid Bilayers by Microcontact Printing. Langmuir. 17 (11), 3400-3405 (2001).
  18. Yee, C. K., Amweg, M. L., Parikh, A. N. Direct Photochemical Patterning and Refunctionalization of Supported Phospholipid Bilayers. J. Am. Chem. Soc. 126 (43), 13962-13972 (2004).
  19. Kelly, C. V., Craighead, H. G. Nanofabrication for the Analysis and Manipulation of Membranes. Ann. Biomed. Eng. 40 (6), 1356-1366 (2012).
  20. Wittenberg, N. J., Johnson, T. W., Oh, S. H. High-Density Arrays of Submicron Spherical Supported Lipid Bilayers. Anal. Chem. 84 (19), 8207-8213 (2012).
  21. Wittenberg, N. J., et al. Facile Assembly of Micro- and Nanoarrays for Sensing with Natural Cell Membranes. ACS Nano. 5 (9), 7555-7564 (2011).
  22. Stamou, D., Duschl, C., Delamarche, E., Vogel, H. Self-Assembled Microarrays of Attoliter Molecular Vessels. Angew. Chem. Int. Ed. 42 (45), 5580-5583 (2003).
  23. Kalyankar, N. D., et al. Arraying of Intact Liposomes into Chemically Functionalized Microwells. Langmuir. 22 (12), 5403-5411 (2006).
  24. Dahlin, A. B., Jonsson, M. P., Höök, F. Specific Self-Assembly of Single Lipid Vesicles in Nanoplasmonic Apertures in Gold. Adv. Mater. 20 (8), 1436-1442 (2008).
  25. Nair, P. M., Salaita, K., Petit, R. S., Groves, J. T. Using Patterned Supported Lipid Membranes to Investigate the Role of Receptor Organization in Intercellular Signaling. Nat. Protoc. 6 (4), 523-539 (2011).
  26. Kuziemko, G. M., Stroh, M., Stevens, R. C. Cholera Toxin Binding Affinity and Specificity for Gangliosides Determined by Surface Plasmon Resonance. Biochemistry. 35 (20), 6375-6384 (1996).
  27. Moran-Mirabal, J. M., Edel, J. B., Meyer, G. D., Throckmorton, D., Singh, A. K., Craighead, H. G. Micrometer-Sized Supported Lipid Bilayer Arrays for Bacterial Toxin Binding Studies Through Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy. Biophys. J. 89 (1), 296-305 (2005).
  28. Shi, J. J., Yang, T. L., Kataoka, S., Zhang, Y. J., Diaz, A. J., Cremer, P. S. GM1 Clustering Inhibits Cholera Toxin Binding in Supported Phospholipid Membranes. J. Am. Chem. Soc. 129 (18), 5954-5961 (2007).
  29. Gill, D. M. The Arrangement of Subunits in Cholera Toxin. Biochemistry. 15 (6), 1242-1248 (1021).
  30. Weng, K. C., Kanter, J. L., Robinson, W. H., Frank, C. W. Fluid Supported Lipid Bilayers Containing Monosialoganglioside GM1: A QCM-D and FRAP study. Colloid Surface B. 50 (1), 76-84 (1016).
  31. Walt, D. R. Fibre Optic Microarrays. Chem. Soc. Rev. 39 (1), 38-50 (2010).
  32. Bake, K. D., Walt, D. R. Multiplexed Spectroscopic Detections. Annu. Rev. Anal. Chem. 1 (1), 515-547 (2008).
  33. Kundu, J., Levin, C. S., Halas, N. J. Real-Time Monitoring of Lipid Transfer Between Vesicles and Hybrid Bilayers on Au Nanoshells Using Surface Enhanced Raman Scattering (SERS). Nanoscale. 1 (1), 114-117 (2009).
  34. Junesch, J., Sannomiya, T., Dahlin, A. B. Optical Properties of Nanohole Arrays in Metal-Dielectric Double Films Prepared by Mask-on-Metal Colloidal Lithography. ACS Nano. 6 (11), 10405-10415 (2012).
  35. Wu, M., Holowka, D., Craighead, H. G., Baird, B. Visualization of Plasma Membrane Compartmentalization with Patterned Lipid Bilayers. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (38), 13798-13803 (2004).
  36. Hatzakis, N. S., Bhatia, V. K., Larsen, J., Madsen, K. L., Bolinger, P. Y., Kunding, A. H., Castillo, J., Gether, U., Hedegard, P., Stamou, D. How Curved Membranes Recruit Amphipathic Helices and Protein Anchoring Motifs. Nat. Chem. Biol. 5 (11), 835-841 (2009).
  37. Roizard, S., Danelon, C., Hassaine, G., Piguett, J., Schulze, K., Hovius, R., Tampe, R., Vogel, H. Activation of G-Protein-Coupled Receptors in Cell-Derived Plasma Membranes Supported on Porous Beads. J. Am. Chem. Soc. 133 (42), 16868-16874 (2011).
check_url/51501?article_type=t

Play Video

Cite This Article
Wittenberg, N. J., Johnson, T. W., Jordan, L. R., Xu, X., Warrington, A. E., Rodriguez, M., Oh, S. Formation of Biomembrane Microarrays with a Squeegee-based Assembly Method. J. Vis. Exp. (87), e51501, doi:10.3791/51501 (2014).

View Video