Mechanisms of cellular and intra-cellular scaling remain elusive. The use of Xenopus embryo extracts has become increasingly common to elucidate mechanisms of organelle size regulation. This method describes embryo extract preparation and a novel nuclear scaling assay through which mechanisms of nuclear size regulation can be identified.
Uma questão fundamental em biologia celular é como tamanhos de células e organelas são regulados. Tem sido desde há muito reconhecido que o tamanho do núcleo geralmente escalas com o tamanho da célula, nomeadamente durante a embriogénese, quando ocorrer uma redução dramática tanto na célula e tamanhos nucleares. Mecanismos de regulação tamanho nuclear são em grande parte desconhecido e pode ser relevante para o cancro onde o tamanho nuclear alterada é um parâmetro de diagnóstico e prognóstico chave. In vivo abordagens para identificar reguladores tamanho nuclear são complicados pela natureza essencial e complexo da função nuclear. A abordagem in vitro descrito aqui para estudar o controlo tamanho nuclear aproveita as reduções de tamanho normal nucleares que ocorrem durante o desenvolvimento de Xenopus laevis. Em primeiro lugar, os núcleos são montados em X. laevis extracto de ovo. Em seguida, esses núcleos são isoladas e novamente suspensas em citoplasma de embriões de fase tardia. Depois de um período de 30 – 90 min de incubação, a área de superfície nucleardiminui em 20 – 60%, proporcionando um ensaio útil para identificar componentes citoplasmáticos presentes em embriões de fase tardia que contribuem para o desenvolvimento de escalonamento tamanho nuclear. Uma das principais vantagens desta abordagem é a relativa facilidade com que os extractos de ovos, bem como de embriões pode ser manipulado bioquimicamente, permitindo a identificação de novas proteínas e actividades que regulam o tamanho nuclear. Tal como acontece com qualquer uma abordagem in vitro, a validação dos resultados de um sistema in vivo é importante, e micro-injecção de X. embriões laevis é particularmente apropriado para estes estudos.
Os tamanhos de organelos celulares tipicamente dimensionado de acordo com o tamanho da célula, e esta tem sido talvez mais bem documentadas para o dimensionamento do tamanho dos núcleos com tamanho de célula de 1-10. Isto é particularmente verdadeiro durante a embriogénese e diferenciação celular, quando reduções dramáticas em ambos celular e tamanho nuclear são frequentemente observados 11,12. Além disso, o tamanho nuclear alterado é um parâmetro chave no diagnóstico e prognóstico do cancro 13-17. Mecanismos que contribuem para a regulamentação tamanho nuclear são pouco conhecidos, em parte devido à complexidade e à natureza essencial da estrutura e função nuclear. O método aqui descrito foi desenvolvido como um ensaio in vitro para o tamanho nuclear de escala que é propício à manipulação bioquímica e a elucidação dos mecanismos de regulação tamanho nuclear.
Xenopus laevis extrato de ovo é um sistema bem estabelecido de recapitular e estudar processos celulares complexos em um in vitro </em> Contexto. Esses extratos revelaram novas informações fundamentais sobre vários processos celulares, incluindo a montagem e função do fuso mitótico, retículo endoplasmático, e no núcleo 18-22. Uma vantagem chave do sistema extracto é que X. laevis extratos de ovos representam um citoplasma quase não diluído cuja composição pode ser facilmente alterado, por exemplo, através da adição de proteínas recombinantes ou imunodepleção. Além disso, é capaz de manipular processos essenciais através do emprego de tratamentos que poderiam ser letal num contexto in vivo. Modificações do procedimento de extracto de ovo permitir o isolamento de extratos de X. laevis embriões em vez de ovos, e estes extractos de embriões são igualmente passíveis de manipulação bioquímica 23. Durante X. laevis desenvolvimento, o embrião fertilizado de uma única célula (~ 1 mm de diâmetro) é submetido a uma série de doze divisões celulares rápidas (etapas 1-8) para gerar vários milhares de 50 μm de diâmetro e células menores, chegando a um estágio de desenvolvimento denominado transição midblastula (MBT) ou estágio agosto 24-26. O MBT é caracterizado pelo início da transcrição zigótica, migração celular, divisão celular assíncronos, aquisição de fases de hiato, e estabelecimento de tamanhos de estado estacionário nucleares em vez de expansão nuclear contínuo como no embrião pré-MBT. De estágio 4 a gastrulação (estádios 10,5-12), o volume de núcleos individuais, diminui em mais de 10 vezes 11.
Aqui, o objetivo é identificar os mecanismos responsáveis por estas reduções no tamanho nuclear durante a progressão do desenvolvimento. A abordagem é a primeira a montar núcleos em X. laevis extrato de ovo e isolar os núcleos do citoplasma do ovo / extract. Estes núcleos são então ressuspensas em citoplasma de embriões de fase de gástrula tardia. Após um período de incubação, os núcleos de extracto de ovo tornam-se menores no final de extrato fase de embrião. Nós fundamentado que este woulseria um ensaio útil para a identificação de componentes citoplasmáticos presentes em embriões em estágio final que contribuem para o desenvolvimento de escala de tamanho nuclear. Utilizando este ensaio, juntamente com a validação in vivo, demonstrou que a proteína quinase C (PKC) contribui para a redução do desenvolvimento em tamanho nuclear em X. laevis 23.
Here is presented a novel method to study mechanisms of nuclear size regulation during X. laevis development. Developmental progression is associated with dramatic changes in cell physiology, metabolism, division rates, and migration, as well as alterations in the sizes of cells and intracellular structures. These varied processes are complex and essential, so it is difficult to study just one of these aspects of development in an in vivo setting. The X. laevis embryo extract and nuclear shrink…
The authors have nothing to disclose.
Members of the Levy and Gatlin labs as well as colleagues in the Department of Molecular Biology offered helpful advice and discussions. Rebecca Heald provided support in the early stages of developing this protocol. This work was supported by the NIH/NIGMS (R15GM106318) and the American Cancer Society (RSG-15-035-01-DDC).
Alexa Fluor 568 Donkey anti-mouse IgG | Molecular Probes | A10037 | |
ATP disodium salt | Sigma Aldrich | A2383 | |
Benzocaine | Sigma Aldrich | E1501 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma Aldrich | A3059 | |
CaCl2 | Sigma Aldrich | C3306 | |
Centrifuge | Beckman | J2-21M | |
Centrifuge rotor | Beckman | JS 13.1 | |
chymostatin | Sigma Aldrich | C7268 | |
creatine phosphate disodium | Calbiochem | 2380 | |
cycloheximide | Sigma Aldrich | C6255 | |
cytochalasin D | Sigma Aldrich | C8273 | |
disposable wipes (kimwipes) | Sigma Aldrich | Z188956 | |
L-cysteine | Sigma Aldrich | W326306 | |
EGTA | Sigma Aldrich | E4378 | |
Formaldehyde | Sigma Aldrich | F8775 | |
Glass crystallizing dish (150×75 mm) | VWR | 89090-662 | |
Glycerol | Macron | 5094-16 | |
HEPES | Sigma Aldrich | H4034 | |
Hoechst – bisBenzimide H 33342 trihydrochloride | Sigma Aldrich | B2261 | |
HCG – Human Chorionic Gonadotropin | Prospec | hor-250-c | |
L15 Media | Sigma Aldrich | L4386 | |
leupeptin | Sigma Aldrich | L2884 | |
Lysolecithin | Sigma Aldrich | L1381 | |
mAb414 | Abcam | ab24609 | |
MgCl2 | EMD | MX0045-2 | |
MgSO4 | Sigma Aldrich | M9397 | |
Maltose | Sigma Aldrich | M5885 | |
NP40 | BDH | 56009 | |
Paraformaldehyde | Electron Microscopy Sciences | 15710 | |
Penicillin + Streptomycin | Sigma Aldrich | Pp0781 | |
pepstatin | Sigma Aldrich | P5318 | |
PIPES | Sigma Aldrich | P6757 | |
Plastic paraffin film (parafilm) | Sigma Aldrich | P7793 | |
KCl | Sigma Aldrich | P9541 | |
KH2PO4 | Mallinckrodt | 70100 | |
KOH | Baker | 5 3140 | |
PMSG – Pregnant Mare Serum Gonadotropin | Prospec | hor-272-a | |
NaCl | Sigma Aldrich | S3014 | |
NaHCO3 | Fisher | BP328 | |
NaHPO4 | EMD | SX0720-1 | |
NaOH | EMD | SX0590 | |
Pestle | Thomas Scientific | 3411D56 | |
Round bottom glass tubes, 15 ml | Corex | 8441 | |
Secondary antibody (Alexa Fluor 568 donkey anti-mouse IgG) | ThermoFisher | A10037 | |
sucrose | Calbiochem | 8550 | |
thermal cycler | Bio-Rad | T100 | |
Ultracentrifuge | Beckman | L8-80M | |
Ultracentrifuge rotor | Beckman | SW 50.1 | |
Vectashield (anti-fade mounting medium) | Vector | H-1000 |