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Biology

シロイヌナズナとアブラナ属の毛根の変形と再生

Published: December 22, 2023 doi: 10.3791/66223

Summary

プロトコルは シロイヌナズ ナの第一次花序の茎および Brassicaのnapusの hypocotylsを使用して毛が付いている根の誘導を記述する。毛むくじゃらの根は培養され、トランスジェニック植物を再生するための外植片として使用できます。

Abstract

毛根の形質転換は、さまざまな種の植物バイオテクノロジーのための汎用性の高いツールです。根誘導(Ri)プラスミドを持つアグロバクテリウム株による感染は、Riプラスミドから植物ゲノムへのT-DNAの転写後、創傷部位に毛根の形成を誘導します。プロトコルはBrassicaのnapusのDH12075およびArabidopsisのthaliana Col-0の注入基づかせていた毛根誘導のプロシージャを詳しく記述する。毛むくじゃらの根は、目的の導入遺伝子を分析するために使用したり、トランスジェニック植物の生成のために処理したりすることができます。サイトカイニン 6-ベンジルアミノプリン (5 mg/L) およびオーキシン 1-ナフタレン酢酸 (8 mg/L) を含む再生培地は、両種でシュート形成をうまく誘導します。プロトコルは興味のtransgeneを運ぶ植物を得るために再生剤およびT1植物のgenotypingそして選択をカバーし、RiのプラスミドからのTDNAの自由。複合プラントの形成につながる代替プロセスも描かれています。この場合、毛むくじゃらの根は(自然の根の代わりに)シュートに保持され、植物全体の文脈で毛むくじゃらの根の培養における導入遺伝子の研究が可能になります。

Introduction

植物の形質転換は、植物生物学における遺伝学的研究のボトルネックです。土壌伝染性細菌であるAgrobacterium tumefaciensは、形質転換体を生成するためのフローラルディップまたは組織培養による遺伝子送達の手段として広く使用されています。A. tumefaciensは、創傷部位の植物に感染し、腫瘍誘導(Ti)プラスミドからのT-DNAが宿主植物のゲノムに導入および組み込まれるため、腫瘍を引き起こします。野生型T-DNAを含まない改変Tiプラスミドと、人工T-DNAと目的遺伝子を挿入するためのクローニング部位を有するバイナリーベクターを用いた遺伝子操作型A. tumefaciens株は、効率的な植物形質転換系として一般的に用いられている1。しかし、多くのモデル種や作物は、花の浸漬やin vitroでの植物再生に抵抗性であったり、成長サイクルが長かったりするため、この形質転換システムの効率に影響を与えます。

アグロバクテリウム・リゾゲネス(Agrobacterium rhizogenes)は、宿主植物に感染した後、傷口に不定根(毛根)の形成を誘導します。A. tumefaciensと同様に、A. rhizogenesは、根誘導(Ri)プラスミドから宿主植物のゲノムにT-DNAを転移し、トランスジェニック毛根の発達を引き起こします。このプロセスは、主に根の発がん遺伝子座(rol)によって制御されています2,3根培養は、Riプラスミドと目的の遺伝子をコードする人工バイナリーベクターの両方を持つアグロバクテリア株を使用して、組換えタンパク質の産生、プロモーターまたは遺伝子の機能の解析、またはClustered Regular Interspaced Short Palindromic Repeats(CRISPR)/CRISPR関連タンパク質9(Cas9)4,5,6を使用したゲノムの編集に使用されています。

私たちのプロトコルは、RiプラスミドpRiA4b7を運ぶトランスコンジュガントTi-less A. tumefaciens C58C1を使用します。RiプラスミドのT-DNAは、右と左のT-DNA(それぞれTR-DNAとTL-DNA)の2つの領域で構成されており、これらは独立して植物ゲノムに組み込むことができます8。このシステムを利用して、アブラナ属の品種DH12075の長い外植形質転換プロセスを最適化しました9。以下に詳述されるプロトコルは指定毛が付いている根ラインの再生を可能にし、興味のtransgeneを運ぶそして大体1年のrolの遺伝子の自由のT1植物を得る。注入ベースの毛根形質転換は、シロイヌナズナCol-0の形質転換によって示されるように、他のアブラナ科種で使用できます胚軸は B. napus の形質転換に用いられるが、A. thaliana は一次花序の茎に注入される。

Protocol

1. 培地と溶液の調製

  1. ホルモンストック溶液を調製します。
    1. 濃度5 mg/mLの1-ナフタレン酢酸(NAA)、6-ベンジルアミノプリン(BAP)、およびインドール-3-酪酸(IBA)原液50 mLを調製する場合は、粉末ホルモン250 mgを1 M水酸化ナトリウム(NaOH)2 mLに溶解し、超純水で容量を50 mLに調整します。
    2. 濃度1 mg/mLのジベレリン酸(GA3)50 mLを調製するには、粉末ホルモン50 mgを2 mLのエタノールに溶解し、容量を50 mLの超純水に調整します。
    3. 孔径0.22 μmの滅菌シリンジフィルターを使用して溶液をろ過し、滅菌済み2 mLチューブに分配して保存します。メーカーの推奨に応じて、溶液を-20°Cまたは4°Cで保存してください。
  2. 抗生物質ストック溶液を調製します。濃度100 mg/mLのセフォタキシムおよびチカルシリン二ナトリウム原液50 mLの場合、粉末抗生物質0.5 gを40 mLの超純水に溶解し、最終容量50 mLに調整します。孔径0.22 μmの滅菌シリンジフィルターを使用して溶液をろ過し、滅菌済み2 mLチューブに分配して保存します。溶液を-20°Cで保存します。
    注:抗生物質とホルモン剤は、常に冷却された培地に添加されます。
  3. 1Lのメスシリンダーにバクトトリプトン10g、酵母エキス5g、塩化ナトリウム(NaCl)5gを加えてルリアブロス(LB)培地1Lを調製し、二重蒸留水で容量を1Lに調整します。pHメーターを使用してKOHでpHを7.0に調整します(製造元の指示に従ってください)。溶液を1Lボトルに移し、固形培地が調製されている場合は15gの細菌寒天培地(1.5%)を加え、培地をオートクレーブします。必要に応じて、適切な抗生物質(細菌耐性はバイナリーベクターに運ばれます)を冷却培地に加えます。
    注意: オートクレーブを使用して溶液を滅菌します。ボトルをバスケットに入れ、蓋を閉め、121°C、98.9kPaで20分間殺菌します。このプロトコルは、以降のステップでオートクレーブ溶液に常に使用されます。
  4. 牛肉エキス5g、酵母エキス1g、ペプトン5g、ショ糖5g、塩化マグネシウム(MgCl2)0.5gを混合して、酵母エキスビーフ(YEB)培地1Lを調製します。容量を1Lに調整し、溶液を1Lのボトルに移します。培地をオートクレーブします。
  5. 2重とスクーグ(MS)粉末2.2g、ショ糖(1%)10g、2-(N-モルホリノ)エタンスルホン酸(MES)ナトリウム塩0.5gを二重蒸留水に混合して、種子発芽用培地1Lを調製します。容量を1Lに調整し、混合し、KOHでpHを5.8に調整します。溶液を1Lボトルに移し、8gの植物寒天(0.8%)を加えます。培地をオートクレーブします。
  6. 2.2gのMS粉末、5gのスクロース(0.5%)、および0.5gのMES塩を二重蒸留水に混合して、1Lの植物成長培地を調製します。容量を1Lに調整し、混合し、KOHでpHを5.8に調整します。溶液を1Lボトルに移し、8gの植物寒天(0.8%)を加えます。培地をオートクレーブします。
  7. 4.4 gのMS + B5ビタミン粉末、30 gのスクロース(3%)、および0.5 gのMES塩を二重蒸留水に混合して、1 Lの毛根成長培地を調製します。容量を1Lに調整し、KOHで混合し、pHを5.8に調整し、溶液を1Lのボトルに移します。ゲル化剤3g(0.3%)を加え、培地をオートクレーブします。セフォタキシムとチカルシリン二ナトリウムをそれぞれ100〜200 mg / Lおよび100〜500 mg / Lの最終濃度に添加します。.必要に応じて、適切な抗生物質を添加します(耐性はバイナリーベクターのT-DNAによるものです)。
  8. 2.2gのMS + B5ビタミン粉末、10gのスクロース(1%)、および0.5gのMES塩を二重蒸留水に混合して、1Lの複合植物成長培地を調製します。容量を1Lに調整し、KOHで混合し、pHを5.8に調整し、溶液を1Lのボトルに移します。6gのゲル化剤(0.6%)を加え、培地をオートクレーブします。セフォタキシムとチカルシリン二ナトリウムをそれぞれ200 mg / Lと500 mg / Lの最終濃度に添加します。.必要に応じて、適切な抗生物質を添加します(耐性はバイナリーベクターのT-DNAによるものです)。
  9. 4.4gのMS + B5ビタミン粉末、30gのスクロース(3%)、および0.5gのMES塩を二重蒸留水に混合して、1Lの再生培地を調製します。容量を1Lに調整し、混合し、KOHでpHを5.8に調整します。溶液を1Lボトルに移し、ゲル化剤3g(0.3%)を加えます。培地をオートクレーブします。NAA と BAP をそれぞれ最終濃度 8 mg/L と 5 mg/L に添加し、チカルシリン二ナトリウムを最終濃度 100 mg/L にします。
  10. 4.4gのMS + B5ビタミン粉末、20gのスクロース(2%)、および0.5gのMES塩を二重蒸留水に混合して、1Lのシュート伸長培地を調製します。容量を1Lに調整し、混合し、KOHでpHを5.8に調整します。溶液を1Lのボトルに移し、3gの植物寒天(0.3%)を加えます。培地をオートクレーブします。BAP と GA3 をそれぞれ最終濃度 0.5 mg/L と 0.03 mg/L に添加し、セフォタキシムを最終濃度 100 mg/L にします。
  11. 2.2 gのMS + B5ビタミン粉末、10 gのスクロース(1%)、および0.5 gのMES塩を二重蒸留水に混合して、1 Lの根誘導培地を調製します。容量を1Lに調整し、混合し、KOHでpHを5.8に調整します。溶液を1Lボトルに移し、ゲル化剤3g(0.3%)を加えます。培地をオートクレーブします。IBAとセフォタキシムをそれぞれ0.5 mg / Lと100 mg / Lの最終濃度に添加します。
  12. 20 g の CTAB(2% w/v final)、100 mL の 1M Tris-HCl、pH 8.0(100 mM 最終)、40 mL の 0.5 M EDTA、pH 8.0(20 mM の最終)、81.8 g の NaCl(1.4 M の最終)、5 g の PVP40(0.5% w/v final)を加えて、臭化セチルトリメチルアンモニウム(CTAB)バッファー 1 L を調製します。二重蒸留水で1Lに調整します。溶液をオートクレーブします。溶液を室温で最長1年間保存します。

2. バイナリーベクターによるアグロバクテリウムの形質転換

  1. 植物ゲノムに組み込むT-DNAカセットを含む検証済みのバイナリープラスミドのDNAを調製します。プラスミドDNAには、エレクトロポレーション使用時の電気火花を避けるために、低塩分が含まれていることを確認してください。プラスミドDNA抽出キットの使用を推奨します。
  2. 毛根誘導プラスミドpRiA4bを含むエレクトロコンピテントA58C1細胞を、予熱(28°C)した200 mLの液体と8 mLの新鮮な一晩培養液を接種して調製します。600 nm(OD600)での光学濃度が約0.5(中対数相に相当)になるまで振とうしながら、28°Cで培養液をインキュベートします。所要時間は約4〜5時間です。
  3. アグロバクテリウム培養液を、事前に冷やした4本の滅菌済み50 mL遠心チューブに分けます。3,200 x g、4°Cで15分間遠心分離します。
    注:このステップ以降、セルは冷たく保つ必要があります。
  4. 上清を除去し、ペレットを冷(4°C)2.5 mLの冷(4°C)10%グリセロールに穏やかに再懸濁します。さらに47.5 mLの冷たい10%グリセロールを加え、穏やかに混合します。
  5. 細胞を3,200 x g で4°Cで15分間ペレット化します。 上清を廃棄し、細胞を(4x)10 mLの冷たい10%グリセロールに再懸濁します。
  6. 細胞を再度ペレット化し、0.75 mLの冷たい10%グリセロールに(4x)再懸濁します。4 本のチューブすべての内容物を 1 本にプールします(総量 = 3 mL)。
  7. アグロバクテリア溶液を50 μLのアリコートに分け、事前に冷やした滅菌済みの1.5 mLマイクロチューブに入れます。アリコートをドライアイスまたは液体窒素で凍結します。チューブは、将来の使用のために-80°Cで保管してください。
  8. コンピテントセルチューブ1本(50 μL)を氷上に置き、プラスミドDNA(ステップ2.1から合計1 μg)5 μLと混合し、エレクトロポレーションキュベット(0.2 cmのギャップ)に移し、氷上で5分間インキュベートします。
  9. キュベットをエレクトロポレーターに入れ、静電容量25μFD、抵抗400 Ω、電圧2.5kV、パルス幅9.7msの設定でセルをエレクトロポレーションします。
  10. 950 μLのLB液体培地を細胞に加え、サーモミキサーで28°C、300rpmで2時間培養します。細胞培養物50 μLを、適切な選択的抗生物質を含む固体LB培地に播種します。プレートを28°Cで2日間培養します。
    注:適切な培養量を決定し、細菌の異常増殖を避けるために、プレートごとにさまざまな細胞培養(10 μL - 100 μL)をプレーティングすることをお勧めします。
  11. 抗生物質を含む5 mLのLB液体培地で、選択したいくつかのコロニーから液体培養物を調製します。28°Cで一晩振とうしながらバクテリアを増殖させます。0.5 mLの液体細菌培養物と0.5 mLの40%グリセロールを混合して、これらの培養物をグリセロールストックに使用します。
    注:これらのコロニーは、コロニーPCRによって導入遺伝子の存在について検証されます。この目的のために、プレートから少量のコロニーを、バイナリーベクターからT-DNAの一部を増幅するプライマーとともに、選択したバッファー、dNTP、およびTaqポリメラーゼを含むPCRマスターミックスに添加します。グリセロールストックからの接種物は、植物の形質転換に使用されます。

3. アブラナ属の毛根形質転換 DH12075

  1. アブラナ属の種子をマイクロチューブに入れDH12075フローボックスで滅菌します。まず、水と0.1%洗剤を使用して、60秒間振とうしながら種子を脱脂します。次に、種子を水で洗い流し、続いて70%エタノールで60秒間すすぎます。
  2. 次亜塩素酸ナトリウムを含む市販の漂白剤の10%溶液を使用して種子を殺菌します。この溶液で種子を20分間振る。
  3. 種子を滅菌水で4回ずつ60秒間洗浄します。種子発芽培地を含むペトリ皿に置きます。種子を4°Cで一晩低温成層し、プレートを栽培室(21°C、16時間明/8時間暗)に移します。
  4. 生後5日の苗を植物成長培地が入った植物培養ボックスに移します。
    注:DH12075における最高の形質転換効率は、生後18日の苗木で特定されました。苗の年齢は、地域の生育条件や他の品種に合わせて最適化することができます。
  5. 毛むくじゃらの根誘導プラスミドpRiA4bと形質転換用バイナリーベクター(ステップ2.11から)を担持したAgrobacterium tumefaciens C58C1の液体培養液に接種ループを接種します。5 mL の LB 培地を使用します。この培養液を28°Cで一晩、OD600 = 0.9 - 1になるまで増殖させます。
    注: Ri プラスミドのみを含むアグロバクテリウムは、野生型の毛根が生成される場合に使用されます。
  6. 少量(約50μL)をインスリン注射器とともに、生後18日齢の胚軸に注入します(ステップ3.4から)。培地の表面から約1cm上のシリンジに取り付けられた26Gの針で胚軸に穿刺します。.傷口に液体を注入します。胚軸の表面の組織も注射器で引っ掻くことができます。
    注:接種する苗木の数は、実験者のニーズに合わせる必要があります。
  7. 植物を21°Cの栽培室に2〜4週間戻し、傷口にカルスと毛根が形成されるまで加熱します。
  8. 胚軸から毛根が出てきたカルスを切り取り、選択的抗生物質(T-DNAが運搬)とセフォタキシム(200 mg/L)とチカルシリン(500 mg/L)を含む毛根成長培地を入れたペトリ皿に置き、アグロバクテリアの増殖を抑制します。ペトリ皿をガス透過性テープで密封します。毛むくじゃらの根を暗所で24°Cで培養します。
    注:機能選択に使用される特定の抗生物質の適切な濃度は、野生型の毛根でテストする必要があります。カナマイシンに対する耐性を持つ毛むくじゃらの根DH12075 B. napus には、25 mg/L の濃度のカナマイシンが使用されます。
    注:この工程では、野生型シュートと、そのような植物の成長を支持するトランスジェニック毛根からなる複合植物体を生成することができる。茎から毛むくじゃらの根を切り落とす代わりに、植物の本来の根を取り除きます。毛むくじゃらの根が出現した植物は、アグロバクテリアの増殖を抑制するセフォタキシム(200 mg/L)とチカルシリン(500 mg/L)を含む複合植物成長培地と、選択的抗生物質(T-DNAによって運ばれる)を含む植物培養ボックスに移されます。
  9. 1〜2週間後、ペトリ皿の毛むくじゃらの根をカルスから分離し、同じ培地でプレート上で個別化します。4〜5週間ごとに培養液を新しいプレートに移します。0.25 mg/L IBAを添加して、根の分岐を増やします。
  10. 各転写でセフォタキシムとチカルシリンの濃度を100 mg / Lずつ徐々に減らします(つまり、最初の転写の培地には100 mg / Lのセフォタキシムと400 mg / Lのチカルシリンが含まれ、2回目の転写には300 mg / Lのチカルシリンなどが含まれています)。3〜4ヶ月後、100 mg / Lのチカルシリンと選択的抗生物質を使用して、毛むくじゃらの根の成長培地で毛むくじゃらの根を培養します。

4. 毛むくじゃらの根DH12075アブラナ属の再生

  1. ピンセットを使用して無菌状態で再生培地のあるプレートに独立した毛根を移し、使用前に炎上させます。ペトリ皿ごとに5〜10本の根を移し、21°Cで長日日長(16時間の明/8時間の暗)で培養します。ペトリ皿をガス透過性テープで密封します。
  2. 3〜4週間ごとに、毛むくじゃらの根を新鮮な再生培地でプレートに移します。カリは約2週間後に形成されることに注意してください。カルスは、カルス形成後8〜9週間まで、さらに2週間後に撮影を開始します。
  3. 新芽を個別化し、新芽伸長培地を入れた植物培養ボックスに2〜3週間移し、新芽の伸長を促進します。
  4. 細長いシュートを根誘導培地で植物培養ボックスに移します。3〜4週間ごとに文化を更新します。DH12075の発根効率は、30日で87%、60日後には最大100%です。
  5. 真菌感染を防ぐために、ゲル化剤の痕跡を取り除いた後、根付いた植物を土壌に移します。植物を最初にファイトトロン(21°C、長日日長、150μE)に順応させ、次に開花のために温室に移します(21°C/18°C、長日日長、150μE)。

5. 再生剤とT1植物の選択

注:毛むくじゃらの根元は、再生プロセスに入る前に選択できます。選択の種類は、導入遺伝子によって運ばれる内容によって異なります。毛むくじゃらの根は、DNA抽出とジェノタイピングまたは突然変異検出、RNA抽出とその後のcDNA合成、RT-qPCRによる選択した遺伝子の発現レベル分析、蛍光検出のための顕微鏡検査、またはGUS染色のための処理のためにサンプリングできます。

  1. 土壌に移した後、T0再生植物(およびT1苗木)を再度遺伝子型決定して、選択手順からの脱出を回避します。T0植物は、Ri表現型と呼ばれる変化した表現型を示します:植物ゲノムに挿入された Ri プラスミドのTLおよび/またはTR-DNAの存在によって引き起こされる広範な根の成長、巻き毛の葉、および矮性シュート。
  2. T1の選択をスピードアップするには、T0再生植物の緑色の成熟胚を含む種子(魚雷胚以上の場合は受粉後約21〜28日)をDH12075して胚の救助に使用します。
    1. 滅菌フローボックスで作業します。珪石を回収し、70%エタノールで表面殺菌します。
    2. プレートの蓋またはスライドにテープで貼り付けた両面テープの上に置きます。
    3. 実体双眼鏡を使用して、26G針を使用して弁の縁に沿って珪片をスリットします。切り口が種子を傷つけないようにしてください。握りやすいように、ニードルを1 mLのシリンジに取り付けます。
    4. 心皮を開き、テープに貼り付けます。未熟な種子を集め、種子発芽用の培地を入れたプレートに移します。プレートをガス透過性テープで密封します。
    5. 発芽するまで培養室(21°C、明度16時間/暗度8時間)にプレートを置きます。
  3. T1苗木の遺伝子型を決定し、目的の導入遺伝子の存在と Ri TR/TLの不在を確認します(図1)。葉の材料を収集し、選択した方法を使用してそれらのDNAを抽出します。CTABメソッドについては、以下で説明します。
    1. 2つのセラミックビーズが入った2 mLのマイクロチューブに葉の材料を回収します。チューブを液体窒素で凍結します。
    2. ボールミルで材料を粉砕します。或いは、乳棒及び乳鉢を用いてもよい。
    3. 素早くスピンダウンした後、400 μLのCTABバッファーを粉末に添加します。短時間ボルテックスし、スピンダウンし、60°Cで少なくとも50分間インキュベートします。
    4. 溶液を室温まで15分間冷却します。クロロホルムを1体分加え、穏やかに混ぜます。
      注意: クロロホルムを使用するときは、薬液の流れの下で作業し、保護のために手袋を使用してください。クロロホルムを含む溶液は、適切なゴミ箱に廃棄する必要があります。
    5. 卓上遠心分離機を使用して、18,400 x g で5分間遠心分離します。250〜350μLの上層水相を新しいマイクロチューブに移します。間相を省略します。
    6. 1容量のイソプロパノールを加え、よく混合し、室温で5分間インキュベートします。18,400 x gで40分間遠心分離します。
    7. 液体を捨て、200μLの70%エタノールを加えます。ペレットを洗浄し、18,400 x gで15分間遠心分離します。
    8. 液体を捨てます。ペレットを風乾し、50〜100μLの超純水を加えます。DNAを冷蔵庫で1時間から一晩溶かします。
  4. rolA遺伝子(TL)、aux1遺伝子(TR)、およびvirC遺伝子座(Agrobacterium)のPCRによるジェノタイピングを行います。調製したDNA(ステップ5.3で作成)、プライマー、バッファー、dNTP、およびTaqポリメラーゼを使用して、メーカーのプロトコルに従ってPCR反応を調製します。増幅された断片の長さは200〜500bpです。
    rolAに特異的なプライマー:
    フォワード: GTTAGGCGTGCAAAGGCCAAG
    裏面:TGCGTATTAATCCCGTAGGTC
    aux1に特異的なプライマー:
    フォワード: CATAGGATCGCCTCACAGGT
    リバース:CGTTGCTTGATGTCAGGAGA
    virCに特異的なプライマー:
    フォワード: AATGCGTCTCTCTCGTGCAT
    裏面:AAACCGACCACTAACGCGAT
    注:T-DNAの転移と統合は部分的であり、TLおよび/またはTRの一部のみがゲノムに組み込まれる可能性があります。したがって、T1苗木におけるTL( rolB rolCなど)やTR(aux2mas1ags1)の他のORFの存在を分析することが推奨されます。これらの遺伝子座に特異的なプライマー配列は、Jedličková et al.9にリストされている。
  5. ゲル電気泳動によるPCR反応の評価
    注:PCRグレードのDNAを確実に取得するために、この分析にポジティブコントロールを含めることをお勧めします。
  6. 導入遺伝子の有無は、この導入遺伝子の内容に基づいてプロトコルに従って選択します。
  7. 選択した苗木を土に移します。

6. シロイヌナズナCol-0の毛根の形質転換と再生

  1. A. thalianaの種子は、任意の方法(漂白剤、エタノール、または塩素ガス)で表面殺菌します。
  2. 種子の発芽のために培地に滅菌種子をプレーティングします。2日間の低温成層後、プレートを培養室(21°C、長日長、湿度50%)に移します。
  3. 生後1週間の苗木を植物成長培地の入った植物培養ボックスに移します。
  4. ステップ3.5に示すようにア グロバクテリウム 培養物を調製します。
  5. 生後1ヶ月の シロイヌナズナ 植物の一次花序茎の基部(ロゼットから約1〜2cm上)のインスリン注射器に取り付けた針で少量の培養液(約50μL)を注入します。一次ステムの表面の組織もシリンジで引っ掻くことができます。
  6. 注入後2〜4週間で、出現する毛根を切除し、選択的抗生物質(T-DNAによって運ばれる)とセフォタキシム(200 mg / L)とチカルシリン(500 mg / L)を添加した毛根成長培地を使用してペトリ皿で栽培し、アグロバクテリアの増殖を抑制します。プレートを暗所で24°Cでインキュベートします。
  7. 1〜2週間後、同じ培地でプレート上の毛根を個別化します。選択した毛むくじゃらの根を4〜5週間ごとに新鮮な培地に移します。
    注: A. thaliana の毛根は B. napus の根よりも細いため、新鮮な培地に移す場合は注意が必要です。
  8. 毛むくじゃらの根を再生培地でプレートに移し、カルスの形成を誘導します。プレートを21°Cで長日日長(16時間明るい/8時間暗い)で培養します。
  9. 新芽は、栽培の18〜21日後にカルスから出てきます。芽を切り取り、2〜3週間芽伸長培地に移して、成長と伸長を促進します。
  10. 細長いシュートを根誘導培地に移します。
  11. 根付いた植物を土に移します。T0植物もRi表現型を示します。 B. napus DH12075(ステップ5)について説明したように、トランスジェニック選択を行います。

Representative Results

私達は前に Brassica napusの3つの品種、即ちDH12075、Topas DH4079およびWestar9の注入基づかせていた毛根の誘導のためのプロトコルを最大限に活用した。この形質転換プロトコルをモデル種A . thalianaに適用するために、生後1ヶ月の植物体の一次花序茎にアグロバクテリア接種を注入しました。毛むくじゃらの根は、2〜4週間後に注射部位に現れました。毛むくじゃらの根を切除し、固体培地で栽培した。これら 2 つの種における方法の比較を 図 1 に示します。

選択された毛状根線を再生培地に移し、シュート形成を誘導した。 A. thalianaでは、試験した10本の毛根系統すべてで14日以内に黄色いカリが誘導されました。濃い緑色の斑点として見える最初のシュート原基は、再生培地に移行してから3週間以内に現れました(図2)。4週間の培養後、新芽は10本の毛根線のうち9本の毛根を覆った(再生効率90%)。いくつかのケースでは、カルスから不定根が誘発されました(図2H)。1本のラインは、再生培地で3ヶ月経っても再生しませんでした(4週間ごとに、毛根を新しい培地に移しました)。したがって、 A. thaliana の毛むくじゃらの根の再生効率は、 B. napus DH120759の効率に類似している。

B. napusA. thalianaの毛根再生剤は矮性表現型(図3)を示し、毛根由来植物の典型的な特徴である2。また、密集した根系、しわの寄った葉、開花時期の変化も観察しました。このいわゆる毛根(またはRi)表現型は、植物ゲノムに挿入されたRiプラスミドからのrol遺伝子によって引き起こされます。バイナリベクター上にコードされたRi T−DNAおよび導入遺伝子の挿入は、独立していてもよく、連結されていてもよい。したがって、自家受粉によって作製されたT1子孫の分離分析は、目的の導入遺伝子を発現するロールフリー植物の同定に役立ちます。T1植物のジェノタイピングは、TLおよびTRのORFおよび目的の導入遺伝子に特異的なPCRプライマーによって行われます。アグロバクテリア汚染の不在は、virCプライマーのPCR産物の不在によって検証されます(図1)。

Figure 1
図1: A. thalianaB. napusの手順の概要。 胚軸または一次花序の茎に アグロバクテリウム 菌を注入すると、毛根の発達が誘発されます。毛むくじゃらの根は、在来の根に取って代わって、遺伝子型決定および分析される複合植物を生成することができます(青い矢印)。培養された毛根は、T0植物に再生され、T1植物で繁殖し、遺伝子型決定することができます(緑の矢印)。毛むくじゃらの根は、機能分析のために継代培養することもできます(黒矢印)。ジェノタイピングの結果の例を紹介します。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

Figure 2
図2: A. thalianaの毛根の再生。 (A)プレートへの移し替えから1日後の毛根培養。(B、C)Calliは、再生培地で培養してから2週間以内に発症しました。(D、E)シュート原基は、培養の3週間後に出現しました。(G、H)芽は4週間後に形成されます。(H)カルスから発達した不定根。(C、F、I)再生しない毛むくじゃらの根線。スケールバーは 1 cm を表します。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

Figure 3
図3:野生型植物 B.napusA.thaliana の代表的な写真と毛根由来の再生剤(T0植物)。 再生剤のRi表現型に注意してください。スケールバーは 2 cm を表します。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

Discussion

我々は、B. napusA. thalianaの毛根の形質転換とその後の再生のための簡単なプロトコルを開発しました。このプロセスには、胚軸(B. napus)または一次花序茎(A. thaliana)への注射ベースの毛根誘導が含まれます。軸にRiプラスミドを保有するアグロバクテリアC58C1株を注入する方法は、本研究で紹介したアブラナ科のほか、マメ科10,11でも有効であった。

注入ベースの方法の代替として、外植片を細菌懸濁液に浸漬し、その後外植片をアグロバクテリアと共培養する浸漬ベースの形質転換があります。浸漬法に対する注入ベースの方法の利点は、外植片の準備、共培養時間のテスト、および毛むくじゃらの根を誘導するためのホルモンを含む培地での培養など、いくつかのプロトコルステップがないために時間を節約できることです。どちらのアプローチも毛根誘導に有効であるが、植片浸漬法と比較して、注入ベースの方法ではより高い形質転換効率が観察された12,13。さらに、注入ベースの形質転換は、複合植物(トランスジェニック毛根および野生型シュート)の生成にも有用である。形質転換した植物の元の根を切り取った後、毛むくじゃらの根が植物の成長を支え、導入遺伝子を植物全体の文脈で研究することができます。

毛根誘導の重要なステップは、胚軸、または一次花序の茎に接種物を注入することです。 B. napus の胚軸は壊れやすく、胚軸全体を切断することは容易に起こり得る。 A. thaliana でも、花序の茎が細いため、同じことが観察されます。異なる種/品種の形質転換効率の比較が必要な場合は、植物を注入する際の操作とスキルによって引き起こされるエラーを回避するために、1人ですべての実験を行うことをお勧めします。

我々は、B. napus DH12075 と A. thaliana Col-0 の毛根再生に有効なプロトコールを開発しました。再生は非常に可変的なプロセスであるため、選択した種または品種にいくつかのプロトコルの変更を適用することができます。例えば、毛根由来の苗条は、B. oleraceaの異なるオーキシン/サイトカイニン比(1:1)によって誘発され得る14。或いは、サイトカイニンチジアズロンをBAPの代わりに用いることができる、例えば、B. campestris毛根15の場合などである。

植物ゲノムへの Ri プラスミドT-DNAの複数回の挿入は、毛根の形質転換および再生システムの潜在的な限界を表しています。そのような場合、 T1 苗木の分離分析後にRiプラスミド由来のTL/TRを含まない植物は発見されません。したがって、導入遺伝子ごとにいくつかの独立した毛根線を生成することをお勧めします。

毛根培養は、主にその迅速な確立と安価なメンテナンス(培地にホルモンを必要としない)のために、遺伝子機能研究のための非常に強力なツールです。このプロトコルはB .のnapus およびA .のthalianaの毛の根の誘導そして再生のための方法をカバーします、複合植物を使用して全植物において、またはtransgenic植物の再生の後で毛が生えている根文化の興味のtransgeneを直接調査するのに使用することができる。

Disclosures

著者らは、この研究は、潜在的な利益相反と解釈される可能性のある商業的または金銭的関係なしに実施されたと宣言しています。

Acknowledgments

我々は、アグロバクテリア株を提供してくれたJiří Macas(Biology Centre CAS, České Budějovice, Czech Republic)に感謝する。CEITEC MUのコアファシリティプラントサイエンスは、その技術サポートで認められています。この作品は、チェコ共和国教育・青年・スポーツ省の欧州地域開発基金プロジェクト「SINGING PLANT」(no.CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_026/0008446)およびINTER-COSTプロジェクトLTC20004。

Materials

Name Company Catalog Number Comments
1.50 mL tubes Eppendorf 125.215
10% solution of commercial bleach  SAVO
1-naphthaleneacetic acid (NAA)  Duchefa N0903 Callus regeneration medium
2.0 mL tubes Eppendorf 108.132/108.078
3M micropore tape Micropore
6-Benzylaminopurine (BAP)  Duchefa B0904 Callus regeneration medium, Shoot elongation medium 
70% ethanol
bacteriological agar HiMedia RM201 LB medium
Bacteriological peptone Oxoid LP0037 LB and YEB media
Beef extract Roth X975.1 YEB medium
Bottles DURAN L300025
Cefotaxime sodium Duchefa C0111 Hairy root growing medium, Callus regeneration medium, Shoot elongation medium, Root induction medium
chloroform Serva 3955301
CTAB Hexadecyltrimethylammonium bromide Sigma 52365
dNTP mix Thermo Fisher Scientific R0193
EDTA - Titriplex III, (Ethylenendinitrilo)tetraacetic Acid, Disodium Salt, Dihydrate Sigma ES134-250G
elctroporation cuvette
electrophesis agar, peqGOLD universal VWR 732-2789
electrophoresis chamber BIO-RAD
electrophoresis gel reader BIO-RAD
electroporator GenePulser Xcell BIO-RAD
ethidium bromide AppliChem
Gene Pulser/MicroPulser electroporation cuvettes, 0.2 cm gap BIO-RAD 1652082
Gene Ruler DNA ladder mix Thermo Fisher Scientific SM0331
Gibberellic acid (GA3) Duchefa G0907 Shoot elongation medium 
glycerol Sigma G5516-1L
HEPES (2-(4-(2-hydroxyethyl)-1-pirerazinyl)-ethansulfonique Merck 1101100250
indole-3-butyric acid (IBA) Duchefa I0902 Root induction medium
kanamycin monosulfate Duchefa K0126
Magenta GA-7 Plant Culture Box w/ Lid Plant Media V8505-100
Measuring cylinder
MES monohydrate Duchefa M1503 Hairy root growing medium, Callus regeneration medium, Shoot elongation medium, Root induction medium, Medium for germination, Plant growing medium
Murashige and Skoog medium (MS) Duchefa M0237 Medium for germination, Plant growing medium
Murashige and Skoog medium (MS) + B5 vitamins  Duchefa M0231 Hairy root growing medium, Callus regeneration medium, Shoot elongation medium, Root induction medium
needle Agani 26G x 1/2 - 0.45 x 13mm Terumo
pH meter
Phytagel Sigma P8169 Callus regeneration medium, Root induction medium, Medium for germination
PVP 40 (polyvinylpyrolidone Mr 40000) Sigma 9003-39-8
Redtaq DNA Polymerase,Taq for routine PCR with inert dye, 10X buffer included Sigma D4309-250UN
Retsh mill Qiagen
sodium chloride Lachner 30093-APO LB medium
square Petri Dishes Corning GOSSBP124-05
sucrose Penta 24970-31000 Hairy root growing medium, Callus regeneration medium, Shoot elongation medium, Root induction medium, Medium for germination, Plant growing medium
Syringe filter Carl Roth P666.1 Rotylabo syringe filters 0.22 µm pore size
thermomixer Eppendorf
Ticarcillin disodium Duchefa T0180 Hairy root growing medium
Tris(hydroxymethyl)aminomethan Serva 3719003
ultrapure water Millipore Milli-Q purified water 
Yeast extract Duchefa Y1333 LB medium

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References

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生物学、第202号、
<em>シロイヌナズ</em>ナと<em>アブラナ</em>属の毛根の変形と再生
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Jedličková, V.,More

Jedličková, V., Štefková, M., Sedláček, M., Panzarová, K., Robert, H. S. Hairy Root Transformation and Regeneration in Arabidopsis thaliana and Brassica napus. J. Vis. Exp. (202), e66223, doi:10.3791/66223 (2023).

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