JoVE
JoVE
Faculty Resource Center
Research
Behavior
Biochemistry
Biology
Bioengineering
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
Engineering
Environment
Genetics
Immunology and Infection
Medicine
Neuroscience
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
JoVE Chrome Extension
Education
Biology
Chemistry
Clinical
Engineering
Environmental Sciences
Pharmacology
Physics
Psychology
Statistics
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
JoVE Quiz
JoVE Business
Videos Mapped to your Course
Authors
Librarians
High Schools
About
Sign-In
Sign In
Contact Us
Research
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Education
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
High Schools
EN
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
EN
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
Close
Research
Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
Engineering
Environment
Genetics
Immunology and Infection
Medicine
Neuroscience
Products
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Education
Biology
Chemistry
Clinical
Engineering
Environmental Sciences
Pharmacology
Physics
Psychology
Statistics
Products
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
JoVE Quiz
JoVE Business
Videos Mapped to Your Course
Teacher Resources
Get in Touch
Instant Trial
Log In
EN
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
Journal
/
Genetics
/
ה-RNA רצף הדור הבא וצינור ביואינפורמטיקה לזיהוי קו מבוטא-1s ברמה הספציפית לוקוס
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal
Genetics
RNA Next-Generation Sequencing and a Bioinformatics Pipeline to Identify Expressed LINE-1s at the Locus-Specific Level
Please note that all translations are automatically generated.
Click here for the English version.
ה-RNA רצף הדור הבא וצינור ביואינפורמטיקה לזיהוי קו מבוטא-1s ברמה הספציפית לוקוס
DOI:
10.3791/59771-v
•
11:04 min
•
May 19, 2019
•
Tiffany Kaul
,
Maria E. Morales
,
Emily Smither
,
Melody Baddoo
2
,
Victoria P. Belancio
3
,
Prescott Deininger
4
1
Tulane Cancer Center
,
Tulane University
,
2
Department of Pathology
,
Tulane University
,
3
Department of Structural and Cellular Biology
,
Tulane University
,
4
Department of Epidemiology
,
Tulane University
Chapters
00:04
Title
00:52
Read Alignment Pipeline to Identify Expressed L1s
02:48
Manual Curation
07:48
Assess Mappability of Each L1 Loci to Factor in a Transcription Level Correction Score
08:42
Results: Identification of Full-length L1 Retroelements in the Human Prostate Tumor Cell Line, DU145
10:01
Conclusion
Summary
Automatic Translation
English (Original)
العربية (Arabic)
中文 (Chinese)
Nederlands (Dutch)
français (French)
Deutsch (German)
עברית (Hebrew)
italiano (Italian)
日本語 (Japanese)
한국어 (Korean)
português (Portuguese)
русский (Russian)
español (Spanish)
Türkçe (Turkish)
Automatic Translation
כאן, אנו מציגים גישה ביולוגית ואנליזות כדי לזהות את הביטוי LINE-1 ברמה מסוימת.
Tags
RNA-sequencing
Next-generation Sequencing
Bioinformatics Pipeline
LINE-1
Mobile Elements
Genetic Instability
L1 Transcripts
Cytoplasmic RNA
Polyadenylated Transcripts
Alignment Strategy
Strand Separation
Read Counts
L1 Loci
Article
Embed
ADD TO PLAYLIST
Usage Statistics
Related Videos
איתור של שינוי מספר העתקה באמצעות רצף תא יחיד
מיטוב וניתוח השוואתי של הצמח DNA Organnelar העשרה שיטות מתאים עבור הדור הבא רצף
ממוקד הדור הבא רצפי וכן ביואינפורמטיקה צינור להעריך גורמים גנטיים של המחלה החוקתי
הליך RNA הנפתח כדי לזהות מטרות RNA לונג ללא קידוד RNA
הגברה של יד באורך מלא הפרו-וירוס HIV-1 עבור הדור הבא רצפי
זיהוי תפוקה גבוהה של ג'ין רצפים תקינה באמצעות רצף הדור הבא של כרומוזום מעגלי קונפורמציה ללכוד (4C-seq)
מסכי אחד-היברידית משופרת שמרים לזהות גורם שעתוק מחייב את רצפי דנ א אנושי
סיור במרחב הרצף כדי לזהות אתרי כריכה עבור חלבונים כריכת רנ א תקינה
צינור ביואינפורמטיקה לנתח באופן מדויק ויעיל את המייקרואורפה בצמחים
צינור מלא לבידוד ולרצף של מיקרו-משתמשים וניתוחם באמצעות כלי קוד פתוח
Read Article