Journal
/
Cancer Research
/
التنميط المكاني للبروتين وتعبير الحمض النووي الريبي في الأنسجة: نهج لضبط التشريح المجهري الافتراضي
JoVE Journal
Cancer Research
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Cancer Research
Spatial Profiling of Protein and RNA Expression in Tissue: An Approach to Fine-Tune Virtual Microdissection
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

التنميط المكاني للبروتين وتعبير الحمض النووي الريبي في الأنسجة: نهج لضبط التشريح المجهري الافتراضي

DOI:
10.3791/62651-v

•

09:19 min

•

July 06, 2022

•

, , , , ,
1Department of Pathology,Genentech, 2Department of Microchemistry, Proteomics, Lipidomics & Next Generation Sequencing (MPL-NGS),Genentech, 3NanoString Technologies

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:44Automated Visualization Protocol for Spatial Proteomics Assays
  • 06:02Spatial Profiling Platform Protocol for Proteomics Assay
  • 06:47ROI Selection for Spatial Transcriptomics Assays
  • 07:10Results: Application of the Automated TSA Based Visualization Protocol in Combination with Spatial Proteomics Assays and Detection of Small ROIs in the Spatial Transcriptomics Protocol
  • 08:47Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

هنا ، نصف بروتوكولا لضبط مناطق الاهتمام (ROIs) لتقنيات Spatial Omics لتوصيف البيئة المكروية للورم بشكل أفضل وتحديد مجموعات خلايا معينة. بالنسبة لفحوصات البروتينات ، يمكن للبروتوكولات المخصصة الآلية توجيه اختيار عائد الاستثمار ، بينما يمكن ضبط فحوصات النسخ باستخدام عائد استثمار صغير يصل إلى 50 ميكرومتر.

Tags

Spatial ProfilingProtein ExpressionRNA ExpressionVirtual MicrodissectionProteomicsTranscriptomicsAutomated ProtocolRegion Of Interest (ROI) SelectionFluorescent Visualization AntibodiesAutostainerDeparaffinizationCell ConditioningAntibody IncubationHRP BlockerMultimer HRP ReagentAntibody Denaturation

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/62651?article_type=v&slug=spatial-profiling-protein-rna-expression-tissue-an-approach-to-fine

ال<em> ذبابة الفاكهة</em> تخيلي ورم القرص نموذج: التصور والكمي للالتعبير الجيني وغزو الورم عن طريق الفسيفساء الوراثية
check_url/62651?article_type=v&slug=spatial-profiling-protein-rna-expression-tissue-an-approach-to-fine

باستخدام الحمض النووي الريبي لكشف التسلسل رواية لصق المتغيرات ذات الصلة لمقاومة المخدرات في<em> في المختبر</em> نماذج السرطان
check_url/62651?article_type=v&slug=spatial-profiling-protein-rna-expression-tissue-an-approach-to-fine

تحديد مستوى التعبير البروتين في الخلايا المستزرعة إيمونوسيتوتشيميستري في كتل الخلايا جزءا لا يتجزأ من البارافين
check_url/62651?article_type=v&slug=spatial-profiling-protein-rna-expression-tissue-an-approach-to-fine

التحكم المكاني والزماني للبدء من الميلانوما من الخلايا الجذعية المتحولة للخلايا الصباغية
check_url/62651?article_type=v&slug=spatial-profiling-protein-rna-expression-tissue-an-approach-to-fine

في المختبر الاختبار لدراسة التفاعل الورم الضامة
check_url/62651?article_type=v&slug=spatial-profiling-protein-rna-expression-tissue-an-approach-to-fine

التنميط الخلوي عالي الإنتاجية لمركبات تحلل البروتين المستهدفة باستخدام خطوط خلايا HiBiT CRISPR
check_url/62651?article_type=v&slug=spatial-profiling-protein-rna-expression-tissue-an-approach-to-fine

ثلاث طرق لتحليل التعبير التفاضلي لتسلسل الحمض النووي الريبي: ليما، إيدج آر، DESeq2
check_url/62651?article_type=v&slug=spatial-profiling-protein-rna-expression-tissue-an-approach-to-fine

حساسية التنميط للعلاجات المستهدفة في المواد العضوية المشتقة من المريض NSCLC المتحورة EGFR
check_url/62651?article_type=v&slug=spatial-profiling-protein-rna-expression-tissue-an-approach-to-fine

التنميط المكاني الرقمي لتوصيف البيئة المكروية في الورم الدبقي المتسلل بشكل منتشر من النوع البالغ
check_url/62651?article_type=v&slug=spatial-profiling-protein-rna-expression-tissue-an-approach-to-fine

توليد وتصوير الفئران والكائنات العضوية الظهارية البشرية من الأنسجة الثديية الطبيعية والأورام دون المرور

Read Article