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Profilazione spaziale dell'espressione di proteine e RNA nei tessuti: un approccio alla messa a punto della microdissezione virtuale
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Spatial Profiling of Protein and RNA Expression in Tissue: An Approach to Fine-Tune Virtual Microdissection
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Profilazione spaziale dell'espressione di proteine e RNA nei tessuti: un approccio alla messa a punto della microdissezione virtuale

DOI:
10.3791/62651-v

•

09:19 min

•

July 06, 2022

•

, , , , ,
1Department of Pathology,Genentech, 2Department of Microchemistry, Proteomics, Lipidomics & Next Generation Sequencing (MPL-NGS),Genentech, 3NanoString Technologies

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:44Automated Visualization Protocol for Spatial Proteomics Assays
  • 06:02Spatial Profiling Platform Protocol for Proteomics Assay
  • 06:47ROI Selection for Spatial Transcriptomics Assays
  • 07:10Results: Application of the Automated TSA Based Visualization Protocol in Combination with Spatial Proteomics Assays and Detection of Small ROIs in the Spatial Transcriptomics Protocol
  • 08:47Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Qui, descriviamo un protocollo per la messa a punto delle regioni di interesse (ROI) per le tecnologie di omiche spaziali per caratterizzare meglio il microambiente tumorale e identificare specifiche popolazioni cellulari. Per i saggi di proteomica, i protocolli personalizzati automatizzati possono guidare la selezione del ROI, mentre i saggi di trascrittomica possono essere ottimizzati utilizzando ROI di soli 50 μm.

Tags

Spatial ProfilingProtein ExpressionRNA ExpressionVirtual MicrodissectionProteomicsTranscriptomicsAutomated ProtocolRegion Of Interest (ROI) SelectionFluorescent Visualization AntibodiesAutostainerDeparaffinizationCell ConditioningAntibody IncubationHRP BlockerMultimer HRP ReagentAntibody Denaturation

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